Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (12 of 60)
| Basepair (539:617)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
54.2* |
17.2* |
2.4* |
20.8* |
1.9 |
0.6 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.7 | 884 |
| 3 |
63.8* |
28.4* |
2.1* |
1.7* |
0.8 |
0.8 |
0.2 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
1.0 | 528 |
| B |
92.9* |
-- |
3.9* |
2.8* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
89.2* |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
5.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- | 37 |
| C |
91.0* |
-- |
-- |
5.0* |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
20.2* |
72.1* |
-- |
0.5 |
1.0 |
1.0 |
0.5* |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
2.4 | 208 |
| M |
19.9* |
0.8* |
3.9* |
66.4* |
3.5 |
0.4 |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.9 | 256 |
| |
| Basepair (540:616)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
22.3* |
3.4 |
4.0 |
22.0* |
1.6 |
42.1* |
0.1 |
0.7 |
-- |
0.2* |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
1.2 |
1.8 | 882 |
| 3 |
33.7* |
3.2 |
1.3 |
5.1* |
2.3 |
51.1* |
-- |
0.6 |
-- |
0.2* |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.6 |
1.0 | 526 |
| B |
-- |
0.4 |
2.5 |
1.4* |
-- |
95.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 281 |
| A |
59.5* |
5.4* |
-- |
24.3* |
10.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
1.0 |
5.0 |
2.0* |
-- |
87.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- | 100 |
| E |
74.5* |
6.7* |
-- |
6.7* |
3.8 |
1.0 |
-- |
1.4 |
-- |
0.5 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
1.4 |
1.9 | 208 |
| M |
7.8* |
4.7* |
9.0* |
64.5* |
0.8 |
5.9 |
0.4 |
1.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
4.3 | 256 |
| |
| Basepair (541:615)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
34.5* |
27.9* |
10.0* |
6.7* |
8.5 |
0.7 |
0.2 |
5.1 |
-- |
0.9 |
-- |
1.4 |
1.8 |
-- |
0.1 |
0.5 |
1.8 | 884 |
| 3 |
8.3 |
44.1* |
10.4* |
6.1 |
13.4* |
0.6 |
0.4 |
8.5* |
-- |
1.5 |
-- |
2.3 |
3.0 |
-- |
0.2 |
0.2 |
1.0 | 528 |
| B |
1.8 |
67.5* |
11.0* |
4.2 |
15.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
5.4* |
56.8* |
24.3* |
5.4* |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
87.0* |
-- |
-- |
13.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
17.8 |
10.1* |
6.7* |
8.7 |
13.5* |
-- |
1.0 |
21.6* |
-- |
3.8 |
-- |
5.8 |
7.7 |
-- |
0.5 |
0.5 |
2.5 | 208 |
| M |
68.0* |
5.5* |
12.9* |
5.5* |
1.6 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
4.3 | 256 |
| |
| Basepair (542:614)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
38.8* |
2.1* |
9.5* |
23.0* |
0.1 |
-- |
0.1 |
2.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
23.6 | 884 |
| 3 |
41.9* |
2.7* |
14.2* |
35.0* |
0.2 |
-- |
0.2 |
3.8 |
-- |
-- |
0.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 528 |
| B |
60.1* |
3.9* |
-- |
35.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
43.2* |
5.4* |
-- |
51.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
99.0* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
17.3* |
0.5* |
35.6* |
31.2* |
0.5 |
-- |
0.5 |
9.6 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 | 208 |
| M |
9.0* |
2.0* |
3.5* |
6.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
78.9 | 256 |
| |
| Basepair (543:613)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.3 |
2.6* |
17.6 |
3.2* |
0.2 |
0.1 |
8.3 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
37.9* |
0.1 |
-- |
0.5 |
25.4 | 884 |
| 3 |
5.5 |
4.4* |
28.2 |
4.0* |
0.2 |
0.2 |
8.3 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
44.5* |
0.2 |
-- |
0.8 |
3.3 | 528 |
| B |
-- |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.0* |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 283 |
| A |
29.7* |
40.5* |
21.6* |
5.4* |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
7.0 |
1.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
90.0* |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
8.7* |
1.4* |
67.8* |
9.1* |
0.5 |
-- |
1.4 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
0.5 |
-- |
1.4 |
7.3 | 208 |
| M |
-- |
-- |
2.3 |
2.7 |
0.4* |
-- |
8.6* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
81.3 | 256 |
| |
| Basepair (544:612)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.9* |
0.6 |
0.3 |
3.7 |
6.3 |
3.1 |
2.7 |
-- |
43.4* |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
1.4* |
26.1 | 882 |
| 3 |
20.0* |
1.0 |
-- |
4.0 |
10.3 |
5.1 |
0.6 |
-- |
52.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
2.3* |
4.2 | 526 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
1.1 |
-- |
97.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 | 282 |
| A |
70.3* |
-- |
-- |
5.4* |
24.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
94.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
37.7* |
2.4 |
-- |
9.2* |
20.8 |
13.0* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
5.8 |
10.1 | 207 |
| M |
-- |
-- |
1.2 |
4.3 |
0.8* |
-- |
6.2* |
-- |
5.5 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
81.3 | 256 |
| |
| Basepair (545:611)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.7 |
1.1* |
