Thermus thermophilus 16S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (27 of 48)
| Basepair (748:799)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.1* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
95.8* |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 | 6877 |
| 3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
98.8 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 5823 |
| B |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 4583 |
| A |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 202 |
| C |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 167 |
| E |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
96.6 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 1039 |
| M |
0.1 |
-- |
16.1 |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
0.5* |
-- |
1.1 |
0.1 |
-- |
75.8* |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 888 |
| |
| Basepair (749:796)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
97.5 |
0.1 |
-- |
0.5 |
0.8 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.4 | 6921 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
98.4 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 5866 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 4613 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 214 |
| C |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 169 |
| E |
-- |
-- |
-- |
94.3 |
0.2 |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- | 1039 |
| M |
-- |
-- |
0.1* |
91.3* |
0.2 |
-- |
3.4 |
0.9 |
0.7 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1* |
-- |
0.9 |
2.2 | 887 |
| |
| Basepair (749:1502)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
1.1* |
1.2 |
0.1* |
-- |
31.2 |
2.7 |
62.7* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 | 2318 |
| 3 |
-- |
-- |
1.3* |
0.3 |
-- |
-- |
27.6 |
1.3 |
68.9* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 1586 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.7 |
2.2 |
96.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 803 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 82 |
| C |
0.9* |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
1.8 |
7.9 |
87.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 114 |
| E |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
61.4 |
0.3 |
34.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 702 |
| M |
-- |
0.2* |
0.8 |
3.4 |
0.3 |
0.2 |
46.0* |
5.3 |
42.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.5* |
0.7 | 620 |
| |
| Basepair (751:794)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
-- |
18.4 |
1.0 |
-- |
1.2 |
76.2* |
0.4 |
-- |
0.1 |
-- |
2.0* |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 | 7131 |
| 3 |
0.1 |
-- |
-- |
19.9 |
1.1 |
-- |
0.9 |
75.3* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.8* |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 | 6075 |
| B |
-- |
-- |
-- |
18.0 |
0.8 |
-- |
0.7 |
78.2* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.3* |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 | 4806 |
| A |
-- |
-- |
-- |
41.7 |
11.0* |
-- |
-- |
46.9* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 228 |
| C |
0.6 |
-- |
-- |
21.8 |
-- |
-- |
-- |
77.1 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 170 |
| E |
0.6 |
-- |
-- |
23.8 |
0.3 |
-- |
2.1 |
68.5* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
4.6* |
-- |
-- |
-- |
-- | 1042 |
| M |
-- |
-- |
0.1 |
8.1 |
0.3 |
-- |
3.0 |
82.1* |
0.2 |
0.2 |
0.7 |
0.1 |
3.9* |
-- |
0.1 |
0.2* |
0.7 | 887 |
| |
| Basepair (752:793)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
97.9* |
0.2* |
0.3* |
0.6* |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 | 7119 |
| 3 |
99.3* |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 6065 |
| B |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 | 4795 |
| A |
97.4* |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 229 |
| C |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 170 |
| E |
99.7* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 1042 |
| M |
88.5* |
0.5* |
2.0* |
4.6* |
1.4 |
-- |
0.9 |
0.8 |
0.2 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.3 | 885 |
| |
| Basepair (753:792)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
80.9* |
17.6* |
0.1* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 | 7109 |
| 3 |
0.2* |
79.4* |
19.5* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 | 6054 |
| B |
0.3* |
94.5* |
4.3* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 | 4785 |
| A |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 229 |
| C |
-- |
94.7* |
4.7* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 169 |
| E |
-- |
5.8* |
93.7* |
0.3* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 1041 |
| M |
0.5* |
88.4* |
6.9* |
0.3* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
3.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 | 887 |
| |
| Basepair (754:791)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
58.2* |
4.4* |
27.1* |
8.3* |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 | 7092 |
| 3 |
67.9* |
3.9* |
17.4* |
9.2* |
0.7 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 | 6038 |
| B |
85.2* |
1.2* |
4.5* |
7.4* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.3 | 4772 |
| A |
-- |
49.8* |
48.0* |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 225 |
| C |
7.7* |
1.2* |
86.3* |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
3.1* |
6.5* |
70.0* |
19.2* |
0.1 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1042 |
| M |
2.4* |
8.8* |
81.7* |
4.1* |
0.2 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.8 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
1.0 |
0.2 | 887 |
| |
| Basepair (755:790)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.9* |
1.3* |
63.9* |
26.8* |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 7122 |
| 3 |
5.2* |
1.5* |
73.4* |
19.5* |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 6067 |
| B |
0.5* |
1.7* |
91.9* |
5.5* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 4799 |
| A |
49.1* |
3.1* |
1.3* |
45.6* |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 228 |
| C |
4.7* |
-- |
1.2* |
89.9* |
3.0 |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 169 |
| E |
17.2* |
0.2* |
3.7* |
78.7* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1041 |
| M |
19.1* |
0.7* |
11.0* |
64.3* |
0.8 |
0.2 |
0.5 |
2.0 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.6 |
0.3 | 887 |
| |
| Basepair (756:789)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
80.7* |
0.1* |
0.2* |
8.7* |
9.6 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- | 7131 |
| 3 |
86.7* |
-- |
-- |
1.9* |
11.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 6074 |
| B |
98.1* |
-- |
-- |
1.5* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 4804 |
| A |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 230 |
| C |
77.5* |
1.2* |
1.2* |
18.3* |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 169 |
| E |
