Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (3 of 60)
| Basepair (42:149)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
24.3* |
16.1* |
2.9 |
0.6 |
-- |
0.1 |
5.3* |
-- |
3.9 |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 |
0.3 |
0.1 |
0.7* |
44.1 | 715 |
| 3 |
40.2* |
28.5* |
4.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
26.4 | 403 |
| B |
63.7* |
32.3* |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 | 251 |
| A |
5.6* |
94.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
10.1* |
-- |
3.8 |
-- |
-- |
1.3* |
44.3* |
-- |
34.2 |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 | 79 |
| E |
0.9* |
-- |
8.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.7 | 117 |
| M |
1.7 |
-- |
0.4 |
1.7 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
0.4* |
1.3 |
-- |
-- |
2.1* |
-- |
0.4 |
2.1* |
88.3 | 233 |
| |
| Basepair (43:148)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
64.3* |
0.8* |
0.6 |
0.7* |
1.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.9 | 712 |
| 3 |
-- |
95.8* |
1.0* |
0.5* |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 400 |
| B |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 250 |
| A |
-- |
69.4* |
8.3* |
5.6* |
-- |
16.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
94.9* |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 | 79 |
| E |
-- |
97.4* |
0.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 115 |
| M |
0.4 |
-- |
0.4* |
0.9 |
2.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.1 | 233 |
| |
| Basepair (45:115)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
53.5* |
0.1 |
-- |
0.6 |
12.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
0.1 |
1.3* |
0.3 |
31.6 | 716 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
75.5* |
0.2 |
-- |
0.2 |
21.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2* |
-- |
0.4 | 404 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 251 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 79 |
| E |
-- |
-- |
-- |
17.8 |
-- |
-- |
0.8 |
72.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.6 |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
0.4* |
-- |
0.9* |
96.5 | 233 |
| |
| Basepair (47:113)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
0.4* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
67.1* |
0.1 |
-- |
-- |
31.9 | 720 |
| 3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 | 407 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 | 254 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 80 |
| E |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
-- |
1.3* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.9 | 233 |
| |
| Basepair (48:113)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
67.2* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1* |
0.1 |
32.1 | 720 |
| 3 |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 406 |
| B |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 253 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 81 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
0.4 |
98.7 | 233 |
| |
| Basepair (48:114)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.1* |
66.9* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
31.9 | 720 |
| 3 |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 406 |
| B |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 253 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 81 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.8 | 233 |
| |
| Basepair (49:112)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.4 |
1.5* |
2.1 |
-- |
-- |
0.8 |
0.3 |
66.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
28.1 | 720 |
| 3 |
-- |
0.5 |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 406 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 253 |
| A |
-- |
5.6 |
-- |
11.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.2 |
-- |
93.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 81 |
| E |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
-- |
0.4* |
4.7* |
3.9* |
-- |
-- |
0.4 |
0.9 |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
86.6 | 233 |
| |
| Basepair (50:111)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
56.2* |
0.1* |
0.6* |
2.9* |
12.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
28.0 | 721 |
| 3 |
75.7* |
-- |
-- |
2.5* |
21.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 407 |
| B |
95.7* |
-- |
-- |
3.9* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 254 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
98.8* |
-- |
-- |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 81 |
| E |
25.4 |
-- |
-- |
-- |
72.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
7.3* |
0.4* |
1.7* |
4.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.3 | 233 |
| |
| Basepair (51:110)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
58.2* |
0.4* |
-- |
12.4* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
27.6 | 725 |
| 3 |
77.1* |
0.2* |
-- |
21.2* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 406 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 253 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 86 |
| E |
22.0* |
0.8* |
-- |
72.9* |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
9.9* |
0.9* |
-- |
1.7* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
85.8 | 233 |
| |
| Basepair (52:109)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
16.5* |
2.1* |
2.2* |
50.0* |
0.1 |
0.4 |
0.3 |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
27.6 | 726 |
| 3 |
8.8* |
3.7* |
2.9* |
83.8* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 407 |
| B |
3.1* |
-- |
2.4* |
93.7* |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 254 |
| A |
55.6* |
13.9* |
-- |
30.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
94.2* |
-- |
-- |
4.7* |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 86 |
| E |
6.8* |
8.5* |
5.1* |
78.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
1.3* |
-- |
1.7* |
7.7* |
-- |
1.3 |
0.9 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
85.9 | 233 |
| |
| Basepair (53:66)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
65.7* |
4.8* |
1.5* |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
26.9 | 727 |
| 3 |
-- |
91.4* |
7.9* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 407 |
| B |
-- |
87.0* |
12.6* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 253 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
97.7 |
-- |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 87 |
| E |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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0.9* |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.3 | 233 |
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|
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|
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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98.5* |
-- |
-- |
0.2* |
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-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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95.0* |
-- |
-- |
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2.5 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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10.3* |
-- |
3.0* |
1.3* |
0.4 |
-- |
0.4 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.3 | 233 |
| |
| Basepair (55:64)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
