Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 2457


Base Pair (2457:2501)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 36.7* -- 2.4* 18.3* 21.9 -- -- 3.0 -- 1.2 -- -- -- -- -- -- 16.6169
Base Pair (2458:2500)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 53.3* -- -- 39.1* -- 4.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 3.6169
 
Base Pair (2459:2499)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 35.5* -- -- 55.6* 4.7 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- 3.6169
 
Base Pair (2460:2498)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 83.4* 1.2* -- 8.9* 1.2 -- -- 0.6 1.8 -- -- -- -- -- -- -- 3.0169
 

Base Pair (2461:2496)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 9.5* 6.5* 8.9 47.3* -- -- 11.2* 11.2 -- -- -- -- -- -- 0.6 4.8169
 
Base Pair (2462:2495)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 49.7* 10.7* -- 34.3* 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 4.8169
 
Base Pair (2463:2494)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 13.0 2.4* 0.6* 25.4 33.1* -- -- 0.6* -- -- -- -- -- -- -- 1.8 23.1169
 

Base Pair (2467:2490)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.8* 1.2* -- 2.4* 1.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 93.5170
 
Base Pair (2468:2489)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.9* 0.6* 2.4* -- -- 1.2 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 92.4170
 
Base Pair (2469:2488)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.6* 3.5* 2.4* -- 1.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 91.8170
 
Base Pair (2470:2487)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 2.4* 1.8* 3.5* 1.2 1.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 89.4170
 
Base Pair (2471:2486)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.6* 3.5* 2.4* 1.8* -- 2.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 89.4170
 

Base Pair (2474:2483)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.6* 2.9* 3.5* 1.8* 1.2 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 89.4170
 
Base Pair (2475:2482)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8* 5.3* 2.4* 0.6* 0.6 1.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 88.2170
 
Base Pair (2476:2481)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2* 1.2* 4.1* 2.4* -- 1.8 -- -- -- -- -- -- -- 1.2 -- -- 88.2170
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35 )