Thermus thermophilus 16S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (32 of 48)
| Basepair (916:1325)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
81.5* |
16.1* |
1.1* |
0.3* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1 | 6629 |
| 3 |
96.7* |
2.3* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.2 | 5346 |
| B |
98.8* |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.1 | 4183 |
| A |
37.6* |
61.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 189 |
| C |
92.2* |
-- |
4.8* |
0.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.2 | 166 |
| E |
99.4* |
-- |
-- |
0.1* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 974 |
| M |
7.5* |
84.2* |
5.8* |
1.4* |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 1118 |
| |
| Basepair (917:1324)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.7* |
64.4* |
17.7* |
0.9* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 | 6610 |
| 3 |
19.5* |
75.5* |
2.6* |
1.1* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.1 |
0.1 | 5329 |
| B |
-- |
95.7* |
3.4* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 | 4163 |
| A |
76.4* |
19.9* |
-- |
3.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 191 |
| C |
-- |
92.1* |
4.8* |
1.2* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
91.3* |
0.1* |
-- |
4.9* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
2.7 |
0.2 |
0.3 |
0.1 | 975 |
| M |
-- |
7.3* |
91.6* |
0.2* |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 1117 |
| |
| Basepair (918:1323)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
62.5* |
3.0* |
3.2* |
30.1* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 6599 |
| 3 |
73.8* |
3.7* |
3.9* |
17.3* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 5314 |
| B |
90.0* |
-- |
-- |
8.7* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 4151 |
| A |
85.9* |
12.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 191 |
| C |
95.2* |
-- |
-- |
2.4* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 165 |
| E |
2.7* |
17.8* |
21.4* |
57.3* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 972 |
| M |
4.4* |
-- |
0.4* |
95.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 1121 |
| |
| Basepair (919:1322)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.3 | 6607 |
| 3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.4 | 5323 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.8 | 4157 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 191 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
90.3* |
-- |
-- |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
4.8 | 165 |
| E |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 975 |
| M |
0.3 |
-- |
0.3* |
0.4 |
99.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1120 |
| |
| Basepair (920:1321)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
16.0* |
65.9* |
16.7* |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.4 | 6586 |
| 3 |
-- |
19.8* |
77.1* |
2.1* |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 | 5301 |
| B |
-- |
25.4* |
71.6* |
1.7* |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 | 4138 |
| A |
-- |
-- |
79.4* |
19.6* |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 189 |
| C |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 165 |
| E |
-- |
-- |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 974 |
| M |
1.1* |
-- |
8.7* |
88.7* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.6 | 1121 |
| |
| Basepair (921:1320)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 6569 |
| 3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 5284 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4120 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 191 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.1 |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 973 |
| M |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 1121 |
| |
| Basepair (922:1217)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4* |
0.1 |
-- |
-- |
98.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 6663 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4* |
0.1 |
-- |
-- |
98.7* |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5356 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4190 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
12.6* |
-- |
-- |
-- |
87.4* |
-- |
-- |
-- |
-- | 190 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8* |
0.6 |
-- |
-- |
96.4* |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
98.9 |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 | 976 |
| M |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
3.1 |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
96.3* |
-- |
-- |
-- |
-- | 1143 |
| |
| Basepair (923:1216)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
-- |
0.1* |
98.4* |
0.2 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 | 6663 |
| 3 |
-- |
-- |
0.1* |
99.0* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1* |
-- |
0.1 |
0.3 | 5357 |
| B |
-- |
-- |
0.1* |
99.3* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 | 4200 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 186 |
| C |
2.4* |
-- |
-- |
95.2* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
-- |
-- |
-- |
97.2 |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.2 | 971 |
| M |
0.4* |
0.3* |
0.1* |
96.1* |
-- |
-- |
0.1 |
3.0 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1142 |
| |
| Basepair (924:1215)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
90.6* |
-- |
4.7* |
3.1* |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.3 | 6646 |
| 3 |
90.4* |
-- |
5.6* |
2.5* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.4 | 5339 |
| B |
91.6* |
-- |
6.3* |
1.5* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 | 4186 |
| A |
81.5* |
-- |
0.5* |
16.3* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- | 184 |
| C |
86.1* |
1.8* |
7.9* |
1.2* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
86.9* |
-- |
3.5* |