0.7* |
6.8 |
51.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
25.9 | 881 |
| 3 |
21.9 |
1.5* |
1.1* |
9.9 |
61.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
3.1 | 525 |
| B |
2.8 |
-- |
-- |
0.4 |
96.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
51.7* |
3.9* |
2.9* |
24.6* |
7.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.0 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
7.8 | 207 |
| M |
2.3 |
0.8* |
-- |
2.7 |
10.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
82.8 | 256 |
| |
| Basepair (546:610)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.3* |
35.7* |
1.7* |
12.9* |
2.2 |
1.0 |
-- |
0.8 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.1 |
26.5 | 883 |
| 3 |
15.9* |
53.7* |
0.4* |
19.4* |
2.8 |
1.3 |
-- |
1.3 |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.2 |
3.9 | 527 |
| B |
6.7* |
74.9* |
-- |
17.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 283 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
73.0* |
13.0* |
1.0* |
8.0* |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
31.4* |
16.9* |
1.0* |
25.1* |
7.2 |
3.4 |
-- |
2.9 |
0.5 |
1.0 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.5 |
8.7 | 207 |
| M |
2.0* |
7.4* |
4.7* |
1.6* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.6 | 256 |
| |
| Basepair (547:609)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
12.3* |
26.2* |
4.8* |
19.0* |
2.4 |
1.2 |
0.3 |
-- |
0.9 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.3 |
31.9 | 880 |
| 3 |
15.5* |
41.6* |
2.5* |
22.7* |
2.7 |
1.5 |
0.6 |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- |
0.6 |
10.2 | 524 |
| B |
9.0* |
67.7* |
1.8* |
15.4* |
2.9 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
1.5 | 279 |
| A |
-- |
37.8* |
8.1* |
37.8* |
-- |
16.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
27.0* |
9.0* |
11.0* |
42.0* |
4.0 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 | 100 |
| E |
26.9* |
7.2* |
2.4* |
30.3* |
2.9 |
-- |
1.4 |
-- |
3.8 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
0.5 |
-- |
-- |
23.6 | 208 |
| M |
-- |
1.6* |
7.0* |
2.3* |
1.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
87.5 | 256 |
| |
| Basepair (548:608)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.6* |
32.3* |
10.0* |
5.2* |
3.6 |
9.4 |
0.5 |
0.3 |
0.7 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.6 |
-- |
0.9 |
30.3 | 881 |
| 3 |
3.6 |
49.5* |
11.6* |
4.8 |
6.1* |
13.5 |
0.4 |
0.4* |
1.0 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.6 |
-- |
1.1 |
6.9 | 525 |
| B |
2.9* |
69.3* |
4.6* |
4.3* |
1.1 |
12.5 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
0.4 |
3.3 | 280 |
| A |
2.7* |
64.9* |
18.9* |
-- |
-- |
13.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
24.0* |
23.0* |
17.0* |
13.0* |
-- |
10.0 |
2.0 |
1.0 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
2.0 |
5.0 | 100 |
| E |
4.8 |
20.2* |
19.7* |
6.2 |
13.9* |
14.9 |
1.0 |
1.0* |
1.4 |
0.5 |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
2.4 |
13.0 | 208 |
| M |
2.3* |
0.8* |
3.9* |
3.1* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
88.7 | 256 |
| |
| Basepair (553:606)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
95.8 | 889 |
| 3 |
6.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
93.0 | 528 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.1 | 283 |
| A |
94.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 100 |
| E |
2.4 |
1.0 |
0.5 |
1.0 |
1.0* |
7.7* |
2.9 |
5.3* |
3.4 |
1.0* |
1.0 |
0.5 |
0.5 |
0.5 |
3.4 |
1.0 |
67.1 | 207 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.1 | 258 |
| |
| Basepair (554:605)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.8* |
-- |
-- |
0.7* |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
95.8 | 889 |
| 3 |
4.7* |
-- |
-- |
1.1* |
0.4 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
93.0 | 528 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.1 | 283 |
| A |
70.3* |
-- |
-- |
16.2* |
5.4 |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 100 |
| E |
2.9 |
1.0 |
-- |
4.3 |
1.9 |
0.5 |
1.0 |
5.3* |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
9.1* |
1.0 |
0.5* |
66.9 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.1 | 258 |
| |
| Basepair (555:602)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.3* |
0.6* |
-- |
0.3* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
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| 3 |
-- |
0.6* |
0.9* |
-- |
0.6* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
96.7 | 529 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 284 |
| A |
-- |
8.1* |
13.5* |
-- |
8.1* |
-- |
10.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
54.0 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 100 |
| E |
1.9 |
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0.5 |
-- |
1.4 |
1.4 |
6.7* |
-- |
2.4 |
2.4 |
7.7* |
1.4 |
3.4 |
2.4* |
-- |
2.9* |
61.9 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 261 |
| |
| Basepair (556:601)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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0.9* |
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0.1 |
