| Base Pair (26:44) ( Tertiary ) | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| Z | 2.5 | 1.0 | 4.4 | 6.8 | 2.7 | 0.6 | 11.3 | 6.0 | *15.7 | 1.0 | 0.4 | *2.1 | *39.3 | 0.9 | *3.8 | 1.3 | 0.1 | 893 |
| A | -- | -- | 4.7 | 3.1 | 1.6 | -- | 1.6 | -- | *9.4 | -- | -- | -- | *79.7 | -- | -- | -- | -- | 64 |
| R | -- | 3.2 | 3.2 | 9.7 | 1.6 | -- | 8.1 | 9.7 | *21.0 | -- | -- | -- | *43.5 | -- | -- | -- | -- | 62 |
| N | -- | *2.9 | 2.9 | *14.3 | 20.0 | -- | 8.6 | 2.9 | -- | -- | -- | -- | *40.0 | -- | *8.6 | -- | -- | 35 |
| D | *2.9 | -- | -- | 8.6 | -- | -- | *25.7 | 2.9 | 5.7 | 22.9 | -- | -- | 25.7 | 2.9 | -- | *2.9 | -- | 35 |
| C | -- | -- | -- | *42.1 | 5.3 | -- | 10.5 | 15.8 | 15.8 | -- | -- | 5.3 | -- | *5.3 | -- | -- | -- | 19 |
| X | -- | -- | -- | -- | 1.6 | -- | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 95.3 | -- | -- | -- | -- | 64 |
| E | 2.0 | *2.0 | 2.0 | 16.3 | -- | 2.0 | *26.5 | 20.4 | 6.1 | -- | -- | -- | -- | -- | *20.4 | 2.0 | -- | 49 |
| Q | 5.7 | *2.9 | 2.9 | 8.6 | -- | 5.7 | -- | *25.7 | 5.7 | -- | -- | 2.9 | *2.9 | -- | 25.7 | *11.4 | -- | 35 |
| G | 13.0 | 4.3 | 8.7 | 8.7 | -- | -- | 11.6 | 1.4 | *13.0 | 1.4 | 5.8 | *11.6 | *13.0 | 1.4 | -- | 5.8 | -- | 69 |
| H | 2.6 | -- | *5.3 | 2.6 | -- | -- | 10.5 | *39.5 | -- | -- | -- | *21.1 | -- | -- | 18.4 | -- | -- | 38 |
| I | 1.8 | -- | -- | 5.4 | 3.6 | -- | 16.1 | *7.1 | 3.6 | -- | -- | -- | *60.7 | -- | 1.8 | -- | -- | 56 |
| K | 7.5 | -- | -- | 11.3 | 5.7 | -- | 3.8 | 1.9 | *58.5 | -- | -- | -- | *9.4 | -- | -- | -- | 1.9 | 53 |
| M | -- | -- | -- | 2.8 | 2.8 | -- | 5.6 | 2.8 | *36.1 | -- | -- | -- | *50.0 | -- | -- | -- | -- | 36 |
| F | -- | -- | -- | -- | 5.7 | -- | -- | 1.9 | *34.0 | -- | -- | -- | *54.7 | 3.8 | -- | -- | -- | 53 |
| P | -- | 1.8 | *40.0 | 1.8 | -- | -- | 1.8 | -- | *36.4 | -- | -- | -- | 14.5 | -- | -- | 3.6 | -- | 55 |
| T | -- | -- | 2.0 | 8.2 | *8.2 | -- | *51.0 | -- | 8.2 | -- | -- | -- | 20.4 | 2.0 | -- | -- | -- | 49 |
| W | 10.0 | -- | -- | 6.7 | -- | 6.7 | -- | 3.3 | *13.3 | -- | -- | -- | *53.3 | 6.7 | -- | -- | -- | 30 |
| Y | -- | -- | -- | 4.3 | 29.8 | -- | -- | *10.6 | -- | -- | -- | -- | *51.1 | -- | 2.1 | -- | 2.1 | 47 |
| V | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 23.1 | -- | *15.4 | -- | -- | *1.5 | *53.8 | -- | *6.2 | -- | -- | 65 |
| Base Pair (27:43) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| Z | *6.0 | *43.9 | *26.1 | *7.7 | 6.5 | 5.5 | 0.3 | 0.2 | -- | 1.3 | 0.7 | 0.4 | 0.7 | -- | 0.2 | 0.3 | -- | 893 |
| A | -- | *95.3 | *3.1 | -- | -- | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 64 |
| R | *3.2 | *45.2 | *25.8 | *8.1 | 6.5 | 4.8 | -- | -- | -- | 4.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.6 | -- | 62 |
| N | *8.6 | *17.1 | *28.6 | *20.0 | 20.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.7 | -- | -- | -- | -- | 35 |
| D | *5.7 | *85.7 | *2.9 | *2.9 | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| C | 10.5 | -- | *10.5 | 5.3 | *57.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.3 | 10.5 | -- | 19 |
| X | *9.2 | *66.2 | *18.5 | *6.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
| E | -- | *57.1 | *18.4 | -- | -- | 20.4 | -- | -- | -- | 4.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 49 |
| Q | *2.9 | *31.4 | *25.7 | *17.1 | 14.3 | 2.9 | -- | 5.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| G | *7.2 | *36.2 | *37.7 | *4.3 | 5.8 | 1.4 | -- | -- | -- | 5.8 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| H | *28.9 | *60.5 | *5.3 | *5.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 38 |
| I | 1.8 | *60.7 | *21.4 | -- | *3.6 | 7.1 | -- | -- | -- | 1.8 | -- | -- | 3.6 | -- | -- | -- | -- | 56 |
| K | *1.9 | *11.3 | *58.5 | *11.3 | 5.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 7.5 | 3.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 53 |
| M | 2.9 | 25.7 | 28.6 | -- | *2.9 | *37.1 | -- | -- | -- | -- | *2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| F | *20.4 | *14.8 | *46.3 | *13.0 | 3.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.9 | -- | -- | 54 |
