Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 448


Base Pair (448:543)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 33.3* 17.0* 11.7* 5.8* 19.9 0.6 -- -- -- -- 1.2 7.0 0.6 0.6 -- 1.2 1.2171
Base Pair (449:542)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 28.7* 31.6* 8.2* 9.9* 18.1 2.3 -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- -- 0.6171
 
Base Pair (450:541)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 53.2* 25.7* 11.7* 5.8* 0.6 1.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.2171
 
Base Pair (451:540)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.1* 21.1* 11.1* 44.4* -- -- 1.2 -- -- 0.6 -- 0.6 -- -- -- -- 17.0171
 
Base Pair (452:539)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 38.6* 38.6* -- -- 4.1 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- 0.6 17.6171
 

Base Pair (460:534)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 6.4* 17.5* 33.3* 5.8* 2.9 4.7 0.6 1.2 -- 0.6 -- 1.2 -- -- -- -- 25.8171
 
Base Pair (461:533)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 25.1* 15.8* 18.7* 7.0* 0.6 4.1 0.6 1.2 -- 0.6 -- 0.6 -- -- -- -- 25.8171
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)