Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 436


Base Pair (436:599)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 3.8* 15.2 9.3 1.4* 1.6 31.3* 0.3 -- 1.0 -- 0.3 -- -- 0.2* 0.2 35.3572
Base Pair (437:598)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 44.1* 3.8* 32.5* 6.6 3.0 0.3 0.2 1.2 3.7 -- 0.3 -- 0.2 0.2 0.3 3.2572
 
Base Pair (438:597)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.7* 51.2* 4.4* 3.5* -- 1.6 -- 0.2 -- 0.7 -- 0.2 -- -- -- -- 36.6572
 
Base Pair (439:596)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.9* 39.9* 4.0* 3.1* -- 10.1 -- -- -- 0.7 -- 0.3 -- -- -- 0.2 40.8572
 
Base Pair (440:595)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 18.0* 0.7 4.5 8.6* 3.8 17.7* 0.2 -- 0.2 -- -- 0.2 0.3 0.2 0.2 0.9 44.6572
 

Base Pair (442:593)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3 0.2 34.8* 1.0* 0.2 18.9 -- -- 0.3 0.3 0.2* -- -- 0.5* -- 0.2 42.9572
 
Base Pair (443:592)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 29.7* -- 1.9* 5.9* 16.8 -- -- -- -- 0.2 0.2 0.2 0.3 -- 0.2 0.3 44.4573
 
Base Pair (444:591)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.6* -- 2.3* 47.1* 1.6 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.3 47.0573
 
Base Pair (445:590)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2* 0.9* 3.8* 18.2* 0.2 0.2 0.3 -- -- -- 0.2 -- -- -- 0.2 0.5 74.3573
 
Base Pair (446:589)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.0* 20.4* 0.7* -- 0.9 -- -- 0.2 -- -- -- -- -- 0.9 0.2 75.7573
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)