0.1* |
0.1 |
0.1 |
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0.8 |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
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0.2 |
0.2 |
1.3* |
1.3 |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
0.2 |
93.2 | 529 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 284 |
| A |
8.1 |
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2.7 |
5.4* |
2.7 |
2.7 |
18.9* |
18.9 |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
2.7 |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 100 |
| E |
0.5 |
1.0 |
1.0 |
1.9 |
1.9 |
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1.4 |
-- |
2.4* |
2.9 |
5.8 |
12.0* |
1.4* |
2.4 |
1.0* |
1.0 |
62.1 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (557:600)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
1.7* |
0.5* |
0.5* |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
96.1 | 936 |
| 3 |
0.2* |
2.8* |
0.9* |
0.9* |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.2 |
93.8 | 572 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
2.7* |
51.4* |
13.5* |
13.5* |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
2.7 |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
7.2 |
1.4 |
1.0 |
0.5 |
6.2 |
-- |
2.9 |
0.5 |
-- |
0.5 |
5.3* |
-- |
8.7* |
3.8 |
1.0 |
1.0* |
60.2 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 261 |
| |
| Basepair (558:599)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
2.4* |
0.4* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
96.7 | 936 |
| 3 |
0.2* |
3.8* |
0.7* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
94.4 | 572 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
2.7* |
59.5* |
10.8* |
-- |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
13.5 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
5.3 |
0.5 |
2.4 |
4.8 |
6.2* |
4.3* |
3.4* |
2.4 |
1.0 |
1.0 |
1.0* |
-- |
1.9 |
1.4 |
1.0 |
3.4 |
60.1 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 261 |
| |
| Basepair (559:598)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.7* |
0.7* |
0.3* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
96.1 | 936 |
| 3 |
0.2* |
2.8* |
1.2* |
0.5* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
93.6 | 572 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
2.7* |
43.2* |
18.9* |
8.1* |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.5 |
5.4 |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
4.3 |
0.5* |
-- |
2.4 |
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0.5 |
1.0 |
9.2* |
1.9 |
-- |
-- |
2.9 |
3.9 |
2.9 |
1.0 |
1.9 |
59.9 | 207 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (560:597)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
2.1* |
1.2* |
0.1* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.2 | 936 |
| 3 |
0.2* |
3.5* |
1.9* |
0.2* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.8 | 572 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
8.1* |
54.1* |
29.7* |
2.7* |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
5.3* |
1.0 |
0.5 |
1.9 |
6.3 |
0.5 |
1.4 |
0.5 |
4.3* |
-- |
2.4 |
0.5 |
4.8 |
1.4 |
0.5 |
8.2* |
60.4 | 207 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (561:596)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.8* |
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0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
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| 3 |
1.4* |
3.0* |
1.0* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
93.7 | 572 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
21.6* |
45.9* |
16.2* |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
2.7 |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
2.4 |
1.0 |
0.5 |
0.5 |
1.4 |
1.0 |
0.5 |
0.5 |
1.9* |
0.5 |
1.0* |
2.9 |
6.3* |
1.0 |
0.5 |
7.2* |
71.0 | 207 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (562:595)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4* |
2.6* |
-- |
0.5* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
96.1 | 936 |
| 3 |
0.7* |
4.2* |
-- |
0.9* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
93.7 | 572 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
10.8* |
64.9* |
-- |
13.5* |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
0.5* |
1.0 |
1.9* |
2.4 |
1.0 |
0.5 |
6.7 |
1.9 |
6.7* |
1.4 |
-- |
7.2* |
-- |
2.9 |
-- |
1.0 |
64.9 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (563:594)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
2.2* |
0.2* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
96.1 | 935 |
| 3 |
0.2 |
3.7* |
0.4* |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
93.8 | 571 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
2.7 |
64.9* |
5.4* |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
5.4* |
-- |
-- |
10.8 |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
-- |
1.0 |
1.0 |
1.4 |
-- |
3.8 |
7.7* |
0.5 |
0.5 |
1.9 |
0.5 |
1.4* |
2.4 |
4.3* |
6.2* |
1.9 |
65.4 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (564:593)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
2.7* |
0.1 |
-- |
-- |
96.2 | 936 |
| 3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
