Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (23 of 60)
| Basepair (1014:2302)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
70.0* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3* |
-- |
-- |
28.9 | 794 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.1* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5* |
-- |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 99 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.3* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
1.3* |
-- |
-- |
-- | 149 |
| M |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 |
-- |
-- |
14.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
83.9 | 273 |
| |
| Basepair (1045:1069)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
71.3* |
6.8* |
6.6* |
3.4* |
2.5 |
0.1 |
1.3 |
0.6 |
0.1 |
0.5 |
0.5 |
0.2 |
3.0 |
0.1 |
0.2 |
0.6 |
2.2 | 864 |
| 3 |
83.6* |
11.5* |
-- |
0.4* |
3.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 | 488 |
| B |
77.0* |
23.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 244 |
| A |
94.4* |
-- |
-- |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 | 36 |
| C |
94.0* |
-- |
-- |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
88.9* |
0.5* |
-- |
0.5* |
7.7 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 | 208 |
| M |
41.3* |
1.1* |
20.7* |
8.0* |
2.2 |
0.4 |
4.0 |
1.4 |
0.4 |
1.4 |
0.7 |
0.7 |
9.4 |
-- |
0.7 |
1.8 |
5.8 | 276 |
| |
| Basepair (1046:1068)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.4* |
25.1* |
21.2* |
42.9* |
1.6 |
1.2 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.7 |
1.9 | 865 |
| 3 |
6.7* |
42.7* |
0.6* |
43.8* |
2.2 |
1.6 |
0.2 |
0.4 |
0.4 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 | 489 |
| B |
2.5* |
-- |
1.2* |
87.7* |
4.5 |
0.8 |
0.4 |
0.8 |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- | 244 |
| A |
75.0* |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
16.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
4.0* |
96.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
98.1* |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 209 |
| M |
1.8* |
2.9* |
63.8* |
22.1* |
1.1 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
1.4 |
5.8 | 276 |
| |
| Basepair (1047:1067)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.9* |
76.7* |
12.6* |
2.0* |
1.4 |
1.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.7 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
2.3 | 862 |
| 3 |
1.4* |
88.5* |
1.8* |
2.3* |
2.3 |
1.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
1.0 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 487 |
| B |
0.8* |
91.4* |
-- |
2.0* |
2.0 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 244 |
| A |
13.9 |
22.2* |
25.0* |
2.8 |
16.7* |
16.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
3.0* |
91.0* |
3.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
96.6* |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 207 |
| M |
2.2* |
50.5* |
35.3* |
1.1* |
0.4 |
1.5 |
0.4 |
-- |
-- |
0.7 |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
0.7 |
6.2 | 275 |
| |
| Basepair (1048:1066)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.2* |
5.6* |
25.9* |
41.3* |
4.7 |
3.7 |
1.0 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
2.5 | 864 |
| 3 |
16.6* |
6.6* |
21.3* |
45.5* |
2.0 |
5.5 |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 488 |
| B |
32.1* |
8.2* |
32.9* |
16.0* |
-- |
6.6 |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 243 |
| A |
8.3 |
11.1 |
8.3 |
22.2 |
27.8* |
19.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 | 36 |
| C |
29.0* |
3.0* |
20.0* |
34.0* |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
12.0 |
-- | 100 |
| E |
0.5* |
3.8* |
10.0* |
83.3* |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 209 |
| M |
1.4* |
4.7* |
36.2* |
36.6* |
10.5 |
1.8 |
0.7 |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
6.2 | 276 |
| |
| Basepair (1049:1065)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.4 |
5.3* |
6.2 |
27.2 |
30.2* |
1.9 |
0.2* |
0.9 |
-- |
0.6 |
5.9 |
0.3 |
-- |
-- |
14.0* |
0.7 |
2.1 | 860 |
| 3 |
6.4 |
6.6* |
1.2 |
5.6 |
40.3* |
2.7 |
0.2* |
0.6 |
-- |
0.4 |
10.3 |
0.6 |
-- |
-- |
24.6* |
-- |
0.4 | 484 |
| B |
3.7 |
3.3 |
0.8 |
7.0 |
80.2* |
4.1* |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
8.3* |
66.7* |
2.8* |
8.3* |
-- |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
1.0 |
5.0* |
5.0* |
25.0 |
58.0* |
3.0 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- | 100 |
| E |
9.3 |
-- |
1.5 |
3.4* |
0.5 |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
1.0* |
23.4 |
1.5 |
-- |
-- |
57.6* |
-- |
1.0 | 205 |
| M |
2.2* |
3.3* |
15.2* |
65.9* |
2.5 |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
5.8 | 276 |
| |
| Basepair (1050:1064)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
26.6* |
42.9* |
20.5* |
2.6 |
1.5 |
-- |
0.1 |
-- |
0.7 |
0.1 |
-- |
0.6 |
0.3 |
0.1 |
1.3 |
2.1 | 860 |
| 3 |
0.2 |
44.2* |
46.5* |
1.9 |
2.1* |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
0.8 |
0.6 |
-- |
-- |
0.4 | 484 |
| B |
