Haloarcula marismortui 23S rRNA Comparative/Crystal Structure Basepair Frequencies (24 of 60)
| Basepair (1089:1267)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
21.8* |
32.5* |
12.9* |
5.2* |
0.7 |
9.7 |
3.8 |
0.2 |
0.2 |
6.6 |
0.6 |
0.7 |
0.5 |
-- |
0.5 |
0.1 |
4.1 | 847 |
| 3 |
38.4* |
45.2* |
0.6* |
3.4* |
1.3 |
10.0 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 471 |
| B |
-- |
76.3* |
1.2* |
0.4 |
2.5* |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
19.4* |
80.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
1.0* |
24.0* |
44.0* |
-- |
-- |
31.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
89.2* |
0.5* |
-- |
7.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 194 |
| M |
1.1* |
13.8* |
22.5* |
10.1* |
-- |
1.4 |
11.6 |
0.7 |
0.4 |
20.3 |
1.8 |
2.2 |
0.7 |
-- |
1.4 |
0.4 |
11.5 | 276 |
| |
| Basepair (1090:1266)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.0* |
59.8* |
18.6* |
9.8* |
0.1 |
0.7 |
1.2 |
0.5 |
0.1 |
0.4 |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
1.2 |
3.9 | 846 |
| 3 |
2.3* |
79.8* |
13.2* |
2.1* |
0.2 |
1.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 | 470 |
| B |
-- |
95.4* |
4.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 240 |
| A |
2.8* |
61.1* |
25.0* |
8.3* |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
97.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
5.2* |
64.4* |
21.6* |
3.1* |
0.5 |
2.6 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 | 194 |
| M |
2.2* |
12.3* |
33.7* |
26.4* |
-- |
-- |
3.6 |
1.4 |
-- |
1.1 |
3.3 |
0.4 |
-- |
-- |
0.7 |
3.3 |
11.5 | 276 |
| |
| Basepair (1091:1265)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
33.3* |
10.8* |
5.9* |
40.9* |
0.2 |
2.4 |
0.7 |
0.9 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
4.0 | 848 |
| 3 |
43.0* |
18.6* |
7.0* |
25.4* |
0.4 |
4.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 | 472 |
| B |
59.8* |
2.5* |
4.6* |
33.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
47.2* |
13.9* |
27.8* |
2.8* |
-- |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
21.5* |
39.5* |
6.2* |
20.0* |
1.0 |
8.7 |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 | 195 |
| M |
28.6* |
1.4* |
6.2* |
46.0* |
-- |
-- |
1.1 |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
1.1 |
12.0 | 276 |
| |
| Basepair (1092:1264)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
31.7* |
32.5* |
11.3* |
11.8* |
1.8 |
2.9 |
1.1 |
1.1 |
0.5 |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
4.0 | 848 |
| 3 |
24.6* |
38.8* |
14.2* |
15.7* |
3.2 |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.8 | 472 |
| B |
1.7* |
72.2* |
14.9* |
7.9* |
-- |
3.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
66.7* |
-- |
2.8* |
13.9* |
11.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
2.8 |
-- | 36 |
| C |
-- |
84.0* |
9.0* |
-- |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
45.1* |
5.1* |
15.4* |
25.1* |
5.6 |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 195 |
| M |
55.4* |
3.3* |
7.2* |
9.4* |
-- |
2.5 |
3.3 |
3.3 |
1.4 |
1.1 |
0.4 |
0.7 |
0.7 |
-- |
0.4 |
-- |
10.8 | 276 |
| |
| Basepair (1093:1263)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
45.0* |
2.2* |
3.3* |
42.9* |
0.8 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.4 |
4.3 | 847 |
| 3 |
41.6* |
1.5* |
4.0* |
51.4* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.6 | 471 |
| B |
15.7* |
-- |
0.4* |
82.2* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
94.4* |
-- |
-- |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
2.0* |
-- |
-- |
94.0* |
1.0 |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
64.2* |
3.6* |
9.3* |
21.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.0 | 193 |
| M |
66.3* |
4.3* |
3.3* |
9.8* |
1.1 |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
1.1 |
11.6 | 276 |
| |
| Basepair (1094:1262)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
75.4* |
0.2* |
3.3* |
15.4* |
0.1 |
0.2 |
0.5 |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
4.0 | 849 |
| 3 |
88.8* |
0.2* |
3.4* |
6.3* |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 | 473 |
| B |
85.5* |
-- |
2.5* |
10.7* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
92.0* |
1.0* |
2.0* |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
90.8* |
0.5* |
5.1* |
2.1* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 195 |
| M |
46.4* |
-- |
3.6* |
35.1* |
-- |
-- |
1.4 |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
11.5 | 276 |
| |
| Basepair (1095:1261)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.2* |
36.0* |
30.7* |
11.8* |
-- |
1.1 |
1.4 |
0.6 |
1.2 |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.7 |
4.5 | 848 |
| 3 |
0.2* |
43.0* |
49.2* |
4.0* |
-- |
0.6 |
1.9 |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 472 |
| B |
-- |
81.8* |
13.2* |
3.3* |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
85.0* |
5.0* |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
0.5* |
3.1* |
84.0* |
5.7* |
-- |
-- |
4.6 |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 194 |
| M |
34.1* |
6.2* |
8.3* |
29.3* |
-- |
0.4 |
1.1 |
1.8 |
1.4 |
-- |
1.1 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
1.8 |
13.4 | 276 |
| |
| Basepair (1096:1259)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2* |
90.2* |
0.7* |
-- |
0.5 |
0.8 |
0.1 |
-- |
0.7 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
0.9 |
4.6 | 848 |
| 3 |
-- |
0.4* |
98.1* |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.2 | 472 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
