Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 289


Base Pair (289:324)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.2* 0.3* -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 99.2573
Base Pair (290:323)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (291:322)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.2* 0.5* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (292:321)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* -- 0.3* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- 99.2573
 
Base Pair (293:320)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.3* 0.2* -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.2573
 
Base Pair (294:319)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.5 -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (295:318)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.2* 0.5* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.2573
 
Base Pair (296:317)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.5* 0.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (297:316)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.3* 0.2* 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (298:315)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 0.5 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (299:314)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.2* 0.3* -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.2573
 
Base Pair (300:313)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* -- 0.3* 0.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.2573
 
Base Pair (301:312)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* -- -- 0.3* -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (302:311)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.3* 0.2* -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (303:310)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 0.5 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (304:309)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.5* -- -- -- -- -- 0.2* -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)