Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 415


Base Pair (415:443)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 22.2* 70.2* 0.6* -- 4.1 -- -- -- 1.2 -- 1.2 -- -- -- -- 0.6171
Base Pair (416:442)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.8* 35.7* 38.0* 2.9* -- 2.3 -- 0.6 -- -- 13.5 -- -- -- -- 0.6 0.6171
 
Base Pair (417:441)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 22.8* 20.5* 7.6* 32.2* 9.9 2.9 -- -- -- -- -- -- 2.9 -- -- -- 1.2171
 
Base Pair (418:440)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.3* 63.7* 8.2* 11.7* -- 0.6 0.6 -- 1.8 -- -- -- -- -- -- -- 11.1171
 
Base Pair (419:439)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.3* 70.2* 7.0* -- -- 5.3 -- -- -- -- 0.6 -- 0.6 -- -- -- 11.1171
 
Base Pair (420:438)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 9.4* 36.3* 2.9* -- -- 0.6 -- -- -- 1.2 -- -- -- -- 0.6 -- 49.1171
 

Base Pair (424:435)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 26.9* 7.6* 8.2* 3.5* 15.8 1.2 0.6 1.2 -- -- -- -- -- -- 0.6 -- 34.5171
 
Base Pair (425:434)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 27.5* 17.0* 7.0* 12.3* -- 0.6 -- -- -- 0.6 -- 0.6 0.6 -- -- -- 33.9171
 
Base Pair (426:433)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.3* 19.3* 17.5* 16.4* 1.8 -- -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 39.2171
 
Base Pair (427:432)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.3* 2.3* 7.6* 2.3* 1.2 4.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 77.2171
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)