Base Pair (58 : 93) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 1.2* | 20.0* | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 2.5 | 73.8 | 80 |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 98.6 | 69 |
C | 73.7* | -- | 17.0* | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 8.7 | 300 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | 88.2 | 17 |
E | 97.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 46 |
U | 18.8* | -- | 3.1* | 25.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 53.1 | 32 |
Base Pair (59 : 92) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 5.1* | 13.9* | 1.3* | -- | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.3 | -- | 75.9 | 79 |
B | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | 17.2* | 17.2 | 1.0 | -- | -- | 55.6* | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.6 | 302 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | 88.2 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
U | -- | 31.2 | -- | -- | -- | 12.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.1 | -- | -- | 53.1 | 32 |
Base Pair (60 : 91) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 12.5* | 5.0* | 2.5* | 1.2 | -- | -- | -- | 3.8 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 73.8 | 80 |
B | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | 12.0* | 37.9* | 0.7* | 23.3* | 13.0 | -- | -- | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 1.7 | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 9.6 | 301 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | 5.9* | 88.2 | 17 |
E | 2.2 | 82.6* | -- | 2.2 | 8.7* | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | 46 |
U | -- | 37.5* | -- | -- | -- | -- | 3.1* | -- | -- | -- | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 56.2 | 32 |
Base Pair (61 : 90) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 3.8* | 1.2* | 13.8* | -- | 1.2 | 3.8 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 73.8 | 80 |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | 29.9* | 17.9* | 9.6* | 11.6* | 1.3 | 2.7 | 4.7 | 0.3 | -- | 3.3 | -- | 0.3 | 6.3 | 0.7 | -- | 0.7 | 10.6 | 301 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | 5.9* | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 88.2 | 17 |
E | 54.3* | 28.3* | 4.3* | -- | -- | 4.3 | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 4.3 | 46 |
U | -- | 6.2 | -- | 3.1 | 6.2* | -- | -- | -- | -- | -- | 15.6* | 6.2 | -- | -- | 3.1 | -- | 59.4 | 32 |
Base Pair (62 : 89) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 3.8* | 3.8* | 2.5* | 12.5* | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 73.8 | 80 |
B | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3* | 0.7 | 0.3* | -- | 0.3 | 1.7* | 95.7 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 88.2 | 17 |
E | 2.2 | -- | 4.3* | 15.2 | -- | -- | 4.3 | 54.3* | 13.0 | -- | -- | 2.2* | -- | -- | -- | -- | 4.3 | 46 |
U | 6.2* | 25.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.1 | -- | 6.2 | -- | -- | 59.4 | 32 |
Base Pair (63 : 87) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 97.5 | 80 |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 69 |
C | 9.2* | 13.9* | 5.9* | 8.6* | 0.3 | 2.3 | 0.7 | 6.3 | 0.3 | -- | 2.3 | 0.7 | -- | -- | 0.7 | -- | 48.8 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | 2.2 | 17.4 | 2.2 | 2.2 | 2.2 | 8.7 | -- | 2.2* | 8.7 | 17.4* | -- | -- | -- | 21.7* | 2.2 | -- | 13.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | 3.1* | -- | -- | -- | 3.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 93.8 | 32 |
Base Pair (64 : 86) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | 8.8* | -- | 2.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 1.2 | -- | -- | 1.2 | 85.0 | 80 |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 98.6 | 69 |
C | 5.6* | 10.9* | 4.6* | 5.3* | 1.3 | 2.0 | 0.3 | 3.6 | 0.7 | 1.3 | 0.7 | 1.3 | -- | 0.7 | 1.7 | -- | 60.1 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | 88.2 | 17 |
E | -- | 10.9 | 2.2* | 6.5 | 4.3 | 6.5 | -- | -- | 23.9* | -- | -- | 4.3* | -- | 4.3 | -- | -- | 37.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.9 | 32 |
Base Pair (65 : 85) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | 1.2* | 5.0* | -- | 1.2 | 2.5 | -- | 2.5 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 86.2 | 80 |
B | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | 5.6* | 12.2* | 2.0* | 5.0* | 2.0 | 1.7 | 0.3 | 0.3 | 0.3 | -- | 1.0 | 0.3 | 0.3 | 0.7 | 1.3 | 0.7 | 66.3 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | 88.2 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | 4.3 | 6.5* | -- | -- | -- | -- | -- | 8.7* | -- | -- | -- | 2.2 | 78.3 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
Base Pair (66 : 84) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | 6.2* | -- | -- | 2.5 | 2.5 | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 86.4 | 81 |
B | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | 7.3* | 5.3* | 3.3* | 6.9* | 0.7 | 2.6 | 0.7 | 0.3 | 0.7 | -- | -- | -- | 0.3 | 0.7 | -- | -- | 71.3 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | 5.9* | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.9 | 32 |
Base Pair (67 : 83) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 1.2 | 1.2 | -- | -- | 3.7* | -- | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 91.4 | 81 |
B | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | 2.3* | 4.3* | 5.0* | 7.3* | 1.0 | 0.7 | 1.0 | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 76.9 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | 11.8 | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
Base Pair (68 : 82) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | 3.7* | -- | -- | -- | -- | -- | 3.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 92.6 | 81 |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | 98.6 | 69 |
C | 4.6* | 7.3* | 0.3* | 3.0* | -- | 1.7 | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 0.3 | 0.7 | -- | 1.0 | 0.7 | -- | 79.9 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | 82.4 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
Base Pair (69 : 81) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 2.5* | -- | -- | -- | 1.2* | -- | -- | 1.2* | 92.6 | 81 |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 98.6 | 69 |
C | 3.3* | -- | -- | 2.0* | 3.0 | -- | -- | 2.6 | -- | -- | -- | 1.3 | -- | -- | -- | 0.3 | 87.4 | 302 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | 11.8* | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
E | -- | 8.7 | -- | -- | -- | 6.5 | -- | -- | 15.2 | -- | -- | -- | -- | 10.9 | -- | -- | 58.7 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
Base Pair (70 : 80) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 1.2* | -- | -- | -- | 2.5* | -- | -- | 93.8 | 81 |
B | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | 3.6* | 3.0* | 0.7* | 2.3* | -- | 0.3 | -- | 0.7 | -- | -- | -- | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | 88.8 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | 5.9* | 5.9* | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
E | -- | 6.5 | 2.2 | -- | 2.2* | 4.3 | -- | -- | 26.1* | 2.2* | -- | -- | -- | 8.7 | -- | 2.2 | 45.7 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
Base Pair (71 : 79) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 2.5* | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | 93.8 | 81 |
B | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
C | -- | 1.7* | 2.3* | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.4 | 302 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | 11.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.4 | 17 |
E | 2.2 | 4.3* | -- | 6.5* | -- | 8.7 | -- | 6.5 | 2.2 | 2.2 | 2.2 | -- | -- | -- | 17.4* | 6.5 | 41.3 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
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