Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (21 of 60)
| Basepair (901:1358)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.3 |
-- |
2.0 |
-- |
0.6 |
-- |
3.6 |
-- |
0.1* |
0.9 |
-- |
-- |
89.2* |
0.1 |
-- |
-- |
1.2 | 812 |
| 3 |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
93.3 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 449 |
| B |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
92.0 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
73.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
95.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 174 |
| M |
7.2 |
-- |
1.5 |
-- |
0.4 |
-- |
6.8 |
-- |
0.4* |
0.4 |
-- |
-- |
79.8* |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 263 |
| |
| Basepair (905:1300)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.1* |
62.4* |
11.5* |
6.3* |
1.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.5 | 820 |
| 3 |
0.4* |
88.2* |
8.3* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 457 |
| B |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 238 |
| A |
-- |
94.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
1.1* |
73.6* |
20.9* |
4.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 182 |
| M |
46.4* |
3.8* |
20.9* |
16.7* |
3.8 |
0.8 |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
3.8 | 263 |
| |
| Basepair (906:1299)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
33.7* |
59.0* |
2.4* |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
2.3 | 822 |
| 3 |
-- |
43.8* |
52.7* |
3.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 459 |
| B |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 239 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
89.1* |
3.3* |
7.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 183 |
| M |
1.9* |
28.9* |
54.8* |
2.3* |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
6.4 | 263 |
| |
| Basepair (907:1298)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4* |
80.0* |
14.8* |
2.2* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.6 |
1.4 | 822 |
| 3 |
0.7* |
80.4* |
15.7* |
2.8* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 459 |
| B |
-- |
99.2* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 239 |
| A |
2.7* |
62.2* |
5.4* |
29.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
1.1* |
60.1* |
37.7* |
0.5* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 183 |
| M |
-- |
71.9* |
19.0* |
1.9* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
1.9 |
4.2 | 263 |
| |
| Basepair (908:1297)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.3* |
45.4* |
41.2* |
3.0* |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.5 |
1.4 | 822 |
| 3 |
12.6* |
32.9* |
49.2* |
3.7* |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 459 |
| B |
2.1* |
53.6* |
42.7* |
0.4* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 239 |
| A |
18.9* |
56.8* |
-- |
24.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
94.0* |
6.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
24.6* |
1.6* |
67.8* |
3.8* |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 183 |
| M |
0.8* |
48.7* |
40.7* |
3.0* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
1.5 |
4.2 | 263 |
| |
| Basepair (909:1296)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.1* |
58.0* |
7.7* |
15.8* |
0.5 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 |
1.3 | 821 |
| 3 |
5.5* |
83.0* |
10.7* |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 458 |
| B |
8.8* |
78.6* |
11.3* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
| A |
-- |
86.5* |
10.8* |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
94.0* |
6.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
2.2* |
88.0* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 183 |
| M |
37.6* |
0.8* |
3.0* |
49.4* |
1.5 |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
1.5 |
3.8 | 263 |
| |
| Basepair (910:1295)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.1* |
73.4* |
3.2* |
12.7* |
0.4 |
0.4 |
1.1 |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
1.3 | 832 |
| 3 |
-- |
99.1* |
0.4* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 469 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
98.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
98.5* |
1.0* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 194 |
| M |
19.4* |
18.3* |
8.7* |
40.3* |
1.1 |
0.8 |
3.4 |
1.5 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
1.1 |
3.8 | 263 |
| |
| Basepair (911:1294)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
1.1 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
7.3 |
0.1 |
0.4* |
0.1 |
0.1* |
-- |
88.1* |
0.2 |
-- |
-- |
1.7 | 826 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 464 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 194 |
| M |
0.4 |
-- |
3.4 |
0.8 |
0.8 |
0.4 |
22.5 |
0.4 |
1.1* |
0.4 |
0.4* |
-- |
63.4* |
0.4 |
-- |
-- |
5.8 | 262 |
| |
| Basepair (912:1293)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
-- |
0.8* |
90.7* |
0.1 |
-- |
4.2 |
1.2 |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.4 |
2.1 | 829 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 466 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 235 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 194 |
| M |
0.4 |
-- |
2.7* |
71.1* |
0.4 |
-- |
13.3 |
3.8 |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
