Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (16 of 60)
| Basepair (688:697)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
0.6 |
0.1 |
0.6 |
-- |
0.7 |
9.2 |
-- |
60.0* |
0.3* |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
28.0 | 883 |
| 3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
1.0 |
8.4 |
-- |
87.3* |
0.4* |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
1.8 | 521 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
95.8* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 283 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
18.9 |
-- |
81.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
30.0 |
-- |
62.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
2.5 |
15.4 |
-- |
76.6* |
-- |
-- |
-- |
1.0* |
1.0 |
-- |
-- |
2.5 | 201 |
| M |
0.4* |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.5 | 262 |
| |
| Basepair (689:696)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
52.7* |
2.6* |
0.8* |
16.2* |
0.7 |
0.5 |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
25.6 | 884 |
| 3 |
67.0* |
4.0* |
0.2* |
26.1* |
0.8 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.8 | 522 |
| B |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
18.8* |
10.4* |
0.5* |
66.8* |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 202 |
| M |
6.5* |
0.8* |
2.3* |
2.7* |
0.4 |
1.5 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 262 |
| |
| Basepair (690:695)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.5* |
35.3* |
2.0* |
1.5* |
0.3 |
17.2 |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.8 |
26.5 | 884 |
| 3 |
25.3* |
42.1* |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
27.4 |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
1.3* |
1.9 | 522 |
| B |
21.9* |
72.1* |
-- |
0.4* |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.2 | 283 |
| A |
97.3* |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
87.0* |
3.0* |
2.0* |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
16.8* |
7.4 |
1.0 |
0.5 |
1.0 |
66.3* |
1.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 |
2.0 | 202 |
| M |
1.9* |
1.9* |
5.0* |
3.4* |
0.4 |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
85.5 | 262 |
| |
| Basepair (691:694)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
0.5* |
0.8 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.6 |
0.7* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
63.0* |
5.6 |
0.7 |
1.0* |
26.3 | 879 |
| 3 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.3* |
9.3 |
1.0 |
1.5* |
1.0 | 517 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 278 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
63.4* |
23.8 |
2.5 |
4.0* |
2.5 | 202 |
| M |
-- |
1.5* |
2.3 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.8* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
6.1* |
0.4 |
0.4 |
0.4* |
86.6 | 262 |
| |
| Basepair (699:727)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
2.8* |
0.2 |
0.2* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
95.3 | 905 |
| 3 |
-- |
4.6* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
93.2 | 543 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 284 |
| A |
-- |
67.6* |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
18.9* |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
5.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.6 | 230 |
| M |
-- |
-- |
0.4* |
0.8* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 | 262 |
| |
| Basepair (702:726)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.6* |
-- |
0.4 |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3* |
93.8 | 959 |
| 3 |
5.9* |
-- |
0.3 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
91.9* |
-- |
5.4* |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.7* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.9* |
92.6 | 230 |
| M |
-- |
-- |
0.4* |
0.4* |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.6 | 262 |
| |
| Basepair (703:725)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.8* |
2.5* |
0.7* |
1.6* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
93.8 | 959 |
| 3 |
1.3* |
4.0* |
1.0* |
2.2* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
18.9* |
64.9* |
16.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
93.0 | 229 |
| M |
-- |
-- |
0.4* |
0.8* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.5 | 262 |
| |
| Basepair (704:724)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
3.5* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2* |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
93.8 | 959 |
| 3 |
-- |
5.7* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
-- |
91.9* |
8.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
-- |
-- |
-- |
6.1* |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.6 | 230 |
| M |
-- |
-- |
0.4* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
98.1 | 262 |
| |
| Basepair (705:723)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
3.9* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
1.6* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
0.2* |
93.8 | 959 |
| 3 |
-- |
6.2* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
0.4* |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
5.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.6 | 230 |
| M |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
97.8 | 262 |
| |
| Basepair (706:722)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.3* |
1.7* |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
3.9* |
-- |
-- |
93.7 | 959 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
2.5* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
6.2* |
-- |
-- |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.7* |
0.9* |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.6 | 230 |
| M |
-- |
-- |
0.4* |
1.1* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.8 | 262 |
| |
| Basepair (707:721)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.1* |
-- |
3.6* |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
93.7 | 959 |
| 3 |
0.2* |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.2 |
-- |
5.9* |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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| A |
-- |
2.7 |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7* |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
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-- |
-- |
0.4* |
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| M |
-- |
-- |
0.8* |
0.8* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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97.7 | 262 |
| |
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| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
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| CC
| CU
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| GG
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| UU
| gap
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|
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-- |
-- |
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-- |
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-- |
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-- |
0.1 |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
0.5 |
5.4* |
-- |
0.2* |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
2.2* |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
8.1 |
86.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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0.4 |
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-- |
-- |
5.7* |
92.6 | 230 |
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-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
97.9 | 262 |
| |
| Basepair (709:719)
|
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| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
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0.1 |
