Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 483


Base Pair (483:530)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 1.2* 1.8* 1.2 -- -- -- -- -- 0.6* -- -- -- -- -- 95.3171
Base Pair (484:529)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.2* 4.7* -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 93.6171
 
Base Pair (485:528)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8* 2.3* 1.8* 0.6* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 93.6171
 
Base Pair (486:527)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.2* 1.8* -- -- 1.2 1.8 -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 93.6171
 
Base Pair (487:526)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 2.3* 1.2 1.8* 1.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 93.6171
 
Base Pair (488:525)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.6 2.9* -- 1.8* -- -- -- -- -- -- 0.6* -- 0.6 -- 93.7171
 
Base Pair (489:524)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 2.3* 2.3* -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 94.7171
 
Base Pair (490:523)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8* 0.6* 0.6* 0.6* -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 95.9171
 
Base Pair (491:522)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8* -- 1.2* 0.6* 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 95.9171
 
Base Pair (492:521)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8* -- 0.6* 1.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- -- 95.9171
 

Base Pair (496:519)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 1.8 1.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 97.2171
 
Base Pair (497:518)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.6* 1.2* 1.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 97.1171
 
Base Pair (498:517)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2* -- 0.6* 1.2* -- -- -- -- -- -- -- 0.6 0.6 -- -- -- 95.9171
 
Base Pair (499:516)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.3* -- -- 0.6* -- -- 0.6 -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- 95.9171
 

Base Pair (502:513)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 2.3* 1.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 96.5171
 
Base Pair (503:512)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.8* -- 1.8* 1.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 95.3171
 
Base Pair (504:511)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 2.3* 1.2* 1.2* -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- -- 0.6 94.1171
 
Base Pair (505:510)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 1.2* -- 2.9* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- 95.4171
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)