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| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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9.8 |
-- |
-- |
41.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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27.1 |
11.0 |
-- |
-- |
48.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 255 |
| A |
-- |
19.4 |
-- |
-- |
-- |
80.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
45.7* |
53.2* |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 94 |
| E |
-- |
75.6* |
10.1* |
-- |
-- |
13.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
1.7 |
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0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.3 | 233 |
| |
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|
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| GC
| CG
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|
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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0.2 |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
9.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
2.8 |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
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3.2* |
-- |
7.4* |
16.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
2.1 |
-- |
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| E |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 | 118 |
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-- |
-- |
0.4 |
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-- |
-- |
1.3* |
-- |
0.9 |
-- |
0.4* |
-- |
0.9 |
0.9* |
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| |
| Basepair (58:88)
|
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| GC
| CG
| UA
| AU
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| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
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| GG
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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-- |
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-- |
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-- |
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0.2 |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
19.8 |
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| A |
-- |
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2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
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2.1 |
-- |
-- |
57.9* |
-- |
4.2 |
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-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
3.2* |
1.1 | 95 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
0.8* |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
0.9* |
0.9 |
0.4* |
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-- |
2.1 |
88.0 | 233 |
| |
| Basepair (60:86)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
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| CC
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| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
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0.1 |
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-- |
0.3 |
0.3 |
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0.3 |
-- |
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14.1* |
5.1* |
0.7 |
22.3 |
-- |
0.2 |
28.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
28.3 | 412 |
| B |
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8.1* |
0.8* |
35.7* |
-- |
0.4 |
32.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 258 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
5.2 |
-- |
-- |
54.2* |
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1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
1.0* |
3.1 | 96 |
| E |
-- |
-- |
0.8* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 | 119 |
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-- |
0.4 |
0.4 |
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0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
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-- |
0.9* |
0.9 |
1.3* |
-- |
-- |
1.3 |
89.7 | 233 |
| |
| Basepair (61:85)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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9.0* |
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-- |
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0.1 |
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0.1 |
-- |
-- |
1.9 |
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0.3 |
0.1 |
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24.8* |
7.3* |
15.0* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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0.2 |
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| B |
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24.0* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- | 258 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
81.2* |
6.2 |
2.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.3* |
-- |
1.0* |
-- |
1.0 | 96 |
| E |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
98.3 | 119 |
| M |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
1.3 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
1.3* |
0.4 |
-- |
-- |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
92.1 | 233 |
| |
| Basepair (62:84)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
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-- |
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-- |
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0.3 |
0.3 |
0.3 |
44.7 | 741 |
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-- |
67.5* |
1.5* |
-- |
-- |
1.5 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
28.4 | 412 |
| B |
-- |
94.6* |
1.6* |
-- |
-- |
2.3 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- | 258 |
| A |
-- |
94.4* |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
92.7* |
3.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
1.0 | 96 |
| E |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.2 | 119 |
| M |
0.4 |
-- |
0.9* |
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0.4* |
-- |
-- |
-- |
2.6* |
-- |
0.4* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.9 |
91.7 | 233 |
| |
| Basepair (63:70)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.5 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
1.0 |
-- |
0.2 |
-- |
13.1 |
2.7 |
1.1 | 412 |
| B |
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-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
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3.9 |
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| A |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
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-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 96 |
| E |
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1.7* |
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4.2 |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
3.3 |
-- |
-- |
-- |
44.2* |
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| M |
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-- |
2.6* |
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-- |
1.7 |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
-- |
1.3 |
1.7 |
1.7* |
-- |
0.9 |
84.1 | 233 |
| |
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