Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 260

Base Pair (260:288)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3 1.7* 1.0* 0.2 0.9* 0.3 -- 0.2* -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.2 94.8572
Base Pair (261:287)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.1 0.5 2.6* 4.4* -- 0.4 0.7 0.4 7.0 -- -- -- -- 8.8* 0.5 0.4 72.4570
 
Base Pair (262:286)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.9 0.5 2.5* 6.7 15.6* -- 1.1 1.4 2.1* -- -- 0.5 0.4 0.2 0.4 0.5 67.4569
 
Base Pair (263:285)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.4* 2.0* 0.9 1.1 -- 0.7 6.7* 0.4 0.2 -- -- -- 0.4 -- -- -- 87.5563
 
Base Pair (264:284)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.5 0.2 0.9 0.5 0.9* 1.1* 7.9* 0.2 0.4 -- -- -- 0.2 -- -- 0.2 87.2569
 
Base Pair (265:283)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.1* -- 0.7* 3.7 0.2 0.2 1.1 0.5 5.3* -- -- -- -- -- -- 0.4 87.0568
 
Base Pair (266:282)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 0.2* 0.9* 7.4* -- -- 0.9 0.4 0.4 -- 0.2 -- 0.2 -- -- -- 89.4567
 
Base Pair (267:281)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.2 1.1 1.2 0.2 -- 0.2 0.2* -- 0.4* -- -- -- -- 0.5 6.9* 89.3569
 
Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)