Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (14 of 60)
| Basepair (636:1365)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
39.6* |
0.4* |
14.9* |
35.9* |
4.0 |
0.2 |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
2.3 | 804 |
| 3 |
41.9* |
-- |
2.0* |
52.5* |
2.3 |
-- |
0.9 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 442 |
| B |
64.6* |
-- |
3.8* |
29.5* |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
78.4* |
-- |
-- |
5.4* |
16.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
88.0* |
-- |
-- |
5.0* |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
2.4* |
-- |
-- |
94.6* |
-- |
-- |
2.4 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 168 |
| M |
17.2* |
1.1* |
42.4* |
19.8* |
5.7 |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
6.9 | 262 |
| |
| Basepair (637:1364)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.5* |
61.6* |
30.6* |
0.2* |
-- |
5.6 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.2 | 804 |
| 3 |
0.5* |
80.8* |
18.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 442 |
| B |
-- |
67.1* |
32.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
5.4* |
94.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
96.0* |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
96.4* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 168 |
| M |
0.8* |
16.0* |
61.1* |
0.8* |
-- |
17.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
3.4 | 262 |
| |
| Basepair (638:1363)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
71.4* |
25.3* |
0.9* |
0.4 |
0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.1 | 807 |
| 3 |
-- |
99.1* |
0.7* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 445 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
97.3 |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
96.0* |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
98.2* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 171 |
| M |
-- |
14.9* |
75.2* |
2.7* |
1.1 |
1.5 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
3.4 | 262 |
| |
| Basepair (639:1362)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
22.8* |
0.4* |
8.3* |
64.6* |
2.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 807 |
| 3 |
23.6* |
0.2* |
11.5* |
64.0* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 445 |
| B |
35.0* |
0.4* |
21.5* |
42.6* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
51.4* |
-- |
-- |
48.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
78.0* |
-- |
5.0* |
2.0* |
15.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
1.8* |
-- |
-- |
97.1* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 171 |
| M |
0.4* |
0.8* |
4.2* |
89.3* |
1.5 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 | 262 |
| |
| Basepair (640:1361)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
47.8* |
0.4* |
1.9* |
35.1* |
12.6 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.5 | 808 |
| 3 |
54.9* |
0.2* |
0.2* |
43.3* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 | 446 |
| B |
88.2* |
-- |
-- |
9.3* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 | 237 |
| A |
97.3* |
-- |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
1.0 |
-- |
-- |
2.0 |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.6* |
0.6* |
-- |
98.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 172 |
| M |
53.4* |
0.8* |
5.3* |
34.0* |
0.8 |
0.8 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.2 | 262 |
| |
| Basepair (641:1360)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
27.3* |
66.3* |
0.5* |
0.5* |
0.1 |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.2 | 807 |
| 3 |
49.4* |
49.4* |
-- |
0.4* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 445 |
| B |
5.1* |
93.2* |
-- |
0.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 236 |
| A |
97.3* |
-- |
-- |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
99.4* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 172 |
| M |
-- |
82.8* |
1.5* |
0.8* |
0.4 |
9.9 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
3.4 | 262 |
| |
| Basepair (642:1358)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
8.9 |
-- |
0.5 |
-- |
10.1 |
0.4 |
0.1* |
6.6 |
0.1 |
-- |
70.0* |
0.1 |
1.9* |
0.1 |
1.1 | 808 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 446 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.7 |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 172 |
| M |
-- |
-- |
27.5 |
-- |
-- |
-- |
29.0* |
1.1 |
0.4 |
20.2 |
0.4 |
-- |
11.8 |
-- |
5.7* |
0.4 |
3.4 | 262 |
| |
| Basepair (643:902)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
1.7 | 843 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 481 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 201 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1* |
4.3 | 262 |
| |
| Basepair (643:1355)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.4 |
3.6 |
-- |
-- |
59.7 |
34.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 808 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
41.3 |
57.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 446 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
69.2 |
30.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 237 |
| A |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
54.1 |
43.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 172 |
| M |
-- |
-- |
1.1 |
9.9 |
-- |
-- |
76.0 |
9.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 | 262 |
| |
| Basepair (644:903)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
0.2 |
1.8 |
71.9* |
-- |
0.5 |
0.4* |
-- |
5.8* |
0.1 |
17.1 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
1.2 | 842 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
80.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
18.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 481 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
62.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
37.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
49.0* |
-- |
48.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 201 |
| M |
0.4 |
-- |
0.8 |
5.7 |
81.6* |
-- |
1.5* |
1.1 |
-- |
-- |
0.4* |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
3.4 | 261 |
| |
| Basepair (645:761)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.6* |
72.4* |
3.6 |
0.1* |
1.4 |
1.7 |
6.3* |
0.3 |
2.0 |
3.9 |
0.1 |
0.8 |
-- |
3.1 |
2.5 |
1.2 | 883 |
| 3 |
-- |
1.0* |
95.8* |
-- |
-- |
1.3 |
1.0 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 | 521 |
| B |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 283 |
| A |
-- |
8.1* |
73.0* |
-- |
-- |
18.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| E |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.0 |
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-- |
-- |
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-- |
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| |
| Basepair (646:759)
|
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| GC
| CG
| UA
| AU
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| UG
| AA
| AC
| AG
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| CC
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| GG
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| UU
| gap
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|
|---|
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-- |
4.0 |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
-- |
11.0 |
31.0 |
-- |
-- |
56.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
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| |
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|
