Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 297


Base Pair (297:329)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 4.7* 0.6 4.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 90.7171
Base Pair (298:328)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.1* 2.9* 4.1* 1.2* 1.8 -- 0.6 -- -- -- -- 1.2 -- -- -- 1.2 83.1171
 
Base Pair (299:327)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.6* 1.2* 12.9* 8.2* 1.8 0.6 0.6 -- -- 0.6 -- -- 0.6 -- -- 1.2 72.0171
 
Base Pair (300:326)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.7* 7.6* 29.2* 25.1* -- 1.2 -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- 2.9 28.7171
 
Base Pair (301:325)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.1* 14.6* 42.7* 3.5* -- 4.1 0.6 0.6 0.6 -- -- -- 0.6 -- 2.3 0.6 25.8171
 
Base Pair (302:324)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 11.1* 38.0* 17.5* 3.5* 2.3 8.2 -- 1.2 1.2 -- -- 0.6 0.6 -- -- -- 15.8171
 
Base Pair (303:323)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.3* 14.0* 7.6* 52.6* 0.6 1.2 0.6 -- 2.9 -- -- -- -- -- -- -- 18.1171
 
Base Pair (304:322)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 22.8* 9.4* 25.1* 33.3* 1.8 0.6 0.6 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- 5.8171
 
Base Pair (305:321)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 15.2* 15.2* 22.8* 32.7* 5.3 1.8 -- -- -- -- -- 0.6 -- 0.6 -- 1.2 4.7171
 
Base Pair (306:320)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.8* 36.8* 22.2* 10.5* 7.6 12.9 -- -- -- 2.9 0.6 -- -- -- -- -- 0.6171
 
Base Pair (307:319)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.8* 4.1* 33.9* 29.8* -- 25.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6171
 
Base Pair (308:318)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 38.0* 1.8 20.5 2.3* 2.9 30.4* -- -- 0.6 0.6* -- -- -- -- 0.6 1.2 1.2171
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)