Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 213


Base Pair (213:389)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.7* -- 4.7* 1.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 89.5171
Base Pair (214:388)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 12.3* 6.4* 9.4* 4.1* 2.9 -- 4.7 0.6 -- -- -- -- 1.8 0.6 -- -- 57.3171
 
Base Pair (215:387)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 12.9* 4.1* 15.8* 23.4* 1.2 0.6 0.6 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- 41.0171
 
Base Pair (216:386)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 19.9* 1.2* 39.8* 10.5* -- 0.6 -- -- -- 0.6 0.6 -- -- -- 0.6 3.5 22.9171
 
Base Pair (217:385)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 31.6* 17.0* 21.1* 11.1* 6.4 -- 3.5 0.6 -- 1.2 -- -- 3.5 -- 0.6 -- 3.5171
 
Base Pair (218:384)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 17.5* 33.9* 2.9* 36.8* -- -- -- -- -- 0.6 -- 1.2 -- -- 0.6 -- 6.4171
 

Base Pair (222:379)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 79.5* -- 13.5* 1.2* 1.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 4.1171
 
Base Pair (223:378)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 71.9* 1.2 5.3 2.3* 0.6 1.8* -- -- -- 12.9* 0.6 -- -- -- -- -- 3.5171
 
Base Pair (224:377)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2* 5.3* 49.7* 29.8* 3.5 7.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 3.5171
 
Base Pair (225:376)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 28.7* 12.3 11.1 3.5* -- 22.2* 0.6 -- -- -- -- -- -- 1.2 -- -- 20.5171
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)