Thermus thermophilus 16S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (38 of 48)
| Basepair (1028:1192)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
0.8* |
1.5* |
68.9* |
0.4 |
-- |
4.1 |
6.9 |
4.0 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
12.3 |
0.3 | 6836 |
| 3 |
0.1* |
0.2* |
1.8* |
78.0* |
0.3 |
-- |
0.5 |
-- |
3.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
14.9 |
0.2 | 5527 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.1 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 4337 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6* |
-- |
-- |
-- |
96.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
| C |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 168 |
| E |
0.5* |
1.2* |
9.9 |
1.2 |
1.1 |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
82.7* |
0.6 | 989 |
| M |
-- |
3.5* |
0.4 |
21.0 |
1.0 |
0.3 |
21.7 |
41.2* |
7.0 |
0.4 |
-- |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.1 |
1.4* |
1.5 | 1142 |
| |
| Basepair (1028:1194)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
14.0 |
0.1 |
-- |
0.1 |
83.6* |
0.1 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.1* |
0.4 | 6863 |
| 3 |
-- |
-- |
17.1* |
0.1 |
-- |
-- |
81.8 |
0.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5554 |
| B |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
99.7 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4356 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 195 |
| C |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 168 |
| E |
-- |
-- |
94.4 |
-- |
-- |
0.2 |
1.3 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 999 |
| M |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
0.1 |
0.3 |
90.7* |
0.1 |
4.4 |
-- |
-- |
1.0 |
0.1* |
0.1 |
0.1 |
0.4* |
1.4 | 1142 |
| |
| Basepair (1029:1191)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
80.2* |
-- |
-- |
1.7* |
17.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 6840 |
| 3 |
77.6* |
-- |
-- |
1.2* |
20.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 5532 |
| B |
93.6* |
-- |
-- |
0.3* |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 4341 |
| A |
99.5* |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 193 |
| C |
91.7 |
-- |
-- |
-- |
6.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 168 |
| E |
3.6 |
-- |
-- |
4.9 |
90.9* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 994 |
| M |
91.4* |
-- |
0.3* |
4.7* |
3.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 | 1141 |
| |
| Basepair (1030:1190)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
83.1* |
11.5* |
1.6* |
0.9* |
0.1 |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 | 6897 |
| 3 |
98.0* |
-- |
-- |
1.0* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.7 | 5588 |
| B |
97.6* |
-- |
-- |
1.3* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.7 | 4392 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 994 |
| M |
8.2* |
69.4* |
9.7* |
0.1* |
0.1 |
11.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 | 1142 |
| |
| Basepair (1032:1189)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
82.9* |
0.1* |
15.1* |
0.3* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.5 | 6785 |
| 3 |
98.5* |
-- |
-- |
0.1* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.4 | 5475 |
| B |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.4 | 4294 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
| C |
95.8* |
-- |
-- |
1.2* |
1.2 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
97.6* |
-- |
-- |
0.3* |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 980 |
| M |
6.6* |
0.5* |
89.5* |
1.0* |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 | 1143 |
| |
| Basepair (1033:1188)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
53.1* |
31.8* |
0.3* |
11.7* |
0.2 |
1.8 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.5 | 6871 |
| 3 |
58.3* |
38.4* |
-- |
0.5* |
0.1 |
1.7 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 | 5561 |
| B |
47.7* |
48.9* |
-- |
0.1* |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 | 4362 |
| A |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
97.0* |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
96.9* |
0.1* |
-- |
2.4* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 997 |
| M |
21.1* |
4.4* |
1.9* |
67.7* |
0.7 |
2.3 |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 | 1143 |
| |
| Basepair (1034:1187)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
95.9* |
-- |
-- |
0.1 |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 | 6733 |
| 3 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 | 5423 |
| B |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4234 |
| A |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
97.8 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 186 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 | 999 |
| M |
-- |
0.4 |
3.3 |
-- |
-- |
80.2* |
0.1 |
-- |
-- |
15.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
0.3 | 1143 |
| |
| Basepair (1037:1186)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
96.9 |
0.1 |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 | 6908 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
96.6 |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5598 |
| B |
-- |
-- |
-- |
95.9 |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4398 |
| A |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
-- |
-- |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
-- |
-- |
99.7 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 998 |
| M |
-- |
-- |
-- |
98.2 |
0.3 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 | 1143 |
| |
| Basepair (1038:1185)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
15.0* |
82.0* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 6897 |
| 3 |
-- |
0.2* |
96.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 5588 |
| B |
-- |
0.3* |
96.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 4386 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 1000 |
| M |
0.1* |
89.4* |
6.7* |
0.1* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 1142 |
| |