1.0* |
95.4* |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.0 |
-- |
0.5 | 194 |
| M |
-- |
-- |
73.2* |
2.2* |
-- |
1.1 |
2.2 |
0.4 |
-- |
1.8 |
0.7* |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.7 |
2.9 |
14.1 | 276 |
| |
| Basepair (1098:1258)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7 |
0.1 |
0.2 |
10.6 |
-- |
-- |
3.3 |
10.3 |
61.9* |
0.1 |
0.8 |
3.9* |
-- |
0.1 |
1.3* |
0.1 |
6.4 | 847 |
| 3 |
1.1 |
0.2 |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
10.0 |
70.3* |
-- |
1.5 |
7.0* |
-- |
0.2 |
2.3* |
-- |
0.4 | 471 |
| B |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
2.6 |
-- |
-- |
17.1 |
-- |
-- |
-- |
23.8 |
29.0* |
-- |
3.6 |
17.1* |
-- |
-- |
5.7* |
-- |
1.0 | 193 |
| M |
0.4* |
-- |
0.7* |
20.7 |
-- |
-- |
10.1 |
14.5 |
33.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
19.2 | 276 |
| |
| Basepair (1099:1257)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
72.1* |
0.2* |
2.4* |
13.7* |
0.7 |
0.1 |
0.6 |
1.1 |
-- |
-- |
0.6 |
0.5 |
-- |
-- |
0.6 |
0.5 |
7.2 | 848 |
| 3 |
94.1* |
-- |
0.2* |
4.2* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 472 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
97.2* |
-- |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
86.6* |
-- |
-- |
10.3* |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.5 | 194 |
| M |
24.3* |
0.7* |
6.9* |
34.8* |
1.1 |
0.4 |
1.8 |
3.3 |
-- |
-- |
1.4 |
1.4 |
-- |
-- |
1.8 |
1.4 |
20.5 | 276 |
| |
| Basepair (1100:1256)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
78.2* |
0.7* |
1.8* |
1.8* |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.5 |
-- |
0.4 |
-- |
15.4 | 848 |
| 3 |
96.8* |
0.2* |
1.1* |
0.4* |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 473 |
| B |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
97.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
93.3* |
0.5* |
2.6* |
1.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 195 |
| M |
39.3* |
1.8* |
3.6* |
3.6* |
0.4 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 |
0.4 |
0.7 |
-- |
1.1 |
-- |
46.9 | 275 |
| |
| Basepair (1101:1255)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
28.4* |
43.0* |
8.4* |
0.1 |
0.6 |
0.6 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
1.2 |
0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
16.2 | 848 |
| 3 |
0.2* |
29.9* |
66.9* |
1.3* |
0.2 |
0.6 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 472 |
| B |
0.4* |
20.7* |
77.7* |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
55.6* |
41.7* |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
96.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
36.6* |
58.2* |
2.6* |
-- |
1.0 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 194 |
| M |
-- |
1.4 |
16.7* |
23.6* |
-- |
0.7 |
1.4 |
1.1 |
0.4 |
0.4 |
3.3* |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
48.9 | 276 |
| |
| Basepair (1102:1241)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
22.2* |
47.8* |
2.2* |
0.2* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
27.3 | 848 |
| 3 |
38.9* |
59.2* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.6 | 473 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
96.0* |
2.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
93.8* |
1.5* |
2.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 |
1.5 | 195 |
| M |
1.5* |
10.5* |
4.7* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.0 | 275 |
| |
| Basepair (1103:1240)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
68.1* |
3.7* |
0.1* |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.1 | 849 |
| 3 |
-- |
94.1* |
4.2* |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 473 |
| B |
-- |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
97.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
88.2* |
10.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 195 |
| M |
-- |
13.0* |
3.6* |
0.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.5 | 276 |
| |
| Basepair (1104:1239)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
46.2* |
0.4 |
0.4 |
-- |
1.5 |
0.6* |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
50.1 | 848 |
| 3 |
-- |
57.8 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
41.7 | 472 |
| B |
-- |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 242 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 35 |
| C |
-- |
95.0* |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.9 | 195 |
| M |
-- |
8.7* |
1.1* |
1.1* |
-- |
2.9 |
1.1 |
0.4 |
0.4 |
1.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
82.6 | 276 |
| |
| Basepair (1105:1106)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 |
2.9 |
24.9 |
7.0 |
-- |
0.1 |
27.8* |
1.4 |
0.5 |
13.5 |
1.0* |
1.0 |
2.8 |
4.3* |
0.9 |
1.3* |
10.4 | 862 |
| 3 |
-- |
4.9 |
22.0 |
-- |
-- |
-- |
37.7* |
-- |
0.2 |
21.2 |
0.6* |
-- |
4.5 |
7.6* |
0.2 |
0.2* |
0.8 | 486 |
| B |
-- |
-- |
24.1 |
-- |
-- |
-- |
49.0 |
-- |
-- |
22.0 |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
47.2 |
-- |
-- |
-- |
30.6 |
-- |
-- |
19.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
71.0* |
-- |
-- |
1.0 |
22.0 |
-- |
1.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
2.0 |
1.0 | 100 |
| E |
-- |
11.5 |
15.3 |
-- |
-- |
-- |
26.3* |
-- |
0.5 |
20.6 |
1.4* |
-- |
4.8 |
17.2* |
-- |
0.5* |
2.0 | 209 |
| M |
0.4 |
0.4 |
13.4* |
21.7* |
-- |
-- |
12.7 |
4.3 |
0.7 |
4.3 |
2.2* |
3.3 |
0.7 |
-- |
2.2 |
2.9 |
30.8 | 276 |
| |
Last generated : Mon Jul 1 2002 (8 : 31)