31.6 |
0.1* |
-- |
4.2 |
63.7* |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 1041 |
| M |
40.6* |
0.1* |
1.2* |
53.1* |
1.2 |
-- |
0.1 |
1.7 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
0.4 |
0.8 | 889 |
| |
| Basepair (757:788)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
95.3* |
-- |
0.1* |
4.1* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 7160 |
| 3 |
95.9* |
-- |
-- |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 6104 |
| B |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4835 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 230 |
| C |
95.3* |
-- |
-- |
4.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 169 |
| E |
76.3* |
-- |
-- |
23.5* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1040 |
| M |
92.1* |
-- |
0.5* |
4.3* |
1.1 |
-- |
0.2 |
0.8 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.2 | 888 |
| |
| Basepair (761:787)
|
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|
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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0.1 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6 |
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-- |
-- |
-- |
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99.4 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
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-- |
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| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
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| CA
| CC
| CU
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
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-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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2.1 | 923 |
| |
| Basepair (763:785)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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63.8 |
-- |
-- |
-- |
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| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
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| M |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
91.0 |
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-- |
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-- |
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5.2 |
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-- |
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| Basepair (764:784)
|
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| GC
| CG
| UA
| AU
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| UG
| AA
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| AG
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| CC
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| GG
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| Seq
|
|---|
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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99.4 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 922 |
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|
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| GC
| CG
| UA
| AU
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| UG
| AA
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| CC
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| Seq
|
|---|
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| B |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
-- |
-- |
-- |
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-- |
2.4 |
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94.7* |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
0.1 |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1042 |
| M |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
2.5 |
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-- |
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2.3 | 922 |
| |
| Basepair (766:782)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
-- |
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-- |
1.2 |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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0.2 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
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0.1 |
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| |
| Basepair (767:781)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
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| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
80.6* |
-- |
-- |
19.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| E |
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-- |
0.2 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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2.1 | 924 |
| |
| Basepair (768:780)
|
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| UA
| AU
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| AA
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| CU
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| UU
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| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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99.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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| C |
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-- |
-- |
1.8* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| E |
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0.1* |
-- |
5.5 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1039 |
| M |
95.5* |
-- |
0.1* |
2.1* |
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-- |
0.1 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 926 |
| |
| Basepair (769:779)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
99.4* |
-- |
-- |
0.1* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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99.8* |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| B |
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-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| A |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| E |
99.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 925 |
| |
| Basepair (770:778)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
98.3 |
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1.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.6 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 6126 |
| B |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
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| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 229 |
| C |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 170 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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96.9* |
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-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
2.1 | 924 |
| |
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