Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 100

Base Pair (100:129)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 20.4* 62.1* 8.6* 2.3* 1.6 1.1 -- -- 0.2 1.6 -- -- 0.4 0.4 -- 0.2 1.3560
Base Pair (101:128)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.4* 0.4* 1.6* 92.6* 1.4 -- 0.2 0.5 0.2 0.4 -- 0.5 -- 0.4 -- 0.4 1.3565
 
Base Pair (102:127)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8* 3.0* 76.1* 3.7* 0.2 12.8 -- -- -- -- -- 0.2 0.2 -- 0.2 0.5 1.5564
 
Base Pair (103:126)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 21.2* 33.2* 1.4* 29.6* 5.0 1.2 0.4 0.5 3.8 -- 0.2 0.2 0.2 0.2 -- -- 2.9560
 
Base Pair (104:125)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3* 3.3* 44.7* -- -- -- -- 0.2 -- 0.3 0.2 -- 0.2 -- 0.2 -- 50.6573
 
Base Pair (105:124)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 22.2* 0.7* 0.5* 2.3* -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 0.2 0.2 0.2 0.2 73.4573
 
Base Pair (106:123)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.3* 1.0* 1.2* 0.2 0.2 -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- 96.9573
 
Base Pair (107:122)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 0.3* 0.7* 1.0* 0.2 0.3 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 97.1573
 
Base Pair (111:120)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.2 19.4* 2.0 1.1 1.4* 0.7 9.6* -- -- -- -- -- 0.4 1.4 6.4* 0.2 52.5563
 
Base Pair (112:119)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.6* 0.5* 20.5* 7.7* 0.5 1.1 0.7 0.7 3.2 -- 0.4 2.9 0.5 0.9 3.4 3.2 51.9555
 
Base Pair (113:118)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.1* 0.2 2.0 5.2* 1.8 18.3* 0.4 0.2 0.5 -- 0.2 0.7 -- 0.2 5.9 11.3 52.1556
 
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