Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (17 of 60)


Basepair (762:902)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 97.6* 0.1* 1.1* 0.1 0.1 -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.8846
3 -- 99.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2484
B -- 99.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4243
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- 98.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.0100
E -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --204
M -- 93.5* 0.4* 3.4* 0.4 0.4 -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 1.6262
 
Basepair (763:901)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.8* 91.8* 4.4* 1.7* 0.2 0.4 -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.1 0.1 -- 0.2846
3 1.2* 93.6* 2.1* 2.5* -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 0.2484
B 2.5* 91.4* -- 4.9* -- -- -- -- 0.8 -- -- -- -- -- -- -- 0.4243
A -- 73.0* 27.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- 98.0* 1.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0 -- -- --100
E -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --204
M 0.4 86.3* 9.9* 0.8 0.8* 1.1 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4 -- 0.4262
 
Basepair (764:900)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.1 -- 2.7 0.2 -- -- -- -- 0.4 0.2 95.0* -- -- 0.1* 0.7 0.4846
3 -- 0.2 -- 3.7 0.2 -- -- -- -- -- 0.2 95.2 -- -- -- -- 0.4484
B -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- 98.8 -- -- -- -- 0.8243
A -- 2.7* -- 48.6* -- -- -- -- -- -- -- 48.6 -- -- -- -- --37
C -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.0 -- -- -- -- 1.0100
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5 99.5 -- -- -- -- --204
M -- -- -- 1.9 0.4 -- -- -- -- 1.1 0.4 93.1* -- -- 0.4* 2.3 0.4262
 
Basepair (765:899)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 97.9* -- 0.9* 0.2* 0.1 0.1 -- 0.1 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- 0.4844
3 99.2 -- -- -- 0.2 -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4482
B 98.8 -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.8243
A 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 99.5 -- -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --202
M 94.7* -- 3.1* 0.8* -- 0.4 -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- 0.8262
 
Basepair (766:896)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.1* 97.4* -- -- 0.7 1.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.1 0.3846
3 -- -- -- 97.5 -- -- -- 2.3 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2484
B -- -- -- 99.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4242
A -- -- -- 70.3 -- -- -- 29.7 -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M -- -- 0.4* 96.2* -- -- 2.3 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4 0.8262
 
Basepair (767:895)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.2 1.3 0.6* 0.2* 61.4* 12.0 23.6 0.1 0.1* -- -- -- -- 0.1 0.2847
3 -- -- -- 0.2 1.0* -- 56.1* 1.0 41.2 0.2 -- -- -- -- -- -- 0.2485
B -- -- -- -- -- -- 97.9 1.2 -- 0.4 -- -- -- -- -- -- 0.4243
A -- -- -- 2.7 -- -- 91.9 5.4 -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- -- -- -- -- -- 3.0 96.0 -- -- 1.0 -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- -- 2.4* -- 0.5 -- 97.1* -- -- -- -- -- -- -- --205
M -- -- 0.8 3.8 -- 0.8* 93.5* 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 0.4262
 
Basepair (767:2110)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.3 0.6* 20.1 0.6* -- 4.6 1.3 72.4* -- -- -- -- -- -- -- 0.1782
3 -- 0.2 -- 34.9 1.2* -- 4.3 -- 59.4* -- -- -- -- -- -- -- --421
B -- 0.4 -- 0.9 -- -- 4.3 -- 94.4 -- -- -- -- -- -- -- --234
A -- -- -- -- -- -- 21.6 -- 78.4 -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- 1.0 -- -- -- -- -- -- 99.0 -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- 96.0 3.3 -- -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- -- --150
M -- -- 1.9* 3.8 -- -- 6.9 3.8 83.1* -- -- -- -- -- -- -- 0.4261
 
Basepair (768:893)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.3* -- 2.0 46.8* 5.0 0.1* 27.7 0.5 -- 11.9* -- -- 1.5 0.8 0.6 0.1 1.6846
3 1.4 -- -- 47.1* 7.2 -- 38.4 0.4 -- 0.8 -- -- 2.3* 0.8 0.8* -- 0.6484
B 0.8 -- -- 5.8 13.2* -- 72.7* -- -- 1.7 -- -- 4.5 0.8 -- -- 0.4242
A 13.5* -- -- 32.4* 8.1 -- 24.3 5.4 -- -- -- -- -- 5.4 10.8 -- --37
C -- -- 2.0 -- -- -- 1.0 -- -- 97.0 -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- 98.0 -- -- 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0205
M 1.5* -- 5.7* 64.1* 2.7 0.4 17.9 0.8 -- -- -- -- 0.8 1.1 0.4 0.4 4.2262
 