4.4* |
0.2 |
-- |
-- |
93.7 | 572 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
8.1 |
-- |
10.8 |
-- |
-- |
-- |
5.4* |
-- |
67.6* |
2.7 |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
-- |
2.4 |
1.9 |
3.4* |
-- |
7.7* |
2.4 |
2.4 |
6.2 |
-- |
4.8* |
1.4 |
0.5* |
1.9 |
4.3 |
1.9 |
58.5 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (566:592)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
0.1 |
0.1 |
3.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.1 | 936 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
0.2 |
0.2 |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.7 | 572 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4* |
-- |
2.7 |
2.7 |
86.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
1.0* |
8.7 |
3.8* |
2.4 |
-- |
1.0 |
1.4 |
4.3 |
11.1* |
0.5 |
0.5 |
1.9* |
-- |
1.4 |
1.0 |
0.5 |
60.5 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (566:1093)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.9* |
0.1 |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
95.6 | 850 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.0* |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
92.4 | 474 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 245 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.7* |
-- |
-- |
-- |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
2.8 | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 | 100 |
| E |
-- |
9.3 |
1.6 |
-- |
-- |
3.6 |
8.3 |
-- |
14.0* |
2.6* |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
1.6 |
2.6* |
53.9 | 193 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
1.9* |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.2 | 261 |
| |
| Basepair (567:591)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.7* |
0.3* |
0.5* |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
95.7 | 886 |
| 3 |
4.6* |
0.6* |
0.6* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
93.1 | 525 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 280 |
| A |
64.9* |
8.1* |
8.1* |
10.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 | 100 |
| E |
1.4 |
1.9 |
0.5 |
1.9 |
2.4 |
1.4 |
1.0 |
6.7* |
3.8 |
-- |
0.5 |
5.3 |
1.0 |
4.3* |
-- |
7.2* |
60.6 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 261 |
| |
| Basepair (568:590)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
3.8* |
-- |
-- |
-- |
95.7 | 889 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.4 |
-- |
-- |
-- |
93.2 | 528 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 283 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.9 |
-- |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 | 100 |
| E |
2.9 |
1.9 |
0.5 |
1.0* |
0.5 |
8.7* |
0.5 |
1.4 |
-- |
1.9 |
8.7* |
6.2 |
-- |
1.4 |
0.5 |
1.4 |
62.6 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (569:589)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
3.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.1 | 889 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
6.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.5 | 528 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 283 |
| A |
-- |
-- |
-- |
91.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.1 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 | 100 |
| E |
-- |
2.4 |
1.0 |
1.9 |
0.5 |
3.4 |
-- |
1.0 |
1.0* |
0.5 |
12.5* |
2.4 |
0.5* |
-- |
2.4 |
11.5* |
59.2 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (570:587)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
95.8 | 889 |
| 3 |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9* |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
93.3 | 528 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 283 |
| A |
-- |
2.7* |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
70.3* |
-- |
-- |
13.5 |
-- |
-- |
5.4 |
2.7 |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 | 100 |
| E |
0.5* |
5.8 |
1.4 |
1.0 |
2.4 |
8.2* |
1.0* |
1.0 |
-- |
2.4 |
2.9 |
3.8* |
0.5 |
1.9 |
1.4 |
1.9 |
64.0 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (571:586)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1* |
0.1 |
-- |
0.1 |
2.1* |
0.1 |
0.4* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
96.3 | 889 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2* |
-- |
-- |
0.2 |
3.6* |
0.2 |
0.8* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
94.4 | 528 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 283 |
| A |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
2.7* |
-- |
-- |
2.7 |
51.4* |
2.7 |
10.8* |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
18.9 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.0 | 100 |
| E |
3.4 |
0.5 |
3.4* |
8.2* |
2.9 |
1.9 |
0.5 |
-- |
0.5 |
2.4 |
1.4* |
1.9 |
1.0 |
7.7* |
1.0 |
2.9 |
60.5 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 261 |
| |
| Basepair (572:585)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.9* |
2.0* |
0.1* |
0.2* |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
95.6 | 888 |
| 3 |
1.5* |
3.2* |
0.2* |
0.4* |
0.8 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.4 | 527 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 283 |
| A |
22.2* |
47.2* |
2.8* |
5.6* |