| Basepair (1039:1184)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
66.6* |
14.9* |
0.5* |
-- |
14.9 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 | 6802 |
| 3 |
78.5 |
-- |
-- |
-- |
17.8 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 5492 |
| B |
98.6 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 | 4291 |
| A |
37.9 |
-- |
-- |
-- |
61.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
92.3 |
-- |
-- |
-- |
6.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
82.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
17.0 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 | 999 |
| M |
5.9* |
88.5* |
2.8* |
0.2* |
2.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 | 1143 |
| |
| Basepair (1040:1180)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7 |
-- |
-- |
0.8 |
95.5* |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
0.3 | 6900 |
| 3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 5594 |
| B |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 4395 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 195 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 166 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 1000 |
| M |
3.7 |
-- |
-- |
4.6 |
76.9* |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
13.9 |
0.1 | 1141 |
| |
| Basepair (1041:1179)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
75.6* |
23.5* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 6911 |
| 3 |
-- |
70.9* |
28.2* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 | 5602 |
| B |
-- |
63.6* |
35.7* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- | 4398 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
-- |
95.8* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 168 |
| E |
-- |
97.8* |
1.0* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 | 1002 |
| M |
-- |
96.0* |
3.6* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 1142 |
| |
| Basepair (1042:1178)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
34.1* |
65.3* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 6845 |
| 3 |
-- |
23.5* |
76.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5535 |
| B |
-- |
2.6* |
97.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4340 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
| C |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 168 |
| E |
-- |
99.2* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 | 994 |
| M |
-- |
90.6* |
8.6* |
0.1* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 1143 |
| |
| Basepair (1043:1176)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
91.4* |
-- |
-- |
6.3* |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 6774 |
| 3 |
97.0* |
-- |
-- |
0.3* |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 5466 |
| B |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 4267 |
| A |
36.0 |
-- |
-- |
7.6 |
55.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 197 |
| C |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 167 |
| E |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 998 |
| M |
63.4* |
-- |
-- |
35.8* |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 | 1142 |
| |
| Basepair (1044:1175)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
1.5* |
18.1 |
0.1 |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
77.9* |
0.2 | 6909 |
| 3 |
-- |
1.8* |
17.5 |
0.1 |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
78.3* |
0.2 | 5600 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
0.1 | 4400 |
| A |
-- |
37.9 |
9.1 |
-- |
-- |
52.5* |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
95.8 |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
2.6* |
96.1* |
-- |
0.1* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 |
0.2 | 998 |
| M |
-- |
0.1 |
23.3 |
0.2 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
0.4 |
73.4* |
0.4 | 1142 |
| |
| Basepair (1045:1174)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
84.1* |
14.6* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.1 | 6907 |
| 3 |
-- |
81.8* |
17.8* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 5598 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4397 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
-- |
97.6* |
0.6* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
0.2* |
99.4* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 999 |
| M |
0.1* |
93.3* |
1.2 |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.1* |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
3.9* |
0.2 | 1142 |
| |
| Basepair (1046:1173)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
73.2* |
-- |
2.5* |
0.4 |
1.8 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1* |
0.7 |
0.1 |
12.9* |
2.5 |
0.5 |
4.2 |
0.4 |
0.1 | 6914 |
| 3 |
79.8* |
-- |
0.4* |
-- |
1.8 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1* |
-- |
-- |
15.9* |
0.1 |
0.4 |
0.8 |
0.2 |
0.1 | 5606 |
| B |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 4404 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
88.7* |
-- |
-- |
-- |
6.0 |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
0.1 |
0.1 |
2.2 |
-- |
1.0 |
1.3 |
-- |
-- |
0.3* |
0.1 |
0.1 |
89.2* |
-- |
-- |
4.3* |
1.1 |
0.2 | 1000 |
| M |
38.4* |
0.1* |
13.0* |
2.2* |
1.1 |
-- |
1.0 |
0.2 |
0.4 |
3.9 |
0.7 |
-- |
15.1 |
0.3 |
21.8 |
1.6 |
0.5 | 1141 |
| |
| Basepair (1048:1172)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
14.5 |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
83.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
0.1 |
0.3 | 6898 |
| 3 |
-- |
0.1 |
16.8 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
82.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 5588 |
| B |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4383 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 168 |
| E |
-- |
-- |
93.3 |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
4.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 | 1003 |
| M |
0.1 |
0.2 |
5.5 |
-- |
-- |
-- |
7.1 |
0.1* |
-- |
85.4* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.4* |
1.0 | 1143 |
| |
Last generated : Fri Jun 28 2002 (11 : 6)