Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 325


Base Pair (325:377)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 58.2* 0.5* 2.6* 27.1* 1.6 -- -- 1.0 1.0 -- -- -- -- -- -- -- 7.8572
Base Pair (326:376)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 3.3* 1.6* 38.2* 30.5* -- 16.8 0.2 -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.9 0.4 7.9570
 
Base Pair (327:375)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 76.2* 1.4* 4.9* 2.6* 0.2 -- -- 1.1 -- -- 2.5 0.4 0.4 1.6 0.9 -- 8.1571
 
Base Pair (328:374)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 22.2* 27.3* 3.5* 5.6* 1.2 26.4 -- -- 0.2 -- -- -- 0.2 -- 0.2 5.2 8.0572
 
Base Pair (329:373)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.0* 20.1* 26.0 3.1 -- 0.3 28.5* 0.2 1.6 0.9 -- -- 6.1 0.9 0.3 0.3* 10.5572
 
Base Pair (330:372)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.7* 66.8* 3.3* 1.0 4.0 0.2 -- -- 0.3 -- -- 6.1 -- -- 0.9 16.7572
 
Base Pair (331:371)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3* 20.5* 14.9* 18.9* 1.7 4.0 1.0 -- 0.3 5.4 -- 0.7 0.2 -- 0.2 0.2 31.7572
 
Base Pair (332:370)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2 1.4* 0.2 0.2 0.7* -- 0.3* -- -- -- -- -- -- -- 0.2* -- 97.0572
 

Base Pair (333:368)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2 0.2 -- 1.7 0.9 -- 4.2* 0.9 0.5 -- -- 0.5 0.3 1.4* 0.2 1.0* 88.1573
 
Base Pair (334:367)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.7 3.1 0.9* -- 8.2* 1.6 0.3 0.9 -- 0.3 0.3 -- -- 0.7 82.9573
 
Base Pair (335:366)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.5* -- 3.0 2.1* -- -- 1.6 -- -- 12.2* 0.9 7.2 0.5 -- -- 0.2 71.8573
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)