Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 23


Base Pair (23:431)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 23.8* 16.0* 45.9* -- 10.8 0.4 -- -- 1.3 -- 0.4 -- -- -- 0.4 0.8231
Base Pair (24:430)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.4* 13.9 32.0 5.6* -- 45.9* -- -- -- 0.4* -- -- -- -- -- 0.9 0.8231
 
Base Pair (25:429)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 6.2* 10.5* 38.9* 3.2* 0.8 0.5 0.5 0.5 -- -- -- -- 0.3 -- -- -- 38.6373
 
Base Pair (26:428)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 21.4* -- 33.6* -- 1.0 -- 0.2 -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- 43.4402
 

Base Pair (31:425)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 3.8* 47.8* 4.6* 0.5* 0.5 1.1 -- -- -- 0.5 0.5 -- -- 0.5 4.3 -- 35.7370
 
Base Pair (32:424)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.3* 10.2 4.3 8.6* 6.5 34.8* 0.8 -- -- -- -- -- -- 0.5 -- 0.3 32.7371
 
Base Pair (33:423)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.5* 32.4* 7.8* 7.5* 1.6 14.2 0.8 0.3 -- 0.3 -- -- -- 0.5 -- 0.3 29.9374
 
Base Pair (34:422)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.5* 7.4* 49.2* 0.8 1.1 -- -- 1.3 0.3 -- 2.4 0.5 0.3 6.3 0.8 29.3380
 
Base Pair (35:421)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.5* 8.4* 35.0* 6.8* 1.8 10.0 0.3 -- -- 0.3 0.5 -- -- -- -- -- 32.4380
 
Base Pair (36:420)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.6* 33.9* 16.4* 5.5* 1.8 7.3 -- -- 0.3 -- -- -- 2.1 1.3 -- 0.3 29.6383
 
Base Pair (37:419)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 23.2* 2.8* 6.4* 3.8* 7.4 2.2 -- -- -- 0.2 -- -- 0.4 -- 0.2 0.2 53.0499
 
Base Pair (38:418)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.6* 29.3* 6.5* 4.5* -- 0.4 -- 0.4 -- -- -- 0.2 -- 0.2 0.6 0.4 55.9508
 
Base Pair (39:417)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3* 0.2* 47.8* 3.5* -- 1.2 0.5 -- 1.2 -- -- 0.3 -- 0.2 0.2 0.5 43.9573
 
Base Pair (40:416)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.4* 1.7* 34.0* 1.2* 0.2 8.2 1.4 -- 0.2 0.2 -- -- 0.2 -- 0.2 0.2 50.9573
 
Base Pair (41:415)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3* 18.3 1.9 1.9* -- 19.2* -- 0.2 -- -- -- 0.2 0.2 0.2 -- 0.2 57.4573
 
Base Pair (42:414)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.3 5.4 2.4* -- 14.7* 0.3 0.2 -- -- -- -- -- 0.2 -- -- 76.4573
 

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