Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 608

Base Pair (608:685)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 26.3* 2.0* 2.5* 49.5* 10.8 0.2 0.5 -- 0.7 -- -- -- -- 0.2 0.4 0.2 6.7555
Base Pair (609:684)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 24.5* 61.1* 2.0* 5.6* 0.9 -- -- -- 0.2 -- -- 0.2 1.1 1.3 0.2 0.4 2.8555
 
Base Pair (610:683)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 27.0* 65.1* 1.4* -- 0.7 2.3 -- -- 0.9 0.4 0.2 -- -- 0.4 0.5 0.9556
 
Base Pair (611:682)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 24.5* 65.3* 5.2* 1.3* 0.4 0.4 -- 0.2 -- 0.2 -- -- -- -- 0.2 1.6 0.9556
 
Base Pair (612:681)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 3.9* 2.0* 64.3* 23.0 2.2 0.7 0.9 0.5 0.4 -- 0.5 0.4 -- -- 0.2 0.9557
 
Base Pair (613:680)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.4* 0.7* 0.4* 91.2* 0.4 -- 0.7 -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 4.9557
 
Base Pair (616:676)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.0* -- 19.4* 37.2* 0.2 0.5 0.2 0.5 3.0 -- -- 0.5 -- -- -- -- 37.5573
 
Base Pair (617:675)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 9.1* 0.7* 38.0* 0.3* 0.3 15.4 0.7 0.2 0.2 0.2 -- -- -- 0.2 0.2 2.6 31.9573
 
Base Pair (618:674)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 27.3* 0.5* 2.1 34.9* 0.2 -- -- 0.7 0.4 -- 0.2 0.2 0.2 -- 0.9 32.6571
 
Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)