Thermus thermophilus 16S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (31 of 48)
| Basepair (898:1378)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
96.6* |
2.9* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 5964 |
| 3 |
-- |
-- |
97.1* |
2.5* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 4935 |
| B |
-- |
-- |
96.3* |
3.2* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 3789 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 171 |
| C |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 159 |
| E |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 974 |
| M |
-- |
-- |
93.9* |
6.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 872 |
| |
| Basepair (899:1377)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 | 5971 |
| 3 |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 4942 |
| B |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 3794 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 172 |
| C |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 159 |
| E |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 975 |
| M |
99.0* |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 872 |
| |
| Basepair (900:1375)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.1* |
-- |
0.1* |
86.1* |
4.7 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 | 5965 |
| 3 |
3.8* |
-- |
-- |
95.4* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- | 4916 |
| B |
0.5* |
-- |
-- |
98.8* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- | 3773 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 169 |
| C |
-- |
-- |
-- |
93.0 |
3.2 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 158 |
| E |
0.1* |
-- |
-- |
98.9* |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 973 |
| M |
33.5* |
0.1* |
0.3* |
33.6* |
29.9 |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 | 893 |
| |
| Basepair (901:1374)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 | 5980 |
| 3 |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4928 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 3785 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 169 |
| C |
-- |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 159 |
| E |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 973 |
| M |
0.2* |
98.3* |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- | 895 |
| |
| Basepair (902:1373)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.1 |
0.5* |
0.1* |
0.1 |
88.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 | 5916 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 | 4863 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 | 3712 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 177 |
| C |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 159 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 | 974 |
| M |
66.7* |
3.6* |
0.4* |
0.7* |
27.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 895 |
| |
| Basepair (904:1372)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.5 |
0.3* |
6.9* |
16.2 |
69.0* |
6.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.2 | 5980 |
| 3 |
0.2 |
-- |
-- |
19.4 |
80.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4930 |
| B |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 3778 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 177 |
| C |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 158 |
| E |
-- |
-- |
0.1* |
97.6* |
1.8 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 975 |
| M |
2.5* |
2.0* |
45.9* |
1.2* |
1.9 |
43.4 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
2.1 |
-- | 893 |
| |
| Basepair (905:1371)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
75.3* |
0.1* |
0.7* |
21.4* |
1.0 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.9 |
0.1 | 5797 |
| 3 |
77.2* |
-- |
0.8* |
21.6* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4744 |
| B |
96.6* |
-- |
1.0* |
1.8* |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 3589 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 181 |
| C |
88.6* |
-- |
-- |
9.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 158 |
| E |
1.4* |
-- |
0.1* |
98.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 974 |
| M |
63.2* |
0.9* |
0.7* |
22.4* |
5.4 |
0.2 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
5.9 |
0.1 | 896 |
| |
| Basepair (906:1370)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
67.7* |
12.0* |
2.8* |
14.1* |
0.7 |
0.3 |
-- |
0.2 |
-- |
0.9 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.4 | 5933 |
| 3 |
79.5* |
2.1* |
0.5* |
16.3* |
0.7 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 4854 |
| B |
74.7* |
2.2* |
-- |
21.0* |
0.9 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.4 | 3698 |
| A |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 182 |
| C |
84.2* |
-- |
-- |
12.0* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.9 | 158 |
| E |
93.7* |
2.1* |
2.4* |
1.0* |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 974 |
| M |
3.4* |
66.3* |
15.5* |
2.9* |
0.3 |
1.4 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
5.5 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
0.5 |
0.9 | 922 |
| |
| Basepair (907:1369)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.6* |
70.8* |
6.7* |
3.6* |
0.1 |
1.4 |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 5948 |
| 3 |
19.0* |
72.5* |
1.2* |
4.2* |
0.1 |
1.3 |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 4869 |
| B |
-- |
95.3* |
1.4* |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.8 | 3705 |
| A |
5.8* |
-- |
-- |
93.1* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 189 |
| C |
-- |
93.6* |
2.5* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 157 |
| E |
93.6* |
0.1* |
