| Base Pair (31 : 56) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 1.3* | 25.3* | 26.6* | 31.6* | 1.3 | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.3 | -- | 10.1 | 79 |
| B | 4.3* | 10.1* | 18.8* | 8.7* | 4.3 | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 50.7 | 69 |
| C | 14.2* | -- | 25.1* | 48.2* | 2.3 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 9.6 | 303 |
| Z | 1.6 | 88.5* | 2.5* | -- | 2.5* | -- | -- | 0.8* | 3.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | 122 |
| D | -- | -- | -- | 5.9 | 5.9* | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
| E | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 21.9* | -- | 9.4* | 12.5* | -- | 3.1 | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 50.0 | 32 |
| Base Pair (32 : 55) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 5.0* | 26.2* | 33.8* | 18.8* | 1.2 | 3.8 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 10.0 | 80 |
| B | 5.8* | 4.3* | 24.6* | 13.0* | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 50.7 | 69 |
| C | 68.6* | -- | 4.3 | 3.6* | -- | 12.9* | -- | 1.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.9 | 303 |
| Z | -- | 1.6* | 95.9* | -- | -- | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | 123 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | 5.9* | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
| E | 95.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 2.2 | -- | -- | -- | 46 |
| U | 12.5* | 15.6* | -- | 34.4* | 3.1 | 12.5 | -- | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.1 | 15.6 | 32 |
| Base Pair (33 : 54) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 5.0* | 6.2* | 42.5* | 22.5* | 1.2 | 5.0 | 1.2 | 1.2 | -- | -- | -- | 3.8 | 1.2 | -- | -- | -- | 10.0 | 80 |
| B | 4.3* | 7.2* | 11.6* | 20.3* | 1.4 | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 50.7 | 69 |
| C | 4.6* | 63.6* | 0.3 | -- | 1.0 | 12.3 | 3.6* | -- | -- | -- | 0.3 | 1.3 | -- | 0.3 | -- | -- | 12.6 | 302 |
| Z | 0.8* | 3.2* | 94.4* | 1.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | 5.9 | -- | -- | 5.9* | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
| E | -- | 19.6 | 8.7 | 2.2* | 2.2 | 67.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 12.9* | 12.9 | 6.5* | 9.7 | 3.2 | 6.5 | 6.5 | -- | 25.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 16.1 | 31 |
| Base Pair (34 : 53) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 3.8* | 6.2* | 18.8* | 47.5* | -- | 1.2 | 2.5 | 1.2 | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 3.8 | -- | 1.2 | 12.5 | 80 |
| B | 4.3* | 1.4* | 17.4* | 17.4* | -- | 1.4 | 1.4 | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 53.6 | 69 |
| C | 18.2* | 5.9* | 3.0* | 23.1* | 3.0 | 3.6 | 0.7 | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | 6.6 | -- | 0.3 | -- | 35.0 | 303 |
| Z | 20.2 | 2.4* | 2.4* | 9.7 | 64.5* | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | 11.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
| E | 13.0* | 17.4* | 2.2* | 43.5* | 19.6 | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | 46 |
| U | 3.1* | 12.5* | 15.6* | 6.2* | 3.1 | 3.1 | -- | 3.1 | 6.2 | -- | -- | -- | 3.1 | -- | -- | -- | 43.8 | 32 |
| Base Pair (35 : 52) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 5.0* | 5.0* | 46.2* | 18.8* | 3.8 | 1.2 | -- | -- | -- | 1.2 | 3.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 15.0 | 80 |
| B | 4.3* | -- | 17.4* | 14.5* | 5.8 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | 53.6 | 69 |
| C | 7.3* | 2.6* | 1.3* | 5.6* | 4.0 | 0.7 | -- | -- | 3.6 | 2.0 | -- | 0.3 | 0.7 | 1.0 | 0.3 | 0.7 | 70.0 | 303 |
| Z | 76.6* | 1.6* | 1.6* | 12.9* | 4.8 | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | 0.8 | -- | 124 |
| D | -- | -- | 11.8* | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
| E | 76.1* | 4.3* | -- | 10.9* | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.3 | 46 |
| U | 16.1* | -- | -- | 6.5* | -- | 3.2* | -- | -- | -- | 3.2* | 6.5 | -- | 3.2 | 3.2 | -- | 3.2 | 54.8 | 31 |
