| Base Pair (22 : 428) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 11.1 | -- | -- | -- | 20.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 33.3 | 35.2 | -- | -- | -- | 54 |
| B | 15.9 | -- | -- | -- | 43.2* | 2.3* | -- | -- | -- | -- | -- | 2.3 | 22.7 | 9.1 | -- | -- | 4.5 | 44 |
| C | 35.0 | -- | -- | -- | 24.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 6.6 | 25.7 | -- | -- | 8.7 | 183 |
| Z | 5.6 | -- | -- | -- | 66.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 27.8 | 36 |
| D | 14.3 | -- | -- | -- | 14.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 7.1 | -- | -- | -- | 64.3 | 14 |
| E | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 37.1 | 57.1 | -- | -- | 2.9 | 35 |
| U | 35.3* | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | 5.9 | 5.9* | -- | -- | -- | -- | 35.3 | -- | 5.9* | 5.9 | 17 |
| Base Pair (23 : 427) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 7.4 | 7.4 | 1.9 | 5.6 | 3.7 | 1.9 | -- | -- | 7.4* | 7.4 | 7.4 | -- | 1.9* | 16.7 | 31.5* | -- | 54 |
| B | 2.1 | 4.3 | 2.1 | 4.3 | -- | 14.9* | -- | 4.3* | -- | 8.5 | 10.6 | 29.8* | 2.1* | 6.4 | -- | 6.4 | 4.3 | 47 |
| C | 2.7* | 22.3 | 0.5 | -- | 3.3 | 1.6 | 1.1 | 0.5 | -- | 22.3* | 2.2 | 20.7 | 3.8 | 1.1 | -- | 9.2* | 8.7 | 184 |
| Z | -- | -- | -- | 2.7 | -- | 2.7 | 2.7 | 62.2* | -- | -- | -- | -- | -- | 2.7* | -- | -- | 27.0 | 37 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 12.5* | -- | -- | -- | -- | 12.5* | -- | 6.2* | -- | -- | 68.8 | 16 |
| E | -- | 34.3* | -- | 5.7* | -- | -- | -- | -- | -- | 17.1 | -- | 34.3 | 2.9* | 2.9 | -- | -- | 2.9 | 35 |
| U | 10.5* | 31.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.3 | 10.5 | 5.3 | -- | 21.1 | -- | 5.3* | 10.5 | 19 |
| Base Pair (24 : 426) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 1.8 | 9.1 | 9.1 | -- | 7.3* | -- | -- | -- | 1.8* | 32.7* | 10.9 | 14.5 | 7.3 | 3.6 | 1.8* | -- | -- | 55 |
| B | 4.1 | 12.2 | 8.2 | 4.1 | 8.2* | 4.1* | 2.0 | -- | -- | 20.4* | 4.1 | 16.3 | 2.0 | 2.0 | -- | 6.1 | 6.1 | 49 |
| C | 13.5* | 2.7 | -- | -- | 11.9 | 1.1 | 3.8 | 1.6 | -- | 21.6* | 20.5 | 0.5 | 2.2 | 2.2 | 8.1 | 1.6* | 8.6 | 185 |
| Z | -- | 5.3* | 2.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 57.9* | 7.9 | -- | -- | 26.3 | 38 |
| D | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | 11.8* | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | 5.9 | 70.6 | 17 |
| E | -- | 8.1 | -- | -- | -- | 2.7* | -- | 2.7* | -- | -- | 32.4 | 43.2* | 5.4* | -- | -- | 2.7 | 2.7 | 37 |
| U | -- | 9.5 | 4.8 | -- | 4.8 | 9.5 | -- | -- | -- | 33.3* | 4.8 | 4.8 | -- | 14.3* | 4.8* | -- | 9.5 | 21 |
| Base Pair (25 : 425) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 5.5* | 3.6 | 1.8* | 1.8 | 3.6 | 1.8 | -- | 1.8 | 3.6* | 10.9 | 14.5 | 36.4* | -- | -- | -- | 5.5 | 9.1 | 55 |
| B | 6.1* | -- | 10.2* | 4.1 | 12.2 | -- | 2.0 | 2.0 | -- | 8.2 | 4.1 | 12.2* | -- | 4.1 | 10.2 | 8.2 | 16.3 | 49 |
| C | -- | 18.5 | 1.6 | 1.1 | 1.6 | 22.8* | -- | -- | 21.2 | 2.1 | 2.1 | 3.2* | 4.2* | 10.1 | 0.5 | 1.6 | 9.5 | 189 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.6 | -- | -- | -- | -- | 97.4 | 38 |
| D | 5.9* | -- | -- | 11.8* | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | 70.6 | 17 |
| E | 2.7 | -- | -- | -- | 2.7 | 2.7 | 5.4 | -- | 32.4* | -- | -- | 5.4* | -- | 2.7 | 35.1* | 8.1 | 2.7 | 37 |
| U | 4.8* | 23.8* | 14.3* | -- | 4.8 | 4.8 | -- | -- | -- | 4.8 | 4.8 | 14.3 | -- | 14.3 | -- | -- | 9.5 | 21 |
| Base Pair (26 : 424) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 3.5* | 5.3 | 8.8 | 1.8 | 1.8 | -- | 3.5 | -- | 3.5* | 22.8* | 1.8 | 1.8 | 1.8 | -- | -- | 3.5* | 40.4 | 57 |
| B | -- | 8.0 | 4.0 | -- | -- | 20.0* | -- | -- | -- | 6.0 | 2.0 | 8.0* | 8.0* | -- | 10.0 | 10.0 | 24.0 | 50 |
| C | 20.7* | 19.7* | 0.5 | 8.3 | -- | 10.4 | 0.5* | 1.6 | -- | -- | 0.5 | 0.5 | -- | -- | 1.0 | 21.8* | 14.5 | 193 |
| Z | -- | 2.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.7 | 43 |
| D | -- | 5.9 | 5.9 | -- | -- | 5.9 | -- | -- | 5.9* | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 70.6 | 17 |
| E | 76.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 13.2 | 7.9 | -- | -- | 2.6 | 38 |
| U | -- | -- | 3.3* | 6.7 | 36.7* | -- | -- | -- | 13.3* | -- | 3.3* | 3.3 | -- | 3.3 | -- | 13.3 | 16.7 | 30 |
| Base Pair (27 : 423) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 1.8 | 1.8* | 1.8 | 3.5* | 1.8 | -- | 1.8 | -- | -- | -- | -- | 1.8 | 3.5* | -- | -- | -- | 82.5 | 57 |
| B | 1.9 | 5.7 | 1.9 | 5.7* | 3.8 | 1.9 | -- | 3.8 | 1.9 | 11.3* | 3.8 | 3.8 | -- | -- | 5.7* | 3.8 | 45.3 | 53 |
| C | 4.5 | 1.4* | 1.4 | -- | -- | 2.3 | -- | 19.5* | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 2.3 | 7.3* | 60.0 | 220 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 45 |
| D | -- | -- | -- | 11.8 | -- | -- | -- | -- | 11.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | 70.6 | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35.9* | -- | 2.6 | 2.6 | -- | 12.8* | 5.1 | 35.9 | -- | 5.1 | 39 |
| U | -- | 10.0* | 3.3 | -- | -- | 10.0 | -- | 10.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 33.3* | -- | 33.3 | 30 |
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