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| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
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| gap
| Seq
|
|---|
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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85.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 283 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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| Basepair (648:757)
|
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| GC
| CG
| UA
| AU
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| UG
| AA
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| Seq
|
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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15.0* |
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85.0* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
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|
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| GC
| CG
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| Seq
|
|---|
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1.7 |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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4.5 |
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-- |
-- |
-- |
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1.5 |
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-- |
-- |
-- |
0.8 |
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-- |
0.8 |
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| |
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|
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| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
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| CU
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| GG
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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18.0 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
1.5 |
-- |
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3.1 |
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| |
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|
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| CG
| UA
| AU
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| UG
| AA
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| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
6.0* |
10.0* |
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1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
0.4 |
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| |
| Basepair (652:753)
|
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| CG
| UA
| AU
| GU
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| AA
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| GG
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| gap
| Seq
|
|---|
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-- |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
8.1 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| C |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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0.8 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
16.5 | 262 |
| |
| Basepair (653:752)
|
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| Seq
|
|---|
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
7.1 |
-- |
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-- |
5.4 |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
1.0* |
-- |
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5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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10.9 |
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-- |
0.5 |
0.5 |
0.5 |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
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22.1 | 262 |
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| Basepair (654:751)
|
| Aln
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| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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2.5 |
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1.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.3 |
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0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- | 520 |
| B |
44.3* |
30.5* |
-- |
18.8* |
4.3 |
1.1 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- | 282 |
| A |
73.0* |
-- |
8.1* |
13.5* |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
74.0* |
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2.0* |
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16.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 100 |
| E |
2.0 |
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1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
1.0 |
0.5 |
-- | 201 |
| M |
5.0* |
0.8* |
5.7* |
50.0* |
1.1 |
0.4 |
7.6 |
-- |
3.8 |
-- |
0.4 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
22.6 | 262 |
| |
| Basepair (655:750)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.1* |
8.2* |
22.3* |
23.7* |
9.2 |
10.9 |
0.3 |
0.9 |
0.1 |
0.3 |
0.5 |
2.0 |
-- |
1.9 |
0.6 |
1.1 |
6.8 | 883 |
| 3 |
16.3* |
13.2 |
15.9 |
11.3* |
15.2 |
18.4* |
0.4 |
0.2 |
0.2 |
0.2* |
-- |
3.5 |
-- |
3.3 |
0.2 |
1.3 |
0.4 | 521 |
| B |
19.1* |
21.9 |
14.5 |
9.2* |
-- |
33.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- | 283 |
| A |
5.4* |
-- |
91.9* |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
89.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
3.0 |
-- | 100 |
| E |
13.9 |
3.5* |
4.0* |
16.4 |
39.3* |
0.5 |
1.0 |
0.5* |
0.5 |
0.5 |
-- |
9.0 |
-- |
8.5 |
0.5 |
1.0 |
1.0 | 201 |
| M |
5.0* |
1.1* |
9.5* |
56.5* |
0.8 |
-- |
0.4 |
2.7 |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
22.6 | 262 |
| |
| Basepair (656:749)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
38.7* |
8.6* |
23.0* |
20.2* |
0.2 |
0.2 |
0.6 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
8.0 | 882 |
| 3 |
28.1* |
14.6* |
37.7* |
19.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 | 520 |
| B |
38.3* |
3.9* |
25.2* |
32.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
97.0* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.5* |
32.3* |
61.7* |
4.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 | 201 |
| M |
37.4* |
-- |
2.7* |
29.4* |
0.8 |
0.8 |
1.1 |
0.8 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
26.8 | 262 |
| |
| Basepair (657:748)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
20.0 |
-- |
0.1* |
1.0 |
54.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
24.6 | 883 |
| 3 |
33.8 |
-- |
0.2* |
0.8 |
65.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 521 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
21.6 |
-- |
-- |
8.1 |
70.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
83.1* |
-- |
0.5* |
0.5* |
15.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 201 |
| M |
0.4 |
-- |
-- |
1.1 |
15.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.9 | 262 |
| |
| Basepair (658:747)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
73.6* |
0.7* |
-- |
0.1* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
24.8 | 883 |
| 3 |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 521 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
94.0* |
2.0* |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
98.5 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 201 |
| M |
-- |
14.5* |
1.5* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.6 | 262 |
| |
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