| Base Pair (36 : 51) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 6.2* | 5.0* | 13.8* | 41.2* | 1.2 | 8.8 | 1.2 | 3.8 | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 16.2 | 80 |
| B | 1.4* | 4.3* | 14.5* | 13.0* | 1.4 | 2.9 | -- | 1.4 | 1.4 | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 2.9 | 55.1 | 69 |
| C | 3.6* | 9.2* | 1.7* | 3.3* | 2.0 | 0.7 | -- | 1.0 | 0.7 | 0.3 | 0.7 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 76.6 | 303 |
| Z | 1.6 | 0.8* | 66.1* | 4.8 | -- | 16.9 | -- | 5.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.0 | -- | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | 11.8* | 82.4 | 17 |
| E | 52.2* | 6.5* | -- | 6.5* | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 30.4 | 46 |
| U | 12.9* | 9.7* | 3.2 | 3.2 | -- | 6.5 | 3.2* | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | 58.1 | 31 |
| Base Pair (37 : 50) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 3.8* | 3.8* | 31.6* | 17.7* | 1.3 | 1.3 | 3.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.3 | 3.8 | 31.6 | 79 |
| B | 2.9* | 4.3* | 13.0* | 14.5* | -- | 1.4 | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | 59.4 | 69 |
| C | 2.6* | 10.2* | 2.0* | 4.3* | 1.3 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 79.2 | 303 |
| Z | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.2 | 124 |
| D | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | 5.9 | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
| E | -- | -- | -- | 6.5* | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 4.3 | 19.6* | -- | -- | 67.4 | 46 |
| U | 6.5* | 12.9* | -- | 3.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | -- | 3.2 | 64.5 | 31 |
| Base Pair (38 : 49) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 3.8* | 1.2* | 26.2* | 10.0* | -- | 2.5 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 8.8 | 46.2 | 80 |
| B | 7.2* | 1.4* | 1.4* | 13.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | 73.9 | 69 |
| C | 5.3* | 6.9* | 3.0* | 2.6* | 0.3 | 2.0 | -- | -- | -- | -- | 0.7 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 78.9 | 303 |
| Z | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.2 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | 88.2 | 17 |
| E | 4.3* | -- | -- | 6.5* | 2.2 | 2.2* | -- | -- | 4.3 | -- | 2.2 | 4.3 | -- | -- | -- | -- | 73.9 | 46 |
| U | 3.2 | 3.2 | 3.2* | -- | 3.2* | -- | -- | -- | 6.5* | -- | 6.5* | -- | -- | -- | 3.2 | -- | 71.0 | 31 |
| Base Pair (39 : 48) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 1.2* | -- | 5.0 | -- | -- | 1.2* | 5.0* | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 3.8 | -- | -- | 1.2 | 81.2 | 80 |
| B | -- | -- | 7.2* | 2.9* | -- | 1.4 | -- | 1.4 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 85.5 | 69 |
| C | 5.0* | 0.3 | 2.0 | 4.6* | 0.3 | 5.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.8 | 303 |
| Z | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.2 | 124 |
| D | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 88.2 | 17 |
| E | -- | -- | 4.3* | 4.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.3 | 2.2 | -- | -- | -- | 84.8 | 46 |
| U | 9.7* | 6.5* | 3.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | 77.4 | 31 |
| Base Pair (40 : 47) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | 2.5* | 2.5* | 2.5 | 1.2 | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 90.0 | 80 |
| B | -- | 1.4* | 1.4 | 1.4 | -- | 1.4 | 2.9* | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 88.4 | 69 |
| C | 2.3* | 1.0* | 0.7* | -- | 0.3 | 0.3 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.0 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 88.2 | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | 8.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 4.3 | 84.8 | 46 |
| U | -- | -- | 3.2 | -- | -- | 6.5* | -- | 3.2* | -- | -- | -- | 3.2* | -- | -- | -- | 3.2 | 80.6 | 31 |
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