| P | -- | *59.3 | *29.6 | *5.6 | -- | 5.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 54 |
| T | *2.0 | *42.9 | *10.2 | *38.8 | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.1 | -- | -- | -- | -- | 49 |
| W | *3.3 | *23.3 | *43.3 | *13.3 | -- | 13.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 30 |
| Y | 27.7 | *4.3 | *6.4 | 12.8 | *44.7 | -- | -- | *2.1 | -- | -- | -- | 2.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 47 |
| V | *4.6 | *27.7 | *47.7 | *1.5 | -- | 10.8 | 4.6 | -- | -- | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
| Base Pair (28:42) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| Z | *11.3 | *41.3 | *28.4 | *14.2 | 1.6 | 2.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | -- | 894 |
| A | *1.6 | *57.8 | *37.5 | *3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 64 |
| R | *16.1 | *25.8 | *35.5 | *12.9 | 9.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 62 |
| N | *8.6 | *25.7 | *57.1 | *2.9 | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.9 | -- | 35 |
| D | *14.3 | *71.4 | *5.7 | *8.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| C | *15.8 | *42.1 | -- | *26.3 | 10.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.3 | -- | 19 |
| X | *3.1 | *29.7 | *45.3 | *17.2 | 3.1 | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 64 |
| E | *20.4 | *61.2 | *8.2 | *6.1 | -- | 4.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 49 |
| Q | *14.3 | *37.1 | *31.4 | *14.3 | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| G | *20.3 | *39.1 | *17.4 | *11.6 | -- | 11.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| H | *2.6 | *26.3 | *44.7 | *23.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.6 | -- | 38 |
| I | *26.8 | *26.8 | *14.3 | *28.6 | -- | 3.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 56 |
| K | *24.5 | *39.6 | *28.3 | *7.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 53 |
| M | *2.8 | *36.1 | *13.9 | *25.0 | -- | 22.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 36 |
| F | *5.6 | *38.9 | *37.0 | *18.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 54 |
| P | *3.6 | *20.0 | *61.8 | *7.3 | 7.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 55 |
| T | *6.1 | *61.2 | *18.4 | *10.2 | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | -- | 49 |
| W | *23.3 | *46.7 | *10.0 | *16.7 | -- | 3.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 30 |
| Y | *6.4 | *51.1 | *4.3 | *38.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 47 |
| V | *3.1 | *69.2 | *26.2 | *1.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
| Base Pair (29:41) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| Z | *35.7 | *22.6 | *23.8 | *17.6 | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 894 |
| A | *31.2 | *21.9 | *43.8 | *3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 64 |
| R | *33.9 | *12.9 | *46.8 | *4.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 62 |
| N | *11.4 | *77.1 | *8.6 | *2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| D | *25.7 | *42.9 | *25.7 | *5.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| C | *73.7 | *10.5 | -- | *15.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 19 |
| X | *86.2 | *1.5 | -- | *12.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
| E | *36.7 | *16.3 | *36.7 | *10.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 49 |
| Q | *82.9 | *8.6 | -- | *5.7 | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| G | *10.1 | *10.1 | *15.9 | *63.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| H | *65.8 | -- | *13.2 | *21.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 38 |
| I | *16.1 | *83.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 56 |
| K | *13.2 | *17.0 | *37.7 | *32.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 53 |
| M | *47.2 | *25.0 | *11.1 | *16.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 36 |
| F | *29.6 | *3.7 | *3.7 | *63.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 54 |
| P | *14.8 | *48.1 | *35.2 | *1.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 54 |
| T | *32.7 | *12.2 | *46.9 | *6.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | -- | -- | -- | 49 |
