Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 831


Base Pair (831:864)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 67.9* 0.2* -- 1.6* 30.0 -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- --560
Base Pair (832:863)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 99.3 -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5560
 
Base Pair (833:862)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.7 -- -- 0.4 98.4* -- -- 0.2* -- -- -- 0.2 0.2 -- -- -- --561
 
Base Pair (834:861)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 60.6* -- 0.2* -- -- -- -- -- 2.3 -- 36.5 -- -- -- -- 0.4561
 
Base Pair (835:860)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 75.0* 23.9* -- -- 0.5 -- -- 0.4 -- 0.2 -- -- -- -- -- --561
 
Base Pair (836:859)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 99.1* -- -- 0.7* 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --559
 
Base Pair (837:858)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 43.4* 0.4* 52.5* 1.8* 0.2 0.7 0.2 -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.7 -- --562
 
Base Pair (838:857)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.3* -- -- 97.5* 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --562
 
Base Pair (839:856)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.8 1.1 0.2* -- 59.3* 0.2 -- -- 37.5* -- -- -- -- -- -- --562
 

Base Pair (840:853)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 99.5* -- -- 0.4* -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- --563
 
Base Pair (841:852)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 5.2* -- 94.5* -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- --561
 
Base Pair (842:851)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 39.7* 0.2* 1.2* 23.0* 33.3 0.4 -- 0.9 -- -- 0.2 0.2 0.2 -- 0.7 -- 0.2562
 
Base Pair (843:850)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 37.7* 0.4* 0.7* 49.9* 9.9 0.4 -- 0.2 -- -- 0.2 -- 0.2 -- -- 0.5 --557
 
Base Pair (844:849)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 21.1* 1.4 7.1 2.1 0.4 4.6* 34.3* 23.6 1.4 0.9 -- 0.2* 0.9 -- -- 1.4 0.5560
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12)