4.6* |
0.8 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
-- |
1.5 | 969 |
| M |
92.3* |
-- |
0.3* |
5.8* |
0.5 |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 1143 |
| |
| Basepair (925:1214)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.6* |
88.8* |
5.9* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.7 | 6626 |
| 3 |
3.2* |
88.4* |
6.0* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.8 | 5320 |
| B |
4.1* |
88.1* |
6.1* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.7 | 4166 |
| A |
0.5* |
97.3* |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- | 183 |
| C |
-- |
78.8* |
17.0* |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
-- |
88.0* |
6.5* |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.5 |
1.8 |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 | 971 |
| M |
0.2* |
92.1* |
4.2* |
-- |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 1142 |
| |
| Basepair (926:1213)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.8* |
17.4* |
0.5* |
66.3* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
9.7 |
2.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
0.4 | 6617 |
| 3 |
2.2 |
2.8 |
0.3* |
77.8* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
12.0* |
2.9 |
-- |
-- |
0.3 |
0.9 |
0.5 | 5310 |
| B |
0.6* |
-- |
-- |
98.9* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4169 |
| A |
5.8* |
85.5* |
8.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 173 |
| C |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
8.5 |
-- |
-- |
0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.2 |
65.9* |
15.5 |
-- |
-- |
1.5 |
4.6* |
2.0 | 968 |
| M |
0.3* |
88.0* |
1.8* |
8.5* |
-- |
0.3 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 1143 |
| |
| Basepair (927:1212)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.3 |
12.1 |
-- |
-- |
86.7* |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.3 | 6649 |
| 3 |
-- |
0.2 |
15.0 |
-- |
-- |
84.1* |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.3 | 5342 |
| B |
-- |
0.2 |
19.1 |
-- |
-- |
80.2* |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 4184 |
| A |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 184 |
| C |
-- |
1.8 |
1.8 |
-- |
-- |
93.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 165 |
| E |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.1 |
1.0 | 974 |
| M |
-- |
0.3 |
0.2 |
-- |
-- |
98.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
0.1 | 1143 |
| |
| Basepair (928:1211)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
83.1* |
0.1* |
-- |
0.2* |
16.0 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 6670 |
| 3 |
98.9* |
0.1* |
-- |
0.1* |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 5364 |
| B |
99.4* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4212 |
| A |
98.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- | 181 |
| C |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
96.5* |
-- |
-- |
0.3* |
2.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 | 971 |
| M |
7.1 |
0.1* |
-- |
0.8 |
91.5* |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 1142 |
| |
| Basepair (929:1210)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
22.5* |
76.5* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 | 6654 |
| 3 |
-- |
27.6* |
71.6* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 5348 |
| B |
-- |
8.4* |
91.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4195 |
| A |
-- |
97.2 |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 179 |
| C |
-- |
-- |
95.2 |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 165 |
| E |
-- |
97.4* |
0.8* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 | 974 |
| M |
0.4* |
1.8* |
96.7* |
0.3* |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 | 1142 |
| |
| Basepair (930:1209)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
79.5* |
3.4* |
15.0* |
0.2* |
0.1 |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 6588 |
| 3 |
95.5* |
-- |
3.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5281 |
| B |
94.7* |
-- |
4.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4130 |
| A |
97.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 177 |
| C |
92.7* |
-- |
1.8* |
1.8* |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
98.3* |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 974 |
| M |
3.7* |
19.9* |
68.6* |
0.6* |
0.3 |
5.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.2 |
0.3 | 1143 |
| |
| Basepair (931:1207)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
82.1* |
14.4* |
0.4* |
0.8* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.8 | 6697 |
| 3 |
98.4* |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
1.1 | 5389 |
| B |
99.5* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4235 |
| A |
97.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
1.1 | 181 |
| C |
92.8* |
-- |
-- |
0.6* |
3.6 |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 166 |
| E |
93.7 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
5.2 | 973 |
| M |
4.1* |
84.2* |
2.6* |
4.8* |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
2.0 |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.4 | 1143 |
| |
| Basepair (932:1206)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
19.0* |
66.3* |
12.9* |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.2 | 6678 |
| 3 |
-- |
22.9* |
60.7* |
15.7* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 5372 |
| B |
-- |
5.9* |
73.5* |
20.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 4219 |
| A |
-- |
26.5* |
73.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 181 |
| C |
-- |
1.2* |
93.9* |
2.4* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 165 |
| E |
0.1* |
96.2* |
2.4* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 972 |
| M |
0.1* |
3.2* |
89.1* |
0.8* |
0.2 |
0.8 |
0.2 |
-- |
0.2 |
3.2 |
0.3 |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
1.2 |
0.2 | 1142 |
| |
Last generated : Fri Jun 28 2002 (11 : 6)