Thermus thermophilus 16S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (42 of 48)
| Basepair (1100:1137)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
12.7* |
52.5* |
3.2* |
-- |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
29.8 | 7041 |
| 3 |
0.1* |
15.6* |
61.3* |
3.8* |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
18.2 | 5729 |
| B |
0.1* |
15.9* |
77.8* |
4.9* |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 4503 |
| A |
-- |
91.7* |
6.2* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 193 |
| C |
-- |
-- |
92.4* |
0.6 |
0.6* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
4.8 | 170 |
| E |
-- |
0.1* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
0.5* |
0.2 |
2.4* |
0.3 |
0.1 |
1.4 |
-- |
0.1 |
2.1* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
92.6 | 1143 |
| |
| Basepair (1101:1136)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.0* |
45.7* |
6.6* |
1.2* |
0.4 |
12.9 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
30.1 | 7026 |
| 3 |
1.4* |
55.5* |
7.0* |
1.1* |
0.5 |
15.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
18.3 | 5714 |
| B |
1.8* |
67.2* |
8.3* |
1.4* |
0.6 |
19.5 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 4484 |
| A |
1.0* |
80.7* |
14.2* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- | 197 |
| C |
32.9* |
18.8* |
28.8* |
2.4* |
0.6 |
9.4 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
4.7 | 170 |
| E |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
0.1* |
0.8 |
1.3* |
1.5 |
0.1 |
1.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.3* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
92.6 | 1143 |
| |
| Basepair (1102:1135)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
9.0* |
35.5* |
16.1* |
6.8* |
1.3 |
1.0 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
29.8 | 7055 |
| 3 |
10.9* |
43.5* |
16.8* |
8.0* |
1.6 |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
18.0 | 5743 |
| B |
13.8* |
52.3* |
20.9* |
9.8* |
2.0 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 4521 |
| A |
1.6* |
70.4* |
10.1* |
8.5* |
-- |
5.3 |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 |
-- |
-- | 189 |
| C |
0.6* |
5.3* |
81.8* |
0.6* |
-- |
4.7 |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
4.7 | 170 |
| E |
0.1* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
0.3* |
0.3* |
3.0* |
1.6* |
-- |
2.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.6 | 1143 |
| |
| Basepair (1103:1134)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.1* |
12.9* |
35.4* |
1.8* |
-- |
18.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
29.7 | 7073 |
| 3 |
1.3* |
15.6* |
40.5* |
1.9* |
-- |
21.6 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
17.9 | 5761 |
| B |
1.6* |
17.7* |
50.6* |
1.7* |
-- |
27.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- | 4532 |
| A |
2.0* |
50.0* |
21.4* |
18.4* |
-- |
6.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 196 |
| C |
-- |
4.1* |
65.3* |
7.1* |
0.6 |
18.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
4.1 | 170 |
| E |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
0.1* |
0.3* |
5.1* |
0.3* |
-- |
1.6 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.7 | 1143 |
| |
| Basepair (1104:1133)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.4* |
6.1* |
47.1* |
11.5* |
0.1 |
1.0 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
29.9 | 7063 |
| 3 |
3.7* |
7.4* |
55.4* |
13.9* |
0.1 |
0.7 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
18.0 | 5751 |
| B |
4.6* |
8.2* |
67.7* |
17.3* |
0.1 |
0.8 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- | 4520 |
| A |
-- |
27.8* |
63.1* |
9.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
4.7* |
2.9* |
60.6* |
-- |
-- |
21.2 |
4.7 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
4.1 | 170 |
| E |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
1.7* |
0.2* |
3.2* |
0.7* |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
93.9 | 1143 |
| |
| Basepair (1105:1132)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.4* |
0.1* |
15.1* |
46.7* |
0.1 |
5.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.6 |
29.8 | 7084 |
| 3 |
1.7* |
0.1* |
17.9* |
54.1* |
0.1 |
6.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
1.7 |
17.9 | 5772 |
| B |
2.2* |
0.2* |
22.3* |
65.2* |
0.1 |
7.9 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
1.7 |
-- | 4541 |
| A |
-- |
-- |
9.6* |
80.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.1 |
-- | 198 |
| C |
-- |
-- |
5.3* |
85.9* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.2 | 170 |
| E |
-- |
-- |
0.1* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
-- |
-- |
2.4* |
3.3* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
92.9 | 1143 |
| |
| Basepair (1106:1131)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
61.4* |
0.1* |
1.5* |
2.0* |
2.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
2.0 |
0.5 |
29.9 | 7096 |
| 3 |
72.9* |
0.2* |
1.2* |
2.1* |
2.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
2.5 |
0.5 |
17.9 | 5784 |
| B |
89.3* |
-- |
1.5* |
2.0* |
2.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
3.2 |
0.7 |
-- | 4553 |
| A |
74.2* |
4.0* |
-- |
15.2* |
5.1 |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
72.9* |
-- |
1.2* |
7.1* |
8.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
9.4 | 170 |
| E |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
2.1* |
-- |
2.8* |
0.9* |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
93.1 | 1143 |
| |
| Basepair (1108:1130)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
2.4 |
1.1 |
0.1 |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.3 |
64.9* |
29.9 | 7110 |
| 3 |
-- |
-- |
2.6 |
1.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
77.7 |
17.9 | 5798 |
| B |
-- |
-- |
0.1 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
97.4 |
0.1 | 4568 |
| A |
-- |
-- |
73.6 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
25.9 |
-- | 197 |
| C |
-- |
-- |
6.5 |
-- |
4.1 |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
29.4 |
49.4* |
10.0 | 170 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
99.8 | 1029 |
| M |
-- |
-- |
0.8 |
0.3 |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
1.7 |
2.9* |
93.9 | 1143 |
| |
| Basepair (1109:1127)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
