Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (20 of 60)
| Basepair (870:880)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
57.3* |
0.4* |
1.2* |
8.4* |
24.6 |
-- |
1.1 |
5.7 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.1 |
-- | 848 |
| 3 |
51.3* |
-- |
-- |
9.9* |
38.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 485 |
| B |
81.1* |
-- |
-- |
10.7* |
8.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
97.3* |
-- |
-- |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
98.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- | 100 |
| E |
8.3 |
-- |
-- |
10.2 |
81.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
| M |
52.9* |
1.1* |
3.8* |
8.7* |
8.0 |
-- |
3.4 |
18.3 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
2.7 |
-- | 263 |
| |
| Basepair (871:879)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
94.9* |
0.1* |
0.2* |
2.0* |
0.8 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
0.2 | 847 |
| 3 |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 484 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
97.3 |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
97.0* |
1.0* |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
98.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 204 |
| M |
86.3* |
-- |
0.8* |
5.7* |
2.3 |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 |
-- | 263 |
| |
| Basepair (872:878)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.9 |
10.6 |
9.7* |
-- |
47.2* |
-- |
-- |
-- |
28.0* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
0.4 | 846 |
| 3 |
-- |
0.2 |
0.8 |
7.7* |
-- |
43.1* |
-- |
-- |
-- |
43.7* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
0.4 | 483 |
| B |
-- |
-- |
-- |
15.4* |
-- |
77.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.1 |
0.4 | 241 |
| A |
-- |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
56.8* |
-- |
-- |
-- |
29.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
13.0 |
42.0* |
-- |
42.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
97.1* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 205 |
| M |
-- |
2.7 |
27.8 |
1.1* |
-- |
56.7* |
-- |
-- |
-- |
9.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
0.8 | 263 |
| |
| Basepair (873:876)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 887 |
| 3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
97.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 524 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 283 |
| A |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
27.0 |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
64.9 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 204 |
| M |
-- |
-- |
5.7 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
92.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| |
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