tRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 15


Base Pair (15:48) ( Tertiary )
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
Z *80.4 *0.2 *0.1 *14.0 0.9 -- 0.3 1.6 0.3 -- 0.3 0.2 0.7 0.5 0.2 -- 0.1 878
A *84.4 -- 1.6 -- -- -- *3.1 -- 3.1 -- -- -- 7.8 -- -- -- -- 64
R *43.3 -- -- *56.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 60
N *62.9 -- -- *34.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.9 -- -- 35
D *68.6 -- -- *22.9 -- -- -- -- -- -- 2.9 5.7 -- -- -- -- -- 35
C 88.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 11.1 -- -- -- 18
X *92.1 *1.6 -- *3.2 -- -- -- 1.6 -- -- 1.6 -- -- -- -- -- -- 63
E *85.7 -- -- 2.0 -- -- -- 8.2 *2.0 -- -- -- -- -- 2.0 -- -- 49
Q *77.1 -- -- *22.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 35
G *52.2 -- -- *27.5 10.1 -- -- 7.2 -- -- -- -- -- 1.4 1.4 -- -- 69
H *92.1 -- -- *5.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.6 -- -- -- 38
I *85.7 -- -- *5.4 -- -- -- 8.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 56
K *76.5 -- -- *23.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 51
M 97.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 3.0 -- -- -- 33
F 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 53
P *94.3 -- -- *3.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.9 53
T *85.4 -- -- *10.4 -- -- -- -- -- -- 2.1 -- 2.1 -- -- -- -- 48
W *48.3 -- -- *48.3 -- -- 3.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 29
Y 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 46
V *96.9 -- -- *1.6 1.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 64


Last modified on Tue Aug 18 16:31:31 1998 using program web_freq.