Basepair (768:2111)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.8* -- 1.0 0.1 -- 1.9 12.5 5.8 55.5* 12.8* 0.1 -- 2.7 5.4 -- 0.1* 0.2782
3 -- -- -- -- -- 1.0 19.5 4.3 60.8* 1.0 -- -- 4.0* 9.3 -- -- 0.2421
B -- -- -- -- -- -- 35.0 6.8 36.8* 1.7 -- -- 7.3* 12.4 -- -- --234
A -- -- -- -- -- 10.8 -- -- 62.2 -- -- -- -- 27.0 -- -- --37
C -- -- 2.0 -- -- -- 1.0 -- -- 96.0 1.0 -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- -- -- -- 0.7 1.3 97.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.7150
M 5.4* -- 2.3* 0.4 -- 4.2 5.7 10.3 68.2* -- -- -- 1.5 1.1 -- 0.4 0.4261
 
Basepair (769:892)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 23.5* 68.7* 3.3* 2.2* 1.1 -- -- -- -- 0.1 -- 0.5 -- -- 0.2 -- 0.3846
3 40.9* 58.1* -- 0.4* -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 0.4484
B -- 99.2 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- 0.4242
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- 99.0* 1.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 96.1* 2.4* -- 1.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5205
M 0.4* 76.7* 10.3* 6.5* 3.4 -- -- -- -- -- -- 1.5 -- -- 0.8 -- 0.4262
 
Basepair (770:891)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 8.3* 57.6* 10.4* 22.1* -- 0.4 0.2 -- -- 0.1 -- -- -- 0.1 -- 0.1 0.7846
3 13.8* 48.8* 1.0* 35.3* -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- 0.4484
B 13.6* 82.6* 1.7* -- -- 0.8 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- 0.8242
A -- 97.3* 2.7* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 2.0* 79.0* 17.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.0100
E 16.6* 0.5* -- 82.9* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M 0.4* 65.6* 25.2* 6.1* -- 0.4 0.8 -- -- 0.4 -- -- -- -- -- 0.4 0.8262
 
Basepair (771:890)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 27.3* 6.9* 24.3* 37.2* 0.6 2.7 0.1 0.1 -- -- -- -- -- -- 0.1 0.4 0.2846
3 24.2* 8.5* 37.6* 24.4* 0.2 4.3 0.2 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 0.2 0.2484
B 35.1* 10.7* 0.8* 47.5* 0.4 4.1 0.4 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4242
A 86.5* 5.4* -- 8.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 90.0* -- -- 8.0* 2.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- 6.8* 87.3* -- -- 5.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5 --205
M 9.2* 6.5* 9.2* 72.1* 0.8 0.8 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4 0.8 0.4262
 
Basepair (772:889)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 55.6* 0.4* 2.1* 25.1* 14.2 0.2 0.2 0.8 -- -- -- -- -- -- -- 1.3 0.1846
3 66.1* 0.2* 1.2* 20.9* 9.3 0.2 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 1.9 --484
B 39.7* 0.4* 0.4* 38.4* 16.9 -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 3.7 --242
A 89.2* -- -- 5.4* 5.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 22.0 -- -- 9.0 67.0* -- -- 1.0* -- -- -- -- -- -- -- 1.0 --100
E 93.2* -- 2.4* 2.9* 1.0 0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M 48.9* 0.8* 4.6* 38.9* 3.1 0.4 0.4 2.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 0.4262
 
Basepair (773:888)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 77.5* 0.1* 3.1* 7.6* -- 0.9 -- 9.3 -- 0.4 -- -- -- -- -- 0.9 0.1846
3 92.6* -- 2.3* 3.7* -- 1.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --484
B 93.8* -- 1.7* 4.1* -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --242
A 64.9* -- 5.4 13.5* -- 16.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 81.0* -- 2.0* 15.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.0 --100
E 96.1* -- 2.4* 1.5* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M 48.5* 0.4* 5.0* 11.8* -- 0.4 -- 30.2 -- 1.1 -- -- -- -- -- 2.3 0.4262
 
Basepair (774:887)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.6* 21.1* 74.3* 1.4* 0.2 0.9 0.5 -- 0.2 -- -- -- 0.1 -- -- 0.5 0.1847
3 -- 10.5* 88.5* -- -- 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --485
B -- 6.2* 92.2* -- -- 1.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --243
A -- 91.9* 8.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- 2.0* 98.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- 1.0* 98.5* -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M 1.9* 48.1* 38.9* 4.6* 0.8 1.1 1.5 -- 0.8 -- -- -- 0.4 -- -- 1.5 0.4262
 
Basepair (776:779)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 1.4* 98.1* -- -- -- 0.1 0.1 -- -- -- -- -- -- -- 0.3887
3 -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --525
B -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --283
A -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M -- -- 4.6* 93.5* -- -- -- 0.4 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 1.2262
 
