tRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 8


Base Pair (8:14) ( Tertiary )
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
Z -- -- *98.6 *0.1 -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- *0.2 0.2 0.2 0.5 883
A -- -- 96.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 3.2 -- -- 63
R -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 61
N -- -- 97.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.9 -- 34
D -- -- *94.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- *5.9 -- -- -- 34
C -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 18
X -- -- 98.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.5 -- 65
E -- *4.1 *95.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 49
Q -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 34
G -- -- *98.5 -- -- -- -- *1.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 68
H -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 38
I -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 55
K -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 53
M -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 35
F -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 53
P -- -- 98.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.8 55
T -- -- *95.7 *2.1 -- 2.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 47
W -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 30
Y -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 47
V -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 65


Last modified on Tue Aug 18 16:31:31 1998 using program web_freq.