Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 70


Base Pair (70:87)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.5* 59.3* 6.2* 0.9* -- 1.4 -- -- -- 0.2 -- 0.2 -- -- 0.2 0.9 30.3560
Base Pair (71:86)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.3* 1.4* 2.9* 60.6* 0.5 -- 0.4 -- 0.2 -- -- 1.4 -- -- -- 1.3 30.0559
 
Base Pair (72:85)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.5* 9.5* 33.2* 1.5* -- 20.4 0.2 -- 0.2 -- 0.2 1.3 -- -- 0.4 -- 31.9549
 
Base Pair (73:84)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.4* 23.6 5.0 2.0* 0.2 34.7* 0.2 -- 0.7 0.2* -- 0.2 -- -- -- 0.2 31.7559
 
Base Pair (74:83)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 28.4* 34.9* 0.2* 0.2 1.1 0.4 -- -- -- -- -- 0.5 -- -- -- 34.2559
 
Base Pair (75:82)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 18.7* 38.1* 1.6* 0.2 0.9 -- -- -- -- -- -- -- 0.2 0.9 1.1 38.4557
 

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