Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 105


Base Pair (105:338)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 25.7* 1.8* 14.6* 26.9* 1.2 8.8 -- 0.6 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 19.9171
Base Pair (106:337)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 15.2* 2.9* 40.9* 18.1* 1.2 0.6 -- -- 0.6 0.6 -- -- -- -- -- -- 19.9171
 
Base Pair (107:336)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.1* 9.4* 29.2* 17.5* 0.6 9.9 -- -- -- 7.6 -- -- 0.6 -- -- 0.6 20.5171
 
Base Pair (108:335)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 25.1* 4.1* 6.4* 27.5* 10.5 5.8 -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- 19.9171
 
Base Pair (109:334)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 23.4* 21.1* 5.3* 9.4* 0.6 11.7 -- -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- 28.1171
 
Base Pair (110:333)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2* 5.8* 39.2* 4.7* 0.6 1.2 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 46.8171
 
Base Pair (111:332)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.8* 1.8* 11.7* 1.2 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 83.0171
 
Base Pair (112:331)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 1.2* 2.3* -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 95.9171
 
Base Pair (113:330)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.4171
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)