Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 232


Base Pair (232:392)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 18.0* 2.5* 65.5* 4.0* 0.7 1.4 1.1 0.5 -- 0.2 -- -- 1.6 0.2 -- 0.4 4.1571
Base Pair (233:391)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 25.9 2.1* 4.2* 6.0 50.4* -- -- 0.2* 0.2 0.2 0.2 2.5 1.9 1.8 -- 0.5 4.1571
 
Base Pair (234:390)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 37.3* 18.2* 4.6* 29.0* 0.4 0.9 0.2 0.2 1.6 -- 0.4 -- 0.2 0.4 0.9 0.5 5.5565
 
Base Pair (235:389)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 3.0* 2.6* 57.7* 10.2 -- 0.2 0.4 1.1 -- -- 0.2 0.2 -- -- 0.9 23.8570
 
Base Pair (236:388)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2 1.4 10.7 0.7* -- 1.4* 0.5 -- -- 0.2 -- 0.2 15.7* -- -- -- 68.1572
 
Base Pair (237:387)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.6* 2.3* -- -- -- -- -- -- 0.3 -- -- -- -- 0.2 -- 95.6573
 

Base Pair (247:382)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 87.0* 2.6* 0.5 1.8* 4.9 -- -- 0.4 -- -- -- -- 0.5 -- 0.2 2.2571
 
Base Pair (248:381)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2* 20.5* 43.1* 28.9* 0.7 0.7 1.1 -- 1.2 0.5 -- -- -- -- -- 0.2 2.0571
 
Base Pair (249:380)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 2.6* 59.3* 23.6* 4.2 7.1 0.4 -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 1.4 1.3567
 
Base Pair (250:379)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.4* 66.8* 23.5* 0.9* 0.2 4.4 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 2.1 0.4 1.3570
 
Base Pair (251:378)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 91.4* 0.2* 1.4* 0.9* 0.7 0.2 0.4 2.1 -- 0.2 0.7 0.2 -- -- 0.4 -- 1.5571
 

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