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-- |
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0.1 |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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93.7 | 959 |
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0.2 |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
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2.7* |
-- |
10.8* |
35.1 |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
0.9* |
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-- |
-- |
-- |
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5.2* |
-- |
-- |
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-- |
92.6 | 230 |
| M |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
97.8 | 262 |
| |
| Basepair (710:718)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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3.1* |
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-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
0.2 |
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-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
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5.1* |
2.7* |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.9 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
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78.4* |
8.1* |
5.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
-- |
-- |
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5.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.6 | 230 |
| M |
0.4* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
97.8 | 262 |
| |
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|
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| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
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| CC
| CU
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| GG
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
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-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
-- |
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0.2* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.1 | 594 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
| A |
10.8* |
59.5* |
-- |
8.1* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
18.9 | 37 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
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-- |
-- |
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-- |
6.1* |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
0.8* |
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-- |
-- |
0.4 |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
97.4 | 262 |
| |
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|
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| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
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| GG
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| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.3* |
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0.3 |
-- |
-- |
1.4* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.9 | 958 |
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2.0* |
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-- |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.7 | 593 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 327 |
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2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.8 | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 103 |
| E |
-- |
-- |
5.7* |
-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
92.6 | 230 |
| M |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4* |
-- |
0.8* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
97.4 | 262 |
| |
| Basepair (728:743)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.6 |
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-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
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1.3* |
-- |
2.7 |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
89.7 | 522 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 283 |
| A |
32.4 |
18.9* |
-- |
2.7 |
45.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
6.4* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
91.7 | 202 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 | 262 |
| |
| Basepair (729:742)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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1.2 |
0.6* |
1.9 |
0.1 |
0.3 |
2.7 |
0.6 |
38.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
50.6 | 884 |
| 3 |
5.0* |
2.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
52.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
38.9 | 522 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
70.3* |
29.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
1.0* |
12.0 |
-- |
1.0 |
20.0 |
5.0 |
58.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
2.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 | 203 |
| M |
-- |
-- |
1.5* |
1.1 |
0.4* |
0.8 |
1.1 |
-- |
2.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.8 | 262 |
| |
| Basepair (730:741)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
47.1* |
0.3* |
0.2* |
0.3* |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
50.4 | 883 |
| 3 |
60.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
39.2 | 521 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 281 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
92.0* |
-- |
2.0* |
1.0* |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 | 203 |
| M |
2.7* |
1.1* |
-- |
0.8* |
1.1 |
1.1 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
92.0 | 262 |
| |
| Basepair (731:740)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
1.7 |
0.9 |
1.0* |
-- |
44.7* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
50.5 | 885 |
| 3 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
59.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
39.4 | 523 |
| B |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
1.1 | 283 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
8.0 |
5.0 |
1.0* |
-- |
82.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
2.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 | 203 |
| M |
1.1* |
-- |
1.1 |
3.1* |
-- |
1.9* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
92.0 | 262 |
| |
| Basepair (732:739)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.0* |
36.7* |
8.5* |
0.7* |
0.3 |
0.5 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
50.2 | 884 |
| 3 |
3.3* |
46.7* |
10.3* |
0.2* |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
38.9 | 522 |
| B |
3.2* |
77.3* |
19.1* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
21.6* |
70.3* |
-- |
2.7* |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
76.0* |
13.0* |
3.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
2.0 |
1.0 |
1.0 |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 | 203 |
| M |
0.4* |
1.5* |
3.1* |
0.8* |
0.4 |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
92.0 | 262 |
| |
| Basepair (733:738)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
6.2 |
2.0 |
-- |
-- |
39.9* |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2* |
0.2* |
-- |
0.1 |
0.2 |
50.8 | 884 |
| 3 |
-- |
9.4 |
0.2 |
-- |
-- |
51.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
39.5 | 522 |
| B |
-- |
14.2 |
0.4 |
-- |
-- |
85.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
-- |
24.3 |
-- |
-- |
-- |
67.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.1 | 37 |
| C |
-- |
2.0 |
8.0 |
-- |
-- |
86.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 | 203 |
| M |
-- |
1.5* |
3.4* |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
92.7 | 262 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)