Basepair (776:871)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- -- -- 0.1 2.0 0.2 95.1* -- -- -- -- -- -- 1.2* 1.2886
3 -- -- -- -- -- -- -- 0.2 98.3 -- -- -- -- -- -- -- 1.5524
B -- -- -- -- -- -- -- -- 97.9 -- -- -- -- -- -- -- 2.1283
A -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- -- -- -- -- -- 2.0 1.0 97.0 -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- -- -- -- -- 0.5 98.5 -- -- -- -- -- -- -- 1.0204
M -- -- -- -- -- 0.4 6.1 -- 88.2* -- -- -- -- -- -- 4.2* 1.2262
 
Basepair (778:1836)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 1.5 -- 0.3* -- 1.5 -- -- 96.1* 0.1 -- 0.1 -- -- 0.1 0.2786
3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.8 -- -- 0.2 -- -- -- --424
B -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- --236
A -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- --37
C -- -- -- -- -- -- 2.0 -- -- 98.0 -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.3 -- -- 0.7 -- -- -- --151
M -- -- 4.6 -- 0.8* -- 3.8 -- -- 89.3* 0.4 -- -- -- -- 0.4 0.8262
 
Basepair (780:866)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1* 0.9* 1.7* 96.3* 0.3 -- 0.1 -- 0.1 -- -- -- -- -- -- 0.5 --888
3 -- -- 0.4* 99.4* -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- --525
B -- -- -- 99.6 -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- --283
A -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- 1.0* 99.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M 0.4* 3.0* 4.9* 88.6* 1.1 -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 1.5 --263
 
Basepair (780:872)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2 -- 0.3* 60.9* 0.2 -- 8.9 26.7 -- -- 0.8* 0.1 -- -- 0.2 1.5 0.1888
3 -- -- -- 51.8* -- -- 7.0 40.8 -- -- -- -- -- -- 0.2* 0.2 --525
B -- -- -- 86.6 -- -- 13.1 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- --283
A -- -- -- 70.3 -- -- -- 29.7 -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- -- -- 58.0 -- -- 42.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- 1.0 -- -- -- 98.0* -- -- -- -- -- -- 0.5 0.5* --205
M 0.8 -- 1.1* 80.2* 0.8 -- -- 8.7 -- -- 2.7* 0.4 -- -- 0.4 4.6 0.4263
 
Basepair (781:865)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 9.8* 29.8* 40.3* 14.1* 3.0 0.2 -- -- -- 0.7 0.1 -- -- -- 0.2 1.6 0.1886
3 14.1* 20.5* 57.9* 1.5* 4.2 0.2 -- -- -- 0.8 0.2 -- -- -- 0.2 0.2 0.2523
B 17.4* 33.5* 39.1* 1.1* 6.8 0.4 -- -- -- 1.4 0.4 -- -- -- -- -- --281
A 64.9* 18.9* 8.1* -- 8.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 3.0* 1.0* 14.0* 70.0* 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 11.0 --100
E 1.0* 2.9* 92.2* 2.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5 0.5 0.5205
M 3.8* 59.3* 15.2* 17.9* 1.5 0.4 -- -- -- 0.8 -- -- -- -- 0.4 0.8 --263
 
Basepair (782:864)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.5 45.3* 24.4* 3.8 22.6* 0.7 0.1 0.1* -- -- -- -- 0.2 -- -- 0.1 0.1888
3 2.5 42.5* 12.6* 3.6 38.1* 0.2 -- 0.2* -- -- -- -- 0.2 -- -- -- 0.2525
B 0.7* 76.3* 21.2* 0.7* 0.4 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4283
A 2.7 18.9* 16.2* 13.5 48.6* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 1.0* 66.0* 32.0* -- 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 4.9 0.5* -- 5.9 87.8* -- -- 0.5* -- -- -- -- 0.5 -- -- -- --205
M 3.0* 43.0* 45.2* 5.7* -- 1.9 0.4 -- -- -- -- -- 0.4 -- -- 0.4 --263
 
Basepair (783:863)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 74.2* 11.6* 1.7* -- 8.2 -- -- 0.2 1.0 -- 0.3 -- 0.1 0.9 1.2 0.2888
3 -- 87.4* 0.2* 0.2* -- 11.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4525
B -- 78.4 -- -- -- 21.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4283
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- 98.0* 2.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- 97.6* 0.5* 0.5* -- 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5205
M 0.8* 38.8* 38.0* 5.3* -- 4.2 -- -- 0.8 3.4 -- 1.1 -- 0.4 3.0 4.2 --263
 
