Thermus thermophilus 16S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (25 of 48)
| Basepair (656:700)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
57.6* |
9.6* |
10.3* |
14.8* |
3.9 |
1.0 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.1 |
0.7 |
0.1 |
0.1 |
0.7 | 7133 |
| 3 |
64.7* |
9.4* |
3.6* |
16.4* |
4.5 |
0.5 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 6073 |
| B |
76.4* |
-- |
-- |
17.0* |
5.6 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 | 4820 |
| A |
96.9* |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 228 |
| C |
89.5* |
-- |
-- |
3.5* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.8 |
-- |
-- |
0.6 | 171 |
| E |
2.4* |
54.6* |
21.1* |
17.7* |
0.7 |
2.8 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 | 1025 |
| M |
3.1* |
13.3* |
58.2* |
6.5* |
0.3 |
4.4 |
0.7 |
0.2 |
0.3 |
6.4 |
-- |
0.1 |
0.6 |
1.0 |
0.6 |
0.4 |
3.8 | 890 |
| |
| Basepair (657:699)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
17.4 |
0.1* |
0.2 |
0.7* |
0.1 |
0.1 |
8.7 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
71.5* |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 | 7153 |
| 3 |
19.6 |
0.1 |
-- |
0.8* |
0.1 |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
79.2* |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 6092 |
| B |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 4834 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 232 |
| C |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.5 |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 171 |
| E |
92.9* |
0.5 |
-- |
4.7* |
0.4 |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 | 1027 |
| M |
5.6* |
-- |
1.6 |
0.4 |
-- |
0.1 |
69.5* |
0.2 |
1.7 |
0.9 |
-- |
-- |
14.3 |
0.2 |
0.2 |
0.2* |
5.1 | 891 |
| |
| Basepair (658:698)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
17.5 |
0.7 |
-- |
0.1* |
80.3* |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.7 | 7129 |
| 3 |
-- |
-- |
20.4 |
-- |
-- |
-- |
78.8* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1* |
-- |
0.1 | 6068 |
| B |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4811 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| C |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 171 |
| E |
-- |
-- |
96.5* |
0.1* |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
0.4 |
-- |
0.5 | 1024 |
| M |
0.1* |
-- |
0.7 |
5.8 |
-- |
0.3* |
87.2* |
0.1 |
1.1 |
0.2 |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
4.0 | 891 |
| |
| Basepair (659:697)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
3.7 |
0.1 |
0.1 |
2.1 |
0.5 |
91.5* |
0.1 |
-- |
-- |
0.4* |
0.1 |
-- |
0.1* |
0.7 | 7168 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 6108 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4845 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 | 171 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 1031 |
| M |
1.9 |
1.3 |
0.8 |
29.9 |
0.9 |
0.2 |
16.9 |
4.0 |
33.8* |
1.0 |
-- |
0.1 |
3.3* |
0.3 |
-- |
1.1* |
4.3 | 890 |
| |
| Basepair (660:696)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2 |
5.1 |
28.6 |
0.4 |
0.1* |
51.6* |
2.2 |
1.5* |
0.4 |
6.4* |
0.2 |
0.8 |
0.3 |
0.1 |
1.0 |
0.5 |
0.5 | 7166 |
| 3 |
-- |
5.2 |
29.7 |
-- |
-- |
58.8* |
0.1 |
-- |
-- |
5.4* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 6104 |
| B |
-- |
2.4 |
19.5 |
-- |
-- |
72.3* |
-- |
-- |
-- |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 4843 |
| A |
-- |
87.5 |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
9.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 232 |
| C |
-- |
1.8* |
74.9* |
-- |
-- |
19.9 |
-- |
-- |
0.6 |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 | 171 |
| E |
-- |
-- |
84.2* |
-- |
-- |
8.2 |
0.4 |
-- |
-- |
5.6 |
-- |
0.9* |
-- |
-- |
0.7 |
0.1 |
-- | 1030 |
| M |
1.8* |
4.8 |
12.1 |
3.3 |
1.0 |
8.5* |
17.4* |
11.9 |
3.5 |
14.1 |
1.7 |
2.5* |
2.0 |
0.4 |
7.1 |
3.8 |
4.1 | 892 |
| |
| Basepair (661:695)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.3* |
1.3* |
87.1* |
2.0* |
0.7 |
1.6 |
0.4 |
0.6 |
0.1 |
0.7 |
0.8 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.9 |
0.7 | 7152 |
| 3 |
2.3* |
0.6* |
93.5* |
1.8* |
0.2 |
1.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 6091 |
| B |
1.6* |
-- |
96.3* |
1.4* |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4839 |
| A |
19.0* |
7.5* |
55.8* |
-- |
-- |
17.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 226 |
| C |
-- |
4.1* |
94.2* |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 171 |
| E |
2.0* |
1.9* |
88.6* |
3.7* |
0.4 |
2.6 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 1027 |
| M |
2.1 |
5.3 |
42.5* |
3.8 |
4.3* |
3.7 |
2.8 |
4.7 |
1.0* |
4.8 |
6.3* |
4.2 |
0.3 |
-- |
2.5 |
6.7 |
4.9 | 891 |
| |
| Basepair (662:694)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.6* |
62.6* |
19.0* |
4.3* |
0.4 |
2.0 |
0.3 |
0.6 |
0.1 |
0.8 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.9 |
0.2 |
0.2 |
0.5 | 7143 |
| 3 |
7.2* |
71.1* |
16.7* |
2.4* |
0.1 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 6083 |
| B |
4.0* |
79.3* |
13.6* |
1.9* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4825 |
| A |
-- |
60.4* |
29.1* |
9.1* |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 230 |
| C |
-- |
36.3* |
59.6* |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 171 |
| E |
23.4* |
35.2* |
28.1* |
3.3* |
0.4 |
8.6 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 1029 |
| M |
12.4* |
9.7* |
27.3* |
18.4* |
2.8 |
1.7 |
1.9 |
4.4 |
0.8 |
5.3 |
1.2 |
0.9 |
0.7 |
7.1 |
1.6 |
1.7 |
2.1 | 890 |
| |
| Basepair (663:693)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.3* |
77.2* |
6.9* |
4.4* |
0.3 |
1.3 |
0.4 |
0.1 |
1.0 |
0.7 |
0.3 |
0.8 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
1.7 | 7140 |
| 3 |
4.9* |
84.1* |
3.6* |
4.7* |
0.3 |
1.1 |
-- |
-- |
1.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 6078 |
| B |
4.8* |
89.6* |
3.4* |
1.3* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4820 |
| A |
7.4* |
84.8* |
3.9* |
0.9* |
1.7 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 230 |
| C |
-- |
86.5* |
7.0* |
-- |
0.6* |
2.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
2.3 |
-- | 171 |
| E |
4.9* |
58.0* |
4.4* |
20.9* |
1.1 |
3.6 |
0.2 |
-- |
6.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- | 1029 |
| M |
1.2* |
29.1* |
29.6* |
3.3* |
0.6 |
2.8 |
2.8 |
0.3 |
-- |
5.3 |
2.5 |
5.7 |
0.2 |
0.1 |
0.7 |
1.3 |
14.5 | 892 |
| |
| Basepair (664:692)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.5* |
15.7* |
29.6* |
35.8* |
0.7 |
0.7 |
0.5 |
0.6 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.2 | 7151 |
| 3 |
15.9* |
15.4* |
32.8* |
33.5* |
0.5 |
0.7 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 6089 |
| B |
10.5* |
16.7* |
40.6* |
31.2* |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 4833 |
| A |
10.3* |
49.1* |
4.7* |
20.7* |
9.5 |
4.7 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 232 |
| C |
1.8* |
62.0* |
25.7* |
5.8* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
2.3 |
-- | 171 |
| E |
42.5* |
1.6 |
2.3 |
46.9* |
0.7 |
3.1* |
0.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 1025 |
| M |
7.4* |
9.1* |
8.3* |
57.6* |
2.1 |
0.3 |
3.5 |
4.7 |
0.6 |
0.6 |
0.8 |
0.9 |
1.1 |
0.1 |
0.6 |
1.0 |
1.2 | 892 |
| |
| Basepair (665:691)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
38.4* |
12.1* |
15.1* |
26.0* |
2.9 |
0.5 |
1.8 |
0.6 |
0.4 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.4 |
0.3 |
0.5 |
0.3 |
0.1 | 7141 |
| 3 |
42.4* |
12.9* |
15.8* |
23.6* |
3.2 |
0.5 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
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0.3 |
0.3 |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
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16.4* |
32.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
52.6* |
-- |
9.4* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| E |
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16.7* |
