Group IIA Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 545


Base Pair (545:2417)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 14.8 8.3* 1.8* 17.8 48.5* -- -- 3.6* -- -- -- -- -- 2.4 -- -- 3.0169
Base Pair (546:2416)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 10.7* 27.2* 20.7* 27.8* 0.6 5.3 0.6 -- -- 4.1 -- -- -- -- -- -- 3.0169
 
Base Pair (547:2415)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 27.2* 4.1* 18.3* 39.1* -- 3.0 0.6 -- 3.0 0.6 -- -- -- -- -- 1.2 3.0169
 
Base Pair (548:2414)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 21.3* 14.8* 42.0* 12.4* 1.2 -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- 0.6 -- 7.1169
 
Base Pair (549:2413)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 37.3* 2.4 5.3 23.1* 11.8 8.9* 1.2 0.6 1.2 -- -- -- -- -- -- 1.2 7.1169
 
Base Pair (550:2412)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 14.8* 7.1* 45.6* 12.4* 1.2 1.2 -- 0.6 -- 1.2 -- -- -- -- -- -- 16.0169
 
Base Pair (551:2411)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.9* 15.3* 17.6* 18.2* 1.8 1.2 -- 0.6 -- 0.6 -- -- 0.6 -- -- 0.6 40.6170
 
Base Pair (552:2410)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 8.2* 0.6* 19.4* 17.1* 0.6 -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 1.2 1.2 51.2170
 

Base Pair (554:2409)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.6* 6.5* 2.4* 22.5* -- 1.2 -- -- 0.6 -- -- 0.6 -- -- -- -- 65.7169
 
Base Pair (555:2408)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.6* 4.7* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 94.7169
 
Base Pair (556:2407)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 1.8* 0.6* 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 97.0169
 
Base Pair (557:2406)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.6* 0.6* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 98.8170
 
Base Pair (558:2405)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0170
 

Last generated : Thu Sep 28 2000 (17 : 35)