29.3* |
-- |
0.1* |
0.8 |
1.5 |
0.2 |
0.6 |
1.8 |
4.6* |
0.1 |
-- |
-- |
14.4 |
15.1 |
-- |
0.1 |
31.5 | 7055 |
| 3 |
35.2* |
-- |
0.1 |
0.7 |
1.7 |
0.1 |
0.7 |
2.2 |
5.6* |
0.1* |
-- |
-- |
16.2 |
18.3 |
-- |
-- |
19.1 | 5743 |
| B |
42.8* |
-- |
0.1* |
0.8 |
1.1 |
0.2 |
0.8 |
2.3 |
7.1* |
0.1 |
-- |
-- |
20.7 |
22.8 |
-- |
-- |
1.2 | 4512 |
| A |
47.0* |
-- |
-- |
4.5* |
22.2 |
-- |
-- |
11.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
12.1 |
-- |
0.5 |
2.5 | 198 |
| C |
12.4 |
0.6 |
0.6 |
5.3* |
5.3 |
4.1* |
0.6 |
0.6 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
48.2* |
6.5 |
-- |
1.2 |
13.5 | 170 |
| E |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
1.7* |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.3* |
96.7 | 1143 |
| |
| Basepair (1110:1125)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
58.0* |
-- |
0.1* |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
8.6 |
0.3 |
0.2 |
0.3* |
0.3 |
0.1* |
-- |
31.8 | 7087 |
| 3 |
0.1 |
69.1* |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
10.4 |
0.1 |
0.2 |
0.4* |
0.3 |
-- |
-- |
19.2 | 5775 |
| B |
-- |
84.4* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1* |
-- |
0.1 |
13.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
1.5 | 4546 |
| A |
1.5 |
77.0* |
-- |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.6 |
1.0 |
-- |
9.7* |
0.5 |
-- |
-- |
2.6 | 196 |
| C |
-- |
70.6* |
1.2 |
4.1* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
3.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.1* |
0.6 |
14.7 | 170 |
| E |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
1.3* |
0.2 |
0.1* |
0.1 |
-- |
-- |
97.9 | 1143 |
| |
| Basepair (1112:1126)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2 |
0.1* |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.5 |
65.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
33.2 | 7072 |
| 3 |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.7 |
79.3* |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
19.1 | 5760 |
| B |
-- |
0.3 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
97.3* |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
1.5 | 4530 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
14.7 |
79.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 | 197 |
| C |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
18.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
77.6 | 170 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
-- |
0.1 |
0.4* |
0.3* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1* |
0.1 |
-- |
97.4 | 1143 |
| |
| Basepair (1114:1124)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
64.8* |
0.9* |
0.1* |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
33.0 | 7091 |
| 3 |
0.2* |
79.0* |
1.0* |
0.1* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
18.9 | 5779 |
| B |
0.2* |
97.0* |
0.6* |
0.1* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 4549 |
| A |
0.5* |
78.7* |
14.7* |
-- |
-- |
1.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
3.0 | 197 |
| C |
0.6* |
17.1* |
5.3* |
1.2* |
0.6 |
0.6 |
1.8 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
5.3 |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
65.3 | 170 |
| E |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
0.2* |
0.1* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 | 1143 |
| |
| Basepair (1115:1123)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.3* |
0.4* |
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0.6 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
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0.1 |
0.1 |
0.2 |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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0.1 |
0.2 |
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-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
4.1 | 4508 |
| A |
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9.3* |
36.6* |
1.5 |
2.6 |
0.5 |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
2.6 | 194 |
| C |
1.8* |
0.6* |
2.4* |
16.5* |
7.1 |
-- |
2.4 |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
67.1 | 170 |
| E |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
0.1* |
-- |
0.1* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
99.6 | 1143 |
| |
| Basepair (1116:1122)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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2.8* |
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0.1 |
1.4 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
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20.7* |
3.3* |
7.5* |
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1.7 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
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25.4* |
3.1* |
9.1* |
0.2 |
1.9 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.3 |
38.0 | 4545 |
| A |
30.3* |
21.0* |
25.1* |
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1.0 |
5.1 |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
2.6 |
3.6 | 195 |
| C |
2.4* |
0.6* |
2.4* |
0.6* |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
91.8 | 170 |
| E |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1029 |
| M |
0.1* |
-- |
0.2* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
99.6 | 1143 |
| |
| Basepair (1117:1120)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
1.2 |
5.8 |
0.7 |
0.2 |
32.3* |
0.7 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.7* |
3.3* |
0.4 |
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32.1 | 7092 |
| 3 |
-- |
1.4 |
5.9 |
0.4 |
0.1 |
39.4* |
0.4 |
-- |
0.5 |
0.3 |
0.1 |
0.8* |
4.0* |
0.4 |
0.3 |
26.2 |
19.9 | 5781 |
| B |
-- |
1.2 |
7.5 |
0.5 |
0.2 |
47.6* |
0.5 |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- |
0.8* |
4.9* |
0.5 |
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33.1 |
2.0 | 4551 |
| A |
-- |
13.3 |
0.5 |
-- |
-- |
56.6* |
-- |
-- |
-- |
6.1* |
0.5 |
3.1 |
5.1 |
0.5 |
1.0 |
2.6 |
10.8 | 196 |
| C |
-- |
0.6 |
31.4* |
14.2* |
3.0 |
6.5 |
3.6 |
-- |
2.4 |
3.0 |
-- |
0.6 |
0.6 |
4.7* |
1.2 |
8.9 |
19.5 | 169 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 | 1030 |
| M |
-- |
-- |
1.2 |
0.6 |
0.1 |
0.3* |
1.7* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
95.6 | 1143 |
| |
Last generated : Fri Jun 28 2002 (11 : 6)