-- |
75.7* |
20.2* |
0.4* |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
2.8 |
22.2* |
13.9* |
16.7 |
25.0* |
13.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
1.0 |
6.0* |
77.0* |
3.0 |
11.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
11.2* |
82.9* |
1.0* |
0.5 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
1.5 |
-- |
-- |
1.0 | 205 |
| M |
1.1* |
3.3* |
24.3* |
59.4* |
0.4 |
0.7 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
3.3 |
5.8 | 276 |
| |
| Basepair (1051:1063)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
47.2* |
5.8* |
23.3* |
16.9* |
0.3 |
1.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.7 |
1.0 |
-- |
0.7 |
2.4 | 863 |
| 3 |
50.5* |
7.8* |
36.8* |
1.0* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.8 |
-- |
0.6 |
0.8 | 487 |
| B |
98.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 244 |
| A |
16.7* |
72.2* |
-- |
11.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
80.0* |
8.0* |
8.0* |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.5* |
5.8* |
86.0* |
0.5* |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
1.4 |
2.0 | 207 |
| M |
29.3* |
1.4* |
5.1* |
49.6* |
1.1 |
2.2 |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 |
1.8 |
-- |
1.1 |
6.2 | 276 |
| |
| Basepair (1052:1062)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
36.5* |
3.6 |
2.0 |
9.1* |
15.0 |
20.6* |
-- |
10.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
2.1 | 864 |
| 3 |
27.9* |
3.7 |
1.4 |
1.2* |
12.5 |
36.3* |
-- |
16.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 | 488 |
| B |
51.2* |
-- |
-- |
0.8* |
15.2 |
-- |
-- |
32.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- | 244 |
| A |
22.2 |
11.1* |
-- |
-- |
63.9* |
-- |
-- |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
20.0 |
4.0* |
2.0* |
5.0 |
66.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
1.9* |
6.7 |
3.4 |
1.9* |
0.5 |
84.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 208 |
| M |
57.6* |
3.3* |
2.9* |
24.6* |
1.1 |
0.4 |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
5.8 | 276 |
| |
| Basepair (1053:1061)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.1 |
3.1* |
20.7* |
12.3 |
48.1* |
-- |
-- |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 864 |
| 3 |
4.7 |
5.1* |
36.3* |
2.3 |
51.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 488 |
| B |
0.8 |
2.1* |
-- |
3.7 |
93.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
52.8* |
-- |
-- |
5.6* |
41.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
2.0* |
-- |
2.0 |
96.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
1.0 |
9.6* |
84.2* |
-- |
3.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 209 |
| M |
23.2* |
-- |
0.7* |
33.7* |
25.7 |
-- |
-- |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.3 | 276 |
| |
| Basepair (1054:1060)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
65.8* |
6.4 |
10.8 |
0.9* |
0.1 |
12.4* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
3.0 | 865 |
| 3 |
56.9* |
4.7 |
16.6 |
1.0* |
0.2 |
19.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.6 | 489 |
| B |
20.9* |
4.9 |
31.6 |
2.0* |
0.4 |
39.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- | 244 |
| A |
63.9* |
30.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.6 | 36 |
| C |
88.0* |
5.0* |
3.0* |
3.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
97.1* |
-- |
1.9* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 209 |
| M |
73.6* |
9.8* |
3.3* |
-- |
-- |
3.3 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
8.3 | 276 |
| |
| Basepair (1055:1058)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.1 |
0.1* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
97.3* |
0.1 |
-- |
-- |
2.0 | 863 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 487 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 208 |
| M |
-- |
-- |
0.4 |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.1* |
0.4 |
-- |
-- |
5.8 | 276 |
| |
| Basepair (1058:2491)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.1* |
1.0 |
65.5* |
30.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
2.1 | 774 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
91.9 |
7.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 405 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
11.1 |
88.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 99 |
| E |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 133 |
| M |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
0.4 |
3.0 |
13.3 |
75.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
5.9 | 270 |
| |
| Basepair (1063:2301)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.5 |
0.4 |
7.8 |
1.1 |
0.6 |
1.1 |
15.7 |
2.9* |
-- |
48.1* |
0.9 |
0.8 |
7.4 |
0.3* |
4.5 |
5.8* |
2.0 | 794 |
| 3 |
0.9 |
0.2 |
1.2 |
0.7 |
-- |
-- |
25.1 |
5.0* |
-- |
56.2* |
-- |
-- |
9.7 |
0.5* |
0.5 |
-- |
-- | 422 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
-- |
2.8* |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.9 |
-- |
-- |
72.2* |
-- |
2.8* |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
6.1 |
