Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 141


Base Pair (141:164)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2 62.0* 7.6* 0.6 4.7* 2.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.2 19.9171
Base Pair (142:163)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8 45.6* 22.8* -- 1.8* 8.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 19.9171
 
Base Pair (143:162)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8* 32.2* 8.8* -- -- 19.9 0.6 0.6 -- -- 0.6 -- -- -- -- 0.6 35.1171
 

Base Pair (145:161)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.3 15.8* 15.8* 0.6 0.6* 1.2 -- 2.9* -- 0.6 -- -- -- -- -- -- 60.2171
 
Base Pair (146:160)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.6* -- 10.5* 5.8* 1.2 9.9 5.8 4.1 1.8 -- -- -- -- -- -- 0.6 59.7171
 
Base Pair (147:159)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 15.2* 13.5* 5.8* 7.6* 2.9 0.6 7.0 -- -- 4.1 0.6 -- 0.6 -- -- 1.8 40.4171
 
Base Pair (148:158)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 16.4* 12.3* 6.4* 27.5* 0.6 12.3 1.8 -- 1.8 -- 1.2 -- 1.8 -- -- -- 18.2171
 
Base Pair (149:157)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 7.6* 5.8* 29.2* 22.2* 2.9 2.9 -- -- 13.5 -- -- -- 0.6 -- -- -- 15.2171
 
Base Pair (150:156)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 31.6* 25.1* 1.8* 18.1* 2.9 1.2 -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- -- 18.7171
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)