Basepair (784:862)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.8* 23.0* 6.3* 56.6* 1.1 1.0 0.1 0.2 -- 0.2 6.2 0.3 -- -- 0.7 1.0 0.3888
3 3.0* 38.1* 4.6* 52.4* 0.4 0.8 -- 0.2 -- 0.2 0.2 -- -- -- -- 0.2 --525
B 0.7* 1.1* 3.5* 94.3* -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- --283
A 27.0* 62.2* -- 8.1* 2.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 2.0* 2.0* 2.0* 93.0* 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 2.0* 84.4* 6.8* 2.9* 0.5 2.0 -- -- -- 0.5 0.5 -- -- -- -- 0.5 --205
M 2.7 0.8 11.4* 51.3* 2.7 1.9 0.4 0.4 -- 0.4 20.5* 1.1 -- -- 2.3 3.0 1.2263
 
Basepair (785:861)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 8.9* 5.0 6.1 4.7* 0.2 67.8* 1.7 0.6 0.6 0.9* 0.7 0.2 -- 1.8 -- 0.7 0.2887
3 4.0* 2.7 1.5 0.2* 0.2 87.4* -- -- 0.6 -- -- -- -- 3.1 -- -- 0.4524
B -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --283
A 54.1* -- 13.5 2.7* 2.7 24.3* -- -- 2.7 -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- 1.0 3.0 -- -- 93.0* -- -- -- 1.0* -- -- -- -- -- 2.0 --100
E 0.5* 6.9 1.5 -- -- 81.4* -- -- 1.0 -- -- -- -- 7.8 -- -- 1.0204
M 22.1* 11.0 16.3 15.6* 0.4 19.0* 5.7 1.9 0.8 2.7* 2.3 0.8 -- -- -- 1.5 --263
 
Basepair (786:860)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 6.2 0.5* 2.3* 13.3 74.7* 1.8 0.5 0.5* -- -- -- -- -- -- -- 0.5 --888
3 5.3 -- 0.2* -- 94.1* 0.2 -- 0.2* -- -- -- -- -- -- -- -- --525
B -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --283
A 43.2 -- 2.7* -- 54.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- -- 2.0* 1.0 96.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0 --100
E 5.9 -- -- -- 93.2* 0.5* -- 0.5* -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M 10.3* 1.5* 6.5* 44.5* 27.8 5.7 1.5 1.1 -- -- -- -- -- -- -- 1.1 --263
 
Basepair (787:859)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 33.5* 1.1 4.2 49.4* 4.5 6.0* 0.1 -- 0.1 0.1* -- -- -- -- -- 0.9 --886
3 34.8* 0.8 1.7 48.4* 5.4 8.8* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 --523
B 38.4* 0.7 0.4 35.2* 8.9 16.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --281
A 89.2* -- -- 10.8* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 33.0* -- 3.0* 53.0* 8.0 2.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0 --100
E 20.0* 1.0* 3.9* 72.7* 2.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5 --205
M 31.2* 2.3* 9.5* 50.2* 1.5 1.9 0.4 -- 0.4 0.4 -- -- -- -- -- 2.3 --263
 
Basepair (788:858)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 34.4* 32.5* 5.7* 17.9* 0.8 1.2 0.3 0.6 5.5 0.1 0.2 -- 0.1 -- 0.1 0.1 0.3887
3 44.3* 33.8* 4.6* 13.4* 1.1 1.1 -- 0.8 0.2 0.2 0.4 -- 0.2 -- -- -- --524
B 32.6* 60.3* 5.3* -- -- 0.4 -- -- -- 0.4 0.7 -- 0.4 -- -- -- --282
A 91.9* -- -- 8.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 2.0* 90.0* 8.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 52.2* 3.4* 4.4* 32.2* 2.9 2.4 -- 2.0 0.5 -- -- -- -- -- -- -- --205
M 27.0* 8.0* 7.2* 33.8* 0.4 1.9 1.1 0.4 18.3 -- -- -- -- -- 0.4 0.4 1.2263
 
Basepair (789:856)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.5* 79.5* 13.7* 1.4* -- 1.2 0.7 -- 0.1 0.9 0.2 0.3 0.1 0.5 0.2 0.1 0.6888
3 0.8* 77.0* 17.5* 0.4* -- 1.3 -- -- -- 1.1 0.4 0.4 0.2 0.8 -- -- 0.2525
B -- 98.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.7 -- -- 0.4283
A -- 83.8* 8.1* -- -- 8.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C -- 99.0* 1.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 2.0* 45.9* 42.9* 1.0* -- 2.0 -- -- -- 2.9 1.0 1.0 0.5 1.0 -- -- --205
M -- 77.2* 11.0* 3.8* -- 1.5 2.3 -- 0.4 0.8 -- 0.4 -- -- 0.8 0.4 1.5263
 

Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)