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-- |
-- |
0.9 |
0.2 |
-- |
1.7 |
1.8 |
1.6 |
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|
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-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
1.5 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
7.0 |
-- |
-- |
3.5 |
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-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| |
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|
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| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
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| AG
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| CC
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| gap
| Seq
|
|---|
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-- |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
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| |
| Basepair (668:688)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
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| gap
| Seq
|
|---|
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-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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0.2 |
0.3* |
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-- |
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| |
| Basepair (669:687)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
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| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
71.3 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
9.1 |
-- |
-- |
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-- |
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0.1 |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
11.0 |
-- |
-- |
3.8 |
-- |
-- |
-- |
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| B |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
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| A |
-- |
-- |
88.4 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 232 |
| C |
-- |
-- |
36.5 |
-- |
-- |
-- |
3.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
58.2* |
-- |
-- |
1.8* |
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| E |
-- |
-- |
24.1 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
0.1* |
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| M |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
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| |
| Basepair (670:686)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.4 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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2.3 |
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97.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
65.7 |
3.4 |
30.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| C |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
95.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
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| E |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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|
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| GC
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| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
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| CC
| CU
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| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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0.1* |
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-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 6089 |
| B |
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-- |
-- |
2.4* |
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-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 4825 |
| A |
81.1 |
-- |
-- |
-- |
18.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| C |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| E |
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-- |
1.3* |
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-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| M |
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0.1* |
0.4* |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
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0.1 |
6.7 |
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| |
| Basepair (671:687)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
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| GG
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
0.1 |
0.1* |
0.1 |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
97.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 6105 |
| B |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 4843 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
99.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 232 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.8* |
-- |
-- |
5.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.8* |
-- |
-- |
-- |
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| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
97.3 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.5* |
-- |
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| |
| Basepair (672:681)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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2.1* |
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-- |
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0.1 |
0.1 |
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-- |
-- |
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-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4824 |
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8.6* |
-- |
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-- |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| C |
-- |
90.6* |
4.1* |
-- |
-- |
4.7 |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 171 |
| E |
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-- |
-- |
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0.1 |
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-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
0.1 |
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| |
| Basepair (673:680)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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0.1 |
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-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.6 |
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0.1 |
-- |
3.1 |
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-- |
-- |
7.7 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 6118 |
| B |
-- |
-- |
-- |
8.0 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
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| A |
-- |
-- |
-- |
34.3 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| C |
-- |
-- |
-- |
9.9 |
88.9* |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 171 |
| E |
0.6 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- | 1033 |
| M |
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-- |
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| |
| Basepair (674:679)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
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| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 7192 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 6132 |
| B |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4867 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 231 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 170 |
| E |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.7 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 1035 |
| M |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
6.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 891 |
| |
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