Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 480


Base Pair (480:551)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 2.8 0.7 -- -- 16.8* -- -- -- 0.2* -- -- -- -- 0.2 1.6 77.8573
Base Pair (481:550)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 17.8* 0.3* -- 0.2* 2.3 -- -- -- 0.9 -- 0.2 -- 0.2 0.2 -- 77.9573
 
Base Pair (482:549)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 17.5* -- 2.4* -- 0.2 -- -- 0.2 -- -- 0.2 -- 0.9 -- 0.2 78.5573
 
Base Pair (483:548)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.2 0.3 1.2* 0.2 0.7* 0.2 -- -- 0.2* -- 0.2 -- -- -- -- 96.9573
 
Base Pair (484:547)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.2 2.1* 0.3 0.2 0.7 -- -- -- 1.2 -- 0.5* 0.3 0.2* 0.2 0.3 93.6573
 
Base Pair (485:546)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2 -- 0.2* 1.2 4.2* 0.2 -- 0.7 -- -- 1.2* 0.3 -- 0.2 -- -- 91.5573
 

Base Pair (491:545)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 1.4 0.3 0.3 -- -- -- -- -- 1.2 -- 0.2* -- 11.5* 84.9573
 
Base Pair (492:544)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.9* 1.2 11.2* 0.7 0.4 0.2* 0.2 -- -- -- 0.9 -- -- 3.2 81.4569
 
Base Pair (493:543)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 2.4 0.5 1.0* 0.3 1.9 0.5 -- -- 2.1* -- 1.6 -- 9.4* -- 0.2 79.9572
 
Base Pair (494:542)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2 1.4* 1.9 0.3 1.2 0.2 2.4 0.7* -- 5.8 -- 0.9 6.1* -- -- -- 78.9573
 
Base Pair (495:541)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3 -- 1.7* 3.3* 0.2 -- 2.8 0.3 0.3 7.9 15.0* 1.4 0.2 -- 1.2 0.7 64.3572
 
Base Pair (496:540)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 4.2 0.7 16.8* 1.1 1.4* 0.9 0.4 0.5 7.2* 1.2 5.1* -- 1.8 -- 1.1 -- 57.9571
 
Base Pair (497:539)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.1* 0.4* 0.5 2.3 -- -- 8.4* 0.7 0.2 -- -- 6.5 0.2 -- -- 16.8* 63.2571
 
Base Pair (498:538)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 1.6 1.7 -- 0.3 0.7* 0.2 -- -- -- 0.7 -- -- -- 16.4* 78.4572
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)