2.0* |
-- |
79.8* |
-- |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
1.0* |
-- | 99 |
| E |
2.7* |
-- |
1.3 |
2.0 |
-- |
-- |
67.3* |
14.0 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
10.0 |
1.3 |
0.7 |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
0.7 |
19.4 |
2.2 |
1.8 |
3.3 |
4.8 |
-- |
-- |
24.2* |
2.6 |
2.2 |
3.7 |
-- |
12.5 |
16.5* |
6.3 | 273 |
| |
| Basepair (1072:1088)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3 |
0.1* |
6.4 |
2.1* |
0.2 |
0.2 |
24.5 |
1.3 |
1.0 |
2.1 |
0.1 |
1.4 |
33.1* |
-- |
13.9* |
3.0 |
10.1 | 864 |
| 3 |
0.4 |
-- |
10.5 |
1.2* |
-- |
-- |
22.7 |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
35.0* |
-- |
24.6* |
4.7 |
0.2 | 488 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
42.4 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
56.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
22.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
77.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
1.0 |
-- |
24.4 |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9* |
-- |
56.9* |
11.0 |
0.5 | 209 |
| M |
0.4* |
0.4 |
1.4 |
4.3 |
0.7 |
0.7* |
31.5* |
3.6 |
3.3 |
5.8 |
0.4 |
4.3* |
10.5 |
-- |
-- |
1.1 |
31.5 | 276 |
| |
| Basepair (1073:1086)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.4 |
0.3 |
0.3 |
15.3 |
0.9 |
0.1 |
46.4* |
2.9 |
2.2 |
0.6 |
1.0* |
1.5 |
14.9 |
4.2* |
0.2 |
1.9* |
4.7 | 864 |
| 3 |
3.9 |
-- |
-- |
7.8 |
0.6 |
-- |
52.3* |
0.2 |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
26.2 |
7.4* |
-- |
-- |
0.2 | 488 |
| B |
-- |
-- |
-- |
6.2 |
-- |
-- |
91.7 |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
88.9 |
2.8 |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
92.0 |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
9.0 |
-- |
-- |
11.0* |
1.4 |
-- |
1.0 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
59.5* |
17.1 |
-- |
-- |
0.5 | 210 |
| M |
0.7 |
1.1 |
1.1* |
33.7* |
1.8 |
0.4 |
19.6 |
8.7 |
1.8 |
1.8 |
3.3* |
4.7 |
0.4 |
-- |
0.7 |
5.8 |
14.6 | 276 |
| |
| Basepair (1074:1085)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
48.6* |
18.6* |
3.2* |
21.8* |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
3.8 | 862 |
| 3 |
55.8* |
31.5* |
3.9* |
8.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 486 |
| B |
98.8* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
91.7* |
5.6* |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
0.5* |
70.8* |
8.6* |
19.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 209 |
| M |
17.4* |
2.5* |
3.3* |
53.6* |
-- |
-- |
0.7 |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
5.1 |
11.6 | 276 |
| |
| Basepair (1074:1259)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
0.4* |
4.4 |
0.7* |
0.2 |
-- |
19.9 |
0.6 |
0.5 |
18.5 |
0.1 |
-- |
49.1* |
-- |
-- |
-- |
5.6 | 848 |
| 3 |
-- |
0.6* |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
7.4 |
0.2* |
0.2 |
29.7 |
0.2 |
-- |
57.4* |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 472 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.6 |
-- |
-- |
91.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
1.5 |
9.2 |
-- |
-- |
-- |
17.4 |
0.5 |
0.5* |
69.2* |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 195 |
| M |
0.4 |
-- |
6.5 |
2.2 |
0.7* |
-- |
48.6* |
1.4 |
1.1 |
6.2 |
-- |
-- |
16.3 |
-- |
-- |
-- |
16.7 | 276 |
| |
| Basepair (1075:1084)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
92.4* |
0.1* |
0.2* |
2.1* |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
4.3 | 865 |
| 3 |
98.2* |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 489 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 244 |
| A |
91.7* |
-- |
-- |
8.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 209 |
| M |
79.3* |
0.4* |
0.7* |
5.4* |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
11.6 | 276 |
| |
| Basepair (1075:1098)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.8 |
-- |
-- |
0.5* |
3.0 |
-- |
1.7 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
84.4* |
0.8 |
-- |
0.1 |
4.4 | 863 |
| 3 |
8.0 |
-- |
-- |
-- |
4.3 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.0 |
1.2 |
-- |
-- |
0.8 | 487 |
| B |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
18.3 |
-- |
-- |
-- |
10.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
67.3 |
2.4 |
-- |
-- |
2.0 | 208 |
| M |
0.7 |
-- |
-- |
1.4* |
1.8 |
-- |
4.3 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
77.5* |
0.4 |
-- |
0.4 |
12.7 | 276 |
| |
| Basepair (1076:1083)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
90.0* |
-- |
0.7* |
3.0* |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.9 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.2 |
4.2 | 866 |
| 3 |
98.2* |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 490 |
| B |
98.0* |
-- |
-- |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 244 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 210 |
| M |
71.7* |
-- |
2.2* |
8.3* |
-- |
0.4 |
0.4 |
2.9 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.7 |
12.0 | 276 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)