Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (10 of 60)
| Basepair (394:417)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3 |
0.6 |
0.9 |
0.1 |
0.8 |
37.7* |
0.6 |
0.2* |
4.2 |
0.1 |
-- |
-- |
3.1* |
25.1 |
-- |
0.1 |
26.0 | 895 |
| 3 |
0.6 |
0.9 |
0.4 |
-- |
0.9 |
44.1* |
-- |
0.4* |
6.9 |
-- |
-- |
-- |
5.2* |
40.7 |
-- |
-- |
-- | 540 |
| B |
-- |
1.8 |
0.4 |
-- |
-- |
83.7* |
-- |
0.4* |
12.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
10.8 |
-- |
-- |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.0 |
51.4* |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
96.0* |
1.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
0.5 |
1.4 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
8.1 |
89.1* |
-- |
-- |
-- | 221 |
| M |
-- |
-- |
1.6 |
0.4 |
0.8 |
1.2 |
1.6* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
0.4* |
91.8 | 255 |
| |
| Basepair (395:2443)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.7* |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.1* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
0.7 |
0.1 |
-- |
95.2 | 839 |
| 3 |
2.9* |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.6 |
-- |
0.2* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
1.2 |
0.2 |
-- |
91.7 | 485 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 282 |
| A |
37.8 |
-- |
-- |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
32.4 |
16.2 |
2.7 |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 100 |
| E |
3.3 |
-- |
-- |
2.7 |
9.3 |
0.7 |
8.0* |
2.7 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
6.0 |
51.3* |
0.7 |
5.3* |
9.3 | 150 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 254 |
| |
| Basepair (412:428)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
34.5* |
1.6* |
4.0* |
7.0* |
27.5 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
24.0 | 896 |
| 3 |
55.1* |
2.4* |
4.1* |
6.1* |
30.7 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.2 |
0.2 |
-- | 541 |
| B |
77.0* |
1.8* |
-- |
2.1* |
18.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- | 283 |
| A |
62.2* |
13.5* |
5.4* |
10.8* |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
10.0 |
-- |
-- |
10.0 |
79.0* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
26.2 |
1.4* |
9.0* |
10.4 |
49.8* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
0.9 |
-- |
0.5 |
-- | 221 |
| M |
0.4* |
0.4* |
5.5* |
7.8* |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
84.3 | 255 |
| |
| Basepair (413:427)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
56.1* |
15.3* |
3.4* |
0.4* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
23.9 | 895 |
| 3 |
87.2* |
7.0* |
5.2* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 540 |
| B |
85.8* |
12.4* |
1.1* |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
94.6* |
5.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
87.8* |
0.5* |
11.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 221 |
| M |
12.2* |
-- |
0.4* |
1.6* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
83.9 | 255 |
| |
| Basepair (414:426)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
24.2 |
6.4* |
0.4* |
2.2 |
42.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
24.0 | 896 |
| 3 |
22.9 |
10.2* |
0.2* |
0.4 |
66.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 541 |
| B |
29.7 |
12.4* |
-- |
-- |
58.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
18.9 |
24.3* |
-- |
-- |
56.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
85.0* |
-- |
-- |
14.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
14.5 |
5.0* |
0.5* |
0.9 |
78.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 221 |
| M |
3.1 |
0.8* |
1.2* |
1.6 |
9.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.9 | 255 |
| |
| Basepair (415:425)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
24.8* |
4.0* |
19.4* |
27.2* |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
23.9 | 896 |
| 3 |
37.0* |
6.7* |
31.3* |
24.3* |
-- |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 540 |
| B |
64.3* |
2.5* |
5.3* |
27.6* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
40.5* |
2.7* |
8.1* |
48.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
1.8* |
12.7* |
68.2* |
15.9* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- | 220 |
| M |
8.6* |
-- |
2.0* |
5.1* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
83.6 | 256 |
| |
| Basepair (416:424)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
63.2* |
1.3* |
0.4* |
10.1* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
24.2 | 897 |
| 3 |
81.1* |
2.0* |
-- |
16.1* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 | 541 |
| B |
70.7* |
3.5* |
-- |
25.1* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 283 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
91.4* |
0.5* |
-- |
7.2* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- | 221 |
| M |
11.7* |
0.4* |
1.6* |
1.6* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.4 | 256 |
| |
| Basepair (418:2449)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.0* |
4.0* |
1.2 |
17.7 |
0.1 |
-- |
43.7* |
-- |
2.5 |
1.6 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
27.9 | 773 |
| 3 |
1.9* |
7.4* |
-- |
31.8 |
0.2 |
-- |
52.0* |
-- |
4.3 |
1.9 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 421 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.9 |
-- |
5.1 |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 234 |
| A |
-- |
83.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
16.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
96.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
5.3* |
-- |
-- |
88.7* |
0.7 |
-- |
3.3 |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.7 |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
-- |
3.5 |
-- |
-- |
-- |
9.4 |
-- |
0.4 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.0 | 254 |
| |
| Basepair (419:2448)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
47.8* |
1.4* |
20.3* |
1.4 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
27.7 | 772 |
| 3 |
0.2* |
57.4* |
1.4* |
37.1* |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 420 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
0.7* |
6.0* |
4.0* |
78.7* |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 |
0.7 |
1.3 |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
12.2* |
1.6* |
0.4* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.2 | 254 |
| |
