tRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 18


Base Pair (18:55) ( Tertiary )
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
Z 0.1 -- -- -- *99.6 *0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 -- 895
A 1.6 -- -- -- 98.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 64
R -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 62
N -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 35
D -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 35
C -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 19
X -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 65
E -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 49
Q -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 35
G -- -- -- -- *97.1 *2.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 69
H -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 38
I -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 56
K -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 53
M -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 36
F -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 54
P -- -- -- -- 98.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.8 -- 55
T -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 49
W -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 30
Y -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 47
V -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 65


Last modified on Tue Aug 18 16:31:31 1998 using program web_freq.