| W | *60.0 | *10.0 | *30.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 30 |
| Y | *70.2 | *4.3 | *6.4 | *19.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 47 |
| V | *7.7 | *20.0 | *50.8 | *21.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
| Base Pair (30:40) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| Z | *69.2 | *25.4 | *0.3 | *1.1 | 2.0 | 1.2 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.6 | -- | 895 |
| A | *48.4 | *42.2 | -- | -- | 7.8 | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 64 |
| R | *75.8 | *11.3 | -- | *6.5 | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | 62 |
| N | *88.6 | *2.9 | -- | -- | 5.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| D | *48.6 | *40.0 | -- | -- | 8.6 | -- | -- | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| C | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 19 |
| X | 96.9 | -- | -- | -- | 3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
| E | *32.7 | *67.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 49 |
| Q | *82.9 | *11.4 | -- | -- | 5.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| G | *59.4 | *34.8 | *2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.9 | -- | 69 |
| H | *65.8 | *31.6 | -- | -- | 2.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 38 |
| I | *30.4 | *44.6 | -- | *10.7 | -- | 14.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 56 |
| K | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 53 |
| M | *61.1 | *38.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 36 |
| F | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 54 |
| P | *80.0 | *12.7 | *1.8 | -- | 1.8 | 1.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.8 | -- | 55 |
| T | *42.9 | *55.1 | -- | -- | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 49 |
| W | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 30 |
| Y | 89.4 | -- | -- | -- | 10.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 47 |
| V | *50.8 | *49.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
| Base Pair (31:39) | ||||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| Z | *24.5 | *36.0 | *5.7 | *28.7 | 0.7 | 3.1 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 1.0 | -- | 895 |
| A | *1.6 | *87.5 | *1.6 | *3.1 | -- | 6.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 64 |
| R | *25.8 | *33.9 | *11.3 | *27.4 | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 62 |
| N | *80.0 | *2.9 | -- | *17.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| D | -- | *85.7 | *8.6 | *5.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| C | -- | *21.1 | *15.8 | *63.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 19 |
| X | *95.4 | -- | -- | -- | 3.1 | *1.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
| E | *51.0 | *32.7 | *2.0 | -- | -- | 14.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 49 |
| Q | *22.9 | *11.4 | *8.6 | *57.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 35 |
| G | *2.9 | *87.0 | -- | *5.8 | -- | 4.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| H | *23.7 | *5.3 | -- | *65.8 | 5.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 38 |
| I | *37.5 | *46.4 | -- | *14.3 | -- | 1.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 56 |
| K | *28.3 | -- | *1.9 | *67.9 | 1.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 53 |
| M | *19.4 | 2.8 | -- | *16.7 | -- | *30.6 | -- | -- | 2.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 2.8 | 25.0 | -- | 36 |
| F | *1.9 | -- | -- | *98.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 54 |
| P | *32.7 | *43.6 | *12.7 | *9.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 55 |
| T | -- | *38.8 | *10.2 | *51.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 49 |
| W | -- | -- | *60.0 | *36.7 | -- | 3.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 30 |
| Y | *6.4 | -- | *2.1 | *91.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 47 |
| V | *7.7 | *89.2 | *3.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65 |
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