Thermus thermophilus 16S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (33 of 48)
| Basepair (933:937)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
12.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
2.7 |
-- |
0.1 |
84.4* |
0.1 | 6836 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
0.1 | 5525 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
0.1 | 4324 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- | 212 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
0.3 | 989 |
| M |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
71.8* |
0.2 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
16.3 |
-- |
0.2 |
8.9* |
0.1 | 1144 |
| |
| Basepair (938:951)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
0.1 |
66.4* |
0.1 |
0.1 |
16.8 |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 |
2.1* |
-- |
-- |
8.7 |
4.1 |
0.3 | 6856 |
| 3 |
0.1 |
0.1 |
68.1* |
-- |
-- |
20.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
8.9 |
1.5 |
0.3 | 5546 |
| B |
0.1* |
-- |
86.4* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
11.3 |
1.2 |
0.4 | 4330 |
| A |
-- |
3.3 |
3.3 |
-- |
-- |
78.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.8 |
-- | 209 |
| C |
-- |
-- |
95.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
0.1 |
2.5 |
-- |
-- |
96.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1 | 1008 |
| M |
0.6* |
-- |
54.2* |
0.6 |
0.4 |
0.1 |
1.5 |
0.1 |
-- |
3.3 |
0.3 |
12.3* |
0.1 |
-- |
9.0 |
17.4 |
-- | 1142 |
| |
| Basepair (939:950)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.1* |
80.5* |
0.5* |
-- |
-- |
15.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 6863 |
| 3 |
3.8* |
77.0* |
0.1* |
-- |
-- |
18.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 5552 |
| B |
0.2* |
97.9* |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 4339 |
| A |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 | 206 |
| C |
-- |
94.6* |
1.8* |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
2.3 |
0.5 |
-- |
-- |
96.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 | 1009 |
| M |
0.4* |
96.2* |
1.9* |
0.1* |
0.1 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1142 |
| |
| Basepair (940:949)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 6866 |
| 3 |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 5549 |
| B |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4342 |
| A |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 203 |
| C |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 1007 |
| M |
99.9 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1144 |
| |
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