Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 2421


Base Pair (2421:2454)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 52.7* -- -- 31.4* 13.6 -- -- -- -- -- -- -- 1.2 -- -- -- 1.2169
Base Pair (2422:2453)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.6* 91.1* 1.8 -- -- 5.3 -- -- -- -- -- -- -- -- 1.2169
 
Base Pair (2423:2452)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 11.8 1.8* 0.6* -- 84.6* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.2169
 
Base Pair (2424:2451)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 95.9* 1.2* -- -- -- -- -- 0.6 1.2 -- -- -- -- -- -- 1.2169
 
Base Pair (2425:2450)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 16.0* 47.3* 13.0* 13.0* -- 1.2 0.6 -- -- 7.1 -- -- 0.6 -- -- -- 1.2169
 
Base Pair (2426:2449)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 44.7* 32.4* 4.1* 8.2* 0.6 1.2 -- 0.6 -- -- -- -- -- -- 6.5 -- 1.8170
 
Base Pair (2427:2448)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.6* 4.1* 52.4* 39.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.8 -- 1.8170
 
Base Pair (2428:2447)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 40.6* -- -- 46.5* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 8.8 4.1170
 
Base Pair (2429:2446)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- -- -- 97.1 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- 2.4170
 

Base Pair (2430:2443)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 59.8* -- -- 28.4* -- 1.2* -- 1.8 -- -- -- -- -- -- -- 7.7 1.2169
 
Base Pair (2431:2442)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 81.1* -- 15.4* 0.6 -- -- -- -- 0.6 -- -- -- -- -- 1.2 1.2169
 
Base Pair (2432:2441)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 10.7* 2.4* 12.4* 39.1* 26.0 1.8 0.6 -- -- -- -- -- 0.6 -- 0.6 4.7 1.2169
 
Base Pair (2433:2440)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.3* 3.0* 13.6* 37.3* 21.3 1.8 10.7 -- 0.6 1.2 -- 0.6 1.8 -- -- 0.6 2.4169
 
Base Pair (2434:2439)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 22.5* 21.3 10.1 -- -- 37.3* -- -- -- 0.6* -- -- -- -- -- -- 8.3169
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)