11.1 |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 | 36 |
| C |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0* |
97.0 | 100 |
| E |
9.6* |
-- |
1.9* |
4.3* |
9.1 |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 |
0.5 |
2.9 |
1.0 |
2.9 |
60.5 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (573:584)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.9* |
1.5* |
0.7* |
1.0* |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.4 | 888 |
| 3 |
1.3* |
2.5* |
0.9* |
1.5* |
-- |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.2 | 527 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 283 |
| A |
19.4* |
36.1* |
13.9* |
22.2* |
-- |
5.6 |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
1.0* |
-- |
1.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.0 | 100 |
| E |
2.9 |
1.4 |
2.9* |
1.0 |
6.7* |
0.5 |
2.9 |
-- |
-- |
3.4 |
6.7* |
4.3 |
1.4 |
1.4 |
0.5 |
2.4 |
61.5 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (574:583)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.6* |
0.1* |
0.6* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.2 | 889 |
| 3 |
3.6* |
2.7* |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.0 | 528 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 283 |
| A |
51.4* |
37.8* |
-- |
10.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
2.0* |
-- |
1.0* |
1.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.0 | 100 |
| E |
4.3 |
1.4 |
1.4 |
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2.4 |
0.5 |
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1.0 |
2.9 |
0.5* |
1.9 |
5.8* |
8.7* |
2.4 |
61.0 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 261 |
| |
| Basepair (575:582)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.0* |
1.2* |
0.6* |
0.7* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.1 | 890 |
| 3 |
3.2* |
1.7* |
0.8* |
0.9* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.2 | 529 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 284 |
| A |
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10.8* |
13.5* |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 | 37 |
| C |
1.0* |
2.0* |
1.0* |
1.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.0 | 100 |
| E |
2.9 |
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1.4 |
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-- |
-- |
0.5 |
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0.5 |
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5.3 |
1.4* |
1.0 |
65.3 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 261 |
| |
| Basepair (576:581)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
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| AA
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| GA
| GG
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|
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-- |
0.4* |
-- |
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0.1 |
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-- |
0.6* |
-- |
1.1 |
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1.5* |
1.3 |
0.4 |
0.2 |
78.7 | 529 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 284 |
| A |
37.8* |
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5.4* |
8.1* |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
1.0* |
3.0* |
3.0* |
1.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.0 | 100 |
| E |
2.4 |
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3.4 |
1.9* |
1.9 |
1.4 |
-- |
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1.9 |
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-- |
0.5 |
1.4 |
3.4* |
-- |
1.9 |
69.4 | 208 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 312 |
| |
| Basepair (577:580)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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2.6 |
16.9* |
5.3 |
3.6 |
8.8 |
4.7 |
15.7* |
1.9 |
1.6 |
1.1 |
0.5* |
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4.7 |
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| 3 |
0.8 |
3.4* |
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1.0 |
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0.6 |
16.8 |
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3.8 |
6.1 |
13.2 | 525 |
| B |
-- |
6.4* |
36.8* |
1.8* |
0.4 |
21.8 |
2.9 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
16.8 |
0.4 |
1.1 |
7.5 |
4.0 | 280 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.3* |
-- |
2.7* |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
4.0 |
25.0* |
2.0 |
-- |
14.0 |
9.0 |
-- |
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7.0 |
1.0 |
1.0* |
7.0 |
2.0 |
-- |
4.0 |
17.0 | 100 |
| E |
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0.5 |
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1.4 |
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1.0 |
1.0 |
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1.9 |
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| M |
0.4 |
0.4* |
3.8* |
10.7 |
-- |
0.4 |
7.7 |
52.5* |
1.5 |
0.8 |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
1.5 |
2.3 |
16.8 | 261 |
| |
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