Group IIB Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 868


Base Pair (868:900)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 45.4* 0.6* 0.8* 4.1* 31.3 -- -- 9.6 0.4 -- 1.0 1.4 0.2 -- 0.8 3.3 1.2511
Base Pair (869:899)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 35.5* 1.6* 34.4* 3.3* 24.8 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 0.2512
 
Base Pair (870:898)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 42.8* 0.4* -- 36.1* 0.6 -- -- 19.7 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4512
 
Base Pair (871:897)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 37.1 0.2* -- 1.1 61.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2528
 

Base Pair (872:895)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.6 2.8* 0.2 1.3 61.5* -- 21.5* -- 10.9 -- -- -- 0.4 -- -- -- 0.8530
 
Base Pair (873:894)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 97.9* -- -- 0.8* 0.4 0.2* -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- 0.6530
 
Base Pair (874:893)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 20.9* -- 0.4* 33.9* 33.7 -- -- 1.5 -- -- 0.2 -- -- -- 0.2 -- 9.2531
 

Base Pair (878:889)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 3.3* 0.2* 17.3* 4.7* 0.3 1.2 -- -- -- 0.2 -- 0.2 -- -- -- 0.2 72.4572
 
Base Pair (879:888)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 19.9* 3.0* 3.8* -- 0.5 -- -- -- 0.5 -- 0.3 -- -- -- 0.2 71.5572
 
Base Pair (880:887)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.4* 20.8* 2.4* 0.2* 0.2 2.4 -- -- -- 1.4 0.2 -- -- -- -- -- 71.0572
 
Base Pair (881:886)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.3* 1.2* 17.3* 2.1* 0.2 1.9 0.3 -- 0.7 0.5 -- -- 0.2 0.2 -- 0.7 72.4572
 

Last generated : Thu Oct 5 2000 (16 : 12 )