| Base Pair (96 : 278) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 2.4* | 17.1* | 53.7* | 2.4* | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 22.0 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 69 |
| C | 5.6* | 80.1* | 0.3* | 10.9* | 0.3 | 1.3 | -- | -- | 0.7 | 0.3 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 302 |
| Z | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.2 | 124 |
| D | -- | -- | -- | 52.9* | 35.3 | -- | -- | -- | 5.9 | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 50.0* | 50.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (97 : 277) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 3.7* | 18.3* | 56.1* | 2.4* | -- | 6.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 12.2 | 82 |
| B | 5.8* | 20.3* | 43.5* | 14.5* | -- | 2.9 | 1.4 | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 7.2 | 69 |
| C | 2.6* | 2.3 | 0.7 | 75.9* | 0.3 | 17.5* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 303 |
| Z | 21.0 | 2.4* | 0.8* | 0.8 | -- | -- | 1.6 | 73.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | 29.4* | 58.8* | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | 17 |
| E | 10.9* | -- | -- | 89.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 43.3* | -- | -- | 33.3* | 3.3 | -- | -- | 3.3 | 3.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 3.3 | -- | 10.0 | 30 |
| Base Pair (98 : 276) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 64.6* | 17.1* | 11.0* | 2.4* | 2.4 | 2.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | 17.4* | 24.6* | 29.0* | 21.7* | -- | 5.8 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 0.7* | 63.6* | 25.8* | -- | -- | 7.6 | -- | -- | -- | 1.7 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 302 |
| Z | 0.8* | 60.5* | 3.2* | 0.8* | -- | 34.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 5.9* | 5.9* | 52.9* | 5.9* | -- | 23.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | 17 |
| E | -- | 73.3* | 22.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 45 |
| U | 9.7 | 22.6* | 16.1* | -- | -- | 9.7 | -- | 29.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 12.9 | 31 |
| Base Pair (99 : 275) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 67.1* | 13.4* | 9.8* | 6.1* | -- | 1.2 | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 82 |
| B | 7.2* | 11.6* | 60.9* | 13.0* | -- | 4.3 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | 69 |
| C | 4.6* | 24.5* | 62.3* | 4.6* | 1.7 | 1.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 0.3 | 302 |
| Z | 0.8* | -- | 97.6* | 1.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 35.3* | -- | -- | 64.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 23.9* | 28.3* | 6.5* | 41.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | 33.3* | 10.0* | -- | -- | 6.7 | -- | -- | -- | 6.7 | -- | 3.3 | -- | 30.0 | -- | -- | 10.0 | 30 |
| Base Pair (100 : 274) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 78.0* | 2.4* | 1.2* | 11.0* | 1.2 | 2.4 | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 82 |
| B | 14.5* | 47.8* | 20.3* | 13.0* | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 21.2* | 30.5* | 12.6* | 16.9* | 1.7 | 14.9 | -- | -- | -- | 0.3 | 0.7 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 1.0 | 302 |
| Z | 2.4* | 18.5* | 77.4* | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | 124 |
| D | 70.6* | -- | 11.8* | 11.8* | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 17.4* | 78.3* | 4.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 23.3* | 13.3* | 6.7* | 16.7* | 20.0 | 3.3 | -- | -- | -- | 3.3 | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | 10.0 | 30 |
| Base Pair (101 : 273) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 9.8* | 4.9 | 13.4 | 1.2 | 2.4 | 61.0* | 1.2* | 2.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.4 | 1.2 | 82 |
| B | 40.6* | 5.8* | 1.4* | 47.8* | 2.9 | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 0.3* | 23.8 | 6.0 | 0.3* | -- | 62.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 6.6 | -- | 302 |
| Z | -- | 16.1 | 2.4 | -- | -- | 81.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | 94.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | -- | 17 |
| E | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | 50.0* | 30.0* | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | 3.3 | 10.0 | 30 |
| Base Pair (102 : 272) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 35.4* | 19.5* | 6.1* | 1.2* | 24.4 | 2.4 | 3.7 | 2.4 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 1.2 | 1.2 | 1.2 | 82 |
| B | -- | 89.9* | 5.8* | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | -- | 79.9* | 1.0* | 0.3 | 9.9* | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.6 | -- | 303 |
| Z | -- | 98.4* | 1.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 94.1* | -- | -- | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | -- | 97.8* | -- | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | 74.2* | 3.2 | -- | -- | 6.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2* | -- | -- | -- | 12.9 | 31 |
Last generated: Mon Sep 20 12:28:08 1999