Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 144


Base Pair (144:201)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 1.1* 0.2* 0.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- 98.2569
Base Pair (145:200)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.2* -- 0.4* -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2* -- 98.1570
 
Base Pair (146:199)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.2* 0.7 0.5 0.2 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 18.7* 79.6571
 
Base Pair (147:198)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.5 -- -- 0.2* -- -- -- -- -- -- 0.9* -- -- -- 0.2 -- 98.5571
 
Base Pair (148:197)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.5* 0.2* -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 99.2571
 

Base Pair (150:196)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 18.5* 0.2* 0.7* -- -- -- -- 0.2 -- 0.7 -- -- -- -- -- -- 79.7573
 
Base Pair (151:195)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 18.2* 0.9* -- 0.2 -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 0.7* 80.0573
 
Base Pair (152:194)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 17.5* 0.5* 0.2 0.2 0.5 0.2 -- 0.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.7* 80.0573
 

Base Pair (157:189)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3 -- 17.8* -- 0.3* -- -- -- -- 1.0 -- 0.2 -- -- 0.2 -- 80.1573
 
Base Pair (158:188)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.5* -- 1.2 17.5* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 80.9573
 
Base Pair (159:187)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 19.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 80.9573
 
Base Pair (160:186)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.6573
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)