| Basepair (420:2447)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.2* |
48.4* |
4.0* |
15.0* |
0.4 |
1.4 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
27.8 | 772 |
| 3 |
4.0* |
58.6* |
6.7* |
27.4* |
0.7 |
1.7 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 420 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 233 |
| A |
-- |
37.8* |
35.1* |
-- |
5.4* |
18.9 |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
96.9* |
1.0* |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
11.3* |
0.7* |
10.0* |
76.0* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
13.0* |
0.8* |
0.4* |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.2 | 254 |
| |
| Basepair (421:2446)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.9* |
8.4* |
13.5* |
47.4* |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
27.8 | 772 |
| 3 |
3.6* |
15.5* |
23.1* |
56.4* |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 420 |
| B |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| A |
18.9* |
56.8* |
13.5* |
-- |
2.7 |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 98 |
| E |
5.3* |
29.3* |
60.7* |
3.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
-- |
2.8* |
13.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.3 | 254 |
| |
| Basepair (422:2445)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.3* |
31.3* |
32.3* |
2.2* |
0.8 |
2.6 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
27.7 | 773 |
| 3 |
4.3* |
30.9* |
54.6* |
2.9* |
1.4 |
4.8 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- | 421 |
| B |
-- |
44.0* |
56.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 234 |
| A |
35.1* |
2.7* |
18.9* |
21.6* |
16.2 |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
96.9* |
3.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
3.3* |
16.7* |
62.0* |
2.7* |
-- |
13.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 150 |
| M |
-- |
6.7* |
6.7* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.8 | 254 |
| |
| Basepair (423:2444)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.9* |
10.5* |
6.0* |
2.5* |
-- |
0.4 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
78.4 | 840 |
| 3 |
3.7* |
20.5* |
11.7* |
4.9* |
-- |
0.7 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
57.5 | 429 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 243 |
| A |
43.2* |
-- |
-- |
54.1* |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 102 |
| E |
-- |
58.7* |
32.7* |
0.7* |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
4.1 | 150 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 309 |
| |
| Basepair (452:460)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4 |
0.1* |
7.3 |
2.4* |
0.7 |
0.1 |
6.1 |
1.7 |
0.1 |
0.8 |
0.2 |
0.6 |
71.7* |
0.4 |
1.1* |
2.2 |
4.1 | 905 |
| 3 |
-- |
-- |
5.8 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
91.6 |
0.5 |
-- |
-- |
0.4 | 549 |
| B |
-- |
-- |
11.4 |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.1 |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 281 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
97.0 |
1.3 |
-- |
-- |
-- | 231 |
| M |
1.6 |
0.4* |
12.9 |
8.6* |
2.3 |
0.4 |
18.0 |
5.9 |
0.4 |
2.0 |
0.8 |
2.0 |
19.1* |
0.4 |
3.9* |
7.8 |
13.8 | 256 |
| |
| Basepair (463:477)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
85.3 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
12.9 | 905 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 549 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 231 |
| M |
-- |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
48.4 |
0.8 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
45.7 | 256 |
| |
| Basepair (465:476)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
98.0* |
0.1* |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.1 | 905 |
| 3 |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 549 |
| B |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
99.1 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 230 |
| M |
-- |
-- |
94.1* |
0.4* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
3.9 | 256 |
| |
| Basepair (466:475)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2 |
0.3* |
1.1 |
-- |
-- |
1.2 |
0.3 |
88.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
8.0 | 904 |
| 3 |
-- |
0.4 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
94.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
2.9 | 549 |
| B |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 | 283 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
4.4 | 229 |
| M |
-- |
-- |
1.2* |
0.8 |
-- |
-- |
3.5 |
0.4 |
72.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
21.5 | 255 |
| |
| Basepair (467:474)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.9* |
90.0* |
1.4* |
0.9* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.1 |
1.3 | 906 |
| 3 |
8.0* |
89.1* |
-- |
0.4* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
0.2 |
0.4 | 550 |
| B |
-- |
99.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- | 283 |
| A |
24.3* |
73.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
97.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
15.2* |
78.7* |
-- |
0.9* |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
1.3 |
-- |
-- |
0.9 | 230 |
| M |
-- |
89.1* |
4.7* |
2.3* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 256 |
| |
| Basepair (468:473)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4* |
78.4* |
15.1* |
3.6* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 907 |
| 3 |
0.5* |
75.9* |
17.1* |
4.7* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 551 |
| B |
0.4* |
78.8* |
19.1* |
0.7* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
5.4* |
75.7* |
16.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
89.0* |
4.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
-- |
72.3* |
14.7* |
10.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 | 231 |
| M |
0.4* |
79.7* |
15.2* |
0.8* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 256 |
| |
| Basepair (469:472)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.2* |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
96.2* |
-- |
-- |
-- |
1.1 | 905 |
| 3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 549 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 231 |
| M |
-- |
-- |
1.2 |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
93.4* |
-- |
-- |
-- |
3.9 | 256 |
| |
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