0.7* |
2.8* |
0.5 |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 | 975 |
| M |
0.3* |
58.2* |
36.0* |
0.9* |
0.1 |
2.1 |
0.1 |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 923 |
| |
| Basepair (908:1368)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.4* |
70.5* |
7.5* |
1.2* |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 6028 |
| 3 |
22.3* |
74.4* |
0.7* |
1.1* |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4950 |
| B |
-- |
97.3* |
0.9* |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 3786 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 188 |
| C |
-- |
86.6* |
8.3* |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
1.3 | 157 |
| E |
93.8* |
0.1* |
-- |
5.6* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 | 976 |
| M |
0.4* |
47.0* |
43.8* |
2.1* |
0.1 |
2.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
2.8 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
0.1 | 922 |
| |
| Basepair (909:1367)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.8* |
85.2* |
4.7* |
0.3* |
-- |
4.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.4 |
3.5 | 5561 |
| 3 |
-- |
93.7* |
1.3* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
3.8 | 4482 |
| B |
-- |
92.6* |
1.8* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
5.1 | 3328 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 181 |
| C |
-- |
88.6* |
6.3* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.4 | 158 |
| E |
-- |
96.4 |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 973 |
| M |
4.7* |
43.3* |
21.1* |
1.7* |
0.1 |
21.4 |
0.3 |
-- |
0.3 |
2.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
2.3 |
2.1 | 922 |
| |
| Basepair (910:1366)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
64.8* |
-- |
0.1* |
33.6* |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 6101 |
| 3 |
75.3* |
-- |
-- |
23.8* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 5023 |
| B |
97.9* |
-- |
-- |
0.9* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 | 3861 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 189 |
| C |
90.5* |
-- |
1.3* |
5.1* |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 158 |
| E |
0.1* |
-- |
-- |
99.6* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 973 |
| M |
3.4* |
0.2* |
0.4* |
92.2* |
-- |
-- |
1.3 |
1.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
0.4 | 921 |
| |
| Basepair (911:915)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.3 |
0.1 |
0.5 |
0.3 |
0.7* |
2.6* |
0.5 |
3.8* |
0.1 |
80.8* |
1.6 |
1.4 |
0.3 |
-- |
2.0 |
2.2 |
0.9 | 6859 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2* |
-- |
-- |
0.1 |
96.0* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 5550 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
99.4* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4351 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 216 |
| C |
-- |
0.6 |
6.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 167 |
| E |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
18.0* |
-- |
-- |
-- |
80.1* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 983 |
| M |
13.6 |
0.1 |
1.6 |
1.9 |
4.0 |
0.1 |
2.7 |
22.7* |
-- |
5.8* |
9.4 |
7.5 |
1.4 |
-- |
12.1 |
13.1* |
4.2 | 1143 |
| |
| Basepair (912:1362)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
13.5* |
0.1* |
84.8* |
0.1 |
0.1 |
0.6 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 6264 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 5140 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 3978 |
| A |
1.1* |
-- |
-- |
98.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 189 |
| C |
-- |
-- |
-- |
96.2 |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 159 |
| E |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 973 |
| M |
-- |
87.7* |
0.5* |
4.8* |
0.3 |
0.5 |
3.3 |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.5 | 966 |
| |
| Basepair (913:1361)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
95.8* |
1.0* |
0.1* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
0.1 |
0.6 |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
0.6 | 6291 |
| 3 |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 5166 |
| B |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 4002 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 188 |
| C |
-- |
95.0* |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 159 |
| E |
-- |
96.9 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
2.5 | 976 |
| M |
1.0* |
78.9* |
6.2* |
0.8* |
0.1 |
1.2 |
0.3 |
0.2 |
0.2 |
4.0 |
0.4 |
3.5 |
-- |
0.1 |
-- |
2.2 |
0.7 | 967 |
| |
| Basepair (914:1360)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
1.2 |
1.1 |
4.7 |
0.1 |
0.1 |
2.2 |
70.2* |
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1.8* |
15.0 |
1.1 |
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0.1* |
0.2 |
0.4* |
0.7 | 6280 |
| 3 |
-- |
0.4 |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
0.3 |
79.9* |
0.1 |
0.5* |
15.7 |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 5157 |
| B |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
0.1 |
98.0 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 3993 |
| A |
-- |
-- |
-- |
13.3 |
-- |
-- |
0.5 |
85.6* |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 188 |
| C |
-- |
-- |
-- |
6.3 |
-- |
-- |
10.7 |
79.9 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 | 159 |
| E |
-- |
2.2 |
-- |
3.4* |
-- |
-- |
1.0 |
4.7 |
0.5 |
2.6 |
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2.2 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 | 976 |
| M |
-- |
5.8 |
7.0* |
17.6* |
0.5 |
0.4 |
11.1 |
16.6 |
3.5 |
8.9 |
13.5* |
4.8 |
2.6 |
0.6* |
0.7 |
2.8 |
3.4 | 965 |
| |
Last generated : Fri Jun 28 2002 (11 : 6)