Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 555


Base Pair (555:585)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 0.4 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.7570
Base Pair (556:584)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.2* 0.3* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3573
 
Base Pair (557:583)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.5* -- 0.2* -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- 99.0573
 
Base Pair (558:582)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3* -- 0.2* 0.7* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- 98.6573
 
Base Pair (559:581)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.3* -- 0.2* 0.5* -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 98.7573
 
Base Pair (560:580)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* -- 0.2* 0.7* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 98.8573
 

Base Pair (561:574)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 19.0* 0.3* 0.3* -- 1.2 -- -- 0.7 1.6 -- 0.3 0.3 0.3 -- 0.3 75.3573
 
Base Pair (562:573)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.3 -- 0.3 -- 0.2 4.7 8.4 9.3* -- -- 0.3* -- -- 0.2* 0.3 75.8572
 
Base Pair (563:572)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.0 0.3* 0.5 1.2* -- 3.5 0.2 16.1* 0.2 0.2* -- -- 0.3 -- 0.3 76.2573
 
Base Pair (564:571)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 5.1 -- -- 1.7 7.0* 1.6 -- 0.2 1.9* -- 0.2* 0.2 0.3 81.9572
 
Base Pair (565:570)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.7* -- 0.3* -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.7 -- -- 97.9572
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)