Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 45


Base Pair (45:69)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 27.6* 0.2* 2.1* 32.1* 6.8 0.2 0.2 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- 30.6514
Base Pair (46:68)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.3* 24.9* 37.0* 2.9* -- 1.9 -- -- -- 0.6 0.2 -- -- -- -- 0.2 30.1519
 
Base Pair (47:67)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 40.4* 0.6* 0.6* 26.7* -- 0.2 -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 31.4520
 
Base Pair (48:66)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 61.7* 0.2* 1.2* 3.1* 0.2 0.2 -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 33.3520
 
Base Pair (49:65)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.0* -- 0.6 34.0* 0.2 0.8* 0.4 0.2 -- -- -- 0.2 -- -- -- -- 58.7515
 

Base Pair (50:63)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.6* 32.2* 1.3* -- -- -- -- -- -- -- -- 0.8 -- -- 0.2 65.0519
 
Base Pair (51:62)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.3* 0.9* -- -- 0.3 0.2 0.2* -- -- -- -- -- -- 0.2 -- 97.9572
 
Base Pair (52:61)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.2* 0.2* 0.3* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (53:60)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* -- 0.3* -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)