1.1 |
6.0 | 263 |
| |
| Basepair (913:1071)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.8 |
1.4 |
-- |
-- |
69.6* |
5.9 |
0.8 |
0.6 |
-- |
0.1* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
20.3 | 849 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
87.0* |
9.9 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.2* |
0.2 | 486 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
96.7 |
1.7 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
13.9 |
-- |
-- |
66.7* |
2.8 |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
5.6 |
-- |
-- |
2.8* |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
79.3 |
20.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 208 |
| M |
-- |
-- |
2.7 |
2.3 |
-- |
-- |
25.9* |
0.8 |
0.8 |
1.9 |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
65.5 | 263 |
| |
| Basepair (914:1070)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
0.4 |
28.6* |
0.8 |
25.3 |
0.2 |
-- |
0.1* |
0.2 |
22.6* |
-- |
-- |
20.0 | 850 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.6 |
25.1* |
-- |
33.5 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
39.4* |
-- |
-- |
0.6 | 487 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
42.6 |
-- |
55.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.6 |
27.8 |
-- |
38.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.8 |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
71.0 |
-- |
29.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
4.8* |
-- |
6.7 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
86.6* |
-- |
-- |
0.5 | 209 |
| M |
-- |
-- |
-- |
5.3 |
-- |
-- |
19.0* |
2.7 |
8.7 |
0.8 |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
63.0 | 263 |
| |
| Basepair (915:928)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.2* |
3.9* |
72.4* |
5.2* |
0.1 |
0.8 |
1.8 |
-- |
0.2 |
1.2 |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.7 |
0.2 |
6.5 | 854 |
| 3 |
10.4* |
3.7* |
80.7* |
4.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 492 |
| B |
18.6* |
0.8* |
71.1* |
8.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 242 |
| A |
2.7* |
43.2* |
54.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
2.8* |
-- |
95.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 213 |
| M |
0.8* |
5.7* |
46.2* |
8.8* |
0.4 |
2.7 |
5.7 |
-- |
-- |
3.8 |
0.8 |
1.5 |
0.4 |
-- |
2.3 |
0.8 |
20.2 | 262 |
| |
| Basepair (916:927)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
39.9* |
12.8* |
1.8 |
18.9 |
0.4 |
0.1 |
0.1* |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
23.3* |
2.2 | 854 |
| 3 |
14.6* |
16.1* |
0.8 |
27.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
40.2* |
0.4 | 492 |
| B |
18.6* |
32.6* |
-- |
47.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
56.8* |
-- |
5.4* |
37.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
97.0* |
-- |
2.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
2.8* |
0.5* |
0.9 |
2.3 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.5* |
0.5 | 213 |
| M |
65.6* |
11.5* |
3.4* |
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0.8 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
6.5 | 262 |
| |
| Basepair (917:926)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.2* |
15.2* |
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19.6* |
4.6 |
2.6 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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19.1* |
8.1* |
66.1* |
3.5* |
0.8 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 492 |
| B |
34.3* |
13.2* |
41.7* |
5.4* |
1.7 |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
29.7* |
21.6* |
32.4* |
10.8* |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
86.0* |
3.0* |
-- |
-- |
11.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 213 |
| M |
0.8* |
1.5* |
20.5* |
57.4* |
13.3 |
1.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 | 263 |
| |
| Basepair (918:925)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
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38.9* |
0.8* |
42.1* |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
1.7 | 856 |
| 3 |
4.7* |
66.9* |
0.4* |
27.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 493 |
| B |
1.6* |
42.4* |
0.8* |
54.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
51.4* |
40.5* |
-- |
8.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
94.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
99.1* |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 213 |
| M |
5.3* |
1.1* |
1.9* |
84.0* |
0.4 |
-- |
0.8 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
4.9 | 263 |
| |
| Basepair (919:924)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
20.1 |
2.0 |
0.5* |
0.1 |
73.9* |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
2.8 | 857 |
| 3 |
-- |
34.0 |
-- |
-- |
-- |
65.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 | 494 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 244 |
| A |
-- |
18.9 |
-- |
-- |
-- |
81.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
96.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
2.0 | 100 |
| E |
-- |
75.1* |
-- |
-- |
-- |
23.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
0.5 | 213 |
| M |
-- |
1.5 |
6.1 |
1.5* |
0.4 |
81.4* |